Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab3aP63011 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab3aP63011 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3aP63011 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3aP63011 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab3aP63011 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3aP63011 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3aP63011 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3aP63011 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3aP63011 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3aP63011 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3aP63011 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3aP63011 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3aP63011 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab3aP63011 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3aP63011 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3aP63011 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3aP63011 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3aP63011 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab3aP63011 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab3aP63011 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab3aP63011 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab3aP63011 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab3aP63011 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab3aP63011 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab3aP63011 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3aP63011 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3aP63011 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab3aP63011 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3aP63011 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3aP63011 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3aP63011 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3aP63011 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3aP63011 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3aP63011 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3aP63011 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3aP63011 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3aP63011 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3aP63011 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3aP63011 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3aP63011 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3aP63011 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3aP63011 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3aP63011 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab3aP63011 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab3aP63011 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3aP63011 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3aP63011 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3aP63011 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3aP63011 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab3aP63011 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab3aP63011 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab3aP63011 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab3aP63011 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab3aP63011 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab3aP63011 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab3aP63011 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab3aP63011 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab3aP63011 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3aP63011 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3aP63011 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3aP63011 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3aP63011 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3aP63011 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3aP63011 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3aP63011 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3aP63011 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3aP63011 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3aP63011 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3aP63011 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3aP63011 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3aP63011 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3aP63011 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3aP63011 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3aP63011 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3aP63011 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3aP63011 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab3aP63011 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3aP63011 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3aP63011 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3aP63011 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3aP63011 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3aP63011 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3aP63011 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3aP63011 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3aP63011 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3aP63011 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3aP63011 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab3aP63011 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3aP63011 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3aP63011 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3aP63011 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3aP63011 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3aP63011 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3aP63011 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3aP63011 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3aP63011 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3aP63011 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3aP63011 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3aP63011 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms