Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,41■■■□□ 2,46
Rab3aP63011 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Rab3aP63011 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Rab3aP63011 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Rab3aP63011 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Rab3aP63011 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Rab3aP63011 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Rab3aP63011 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Rab3aP63011 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Rab3aP63011 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,31■■□□□ 1,96
Rab3aP63011 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Rab3aP63011 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Rab3aP63011 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Rab3aP63011 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Rab3aP63011 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
Rab3aP63011 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Rab3aP63011 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Rab3aP63011 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Rab3aP63011 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Rab3aP63011 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Rab3aP63011 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Rab3aP63011 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Rab3aP63011 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Rab3aP63011 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Rab3aP63011 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Rab3aP63011 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Rab3aP63011 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rab3aP63011 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Rab3aP63011 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26■■□□□ 1,75
Rab3aP63011 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Rab3aP63011 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Rab3aP63011 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Rab3aP63011 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Rab3aP63011 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Rab3aP63011 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Rab3aP63011 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Rab3aP63011 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Rab3aP63011 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rab3aP63011 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rab3aP63011 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,53■■□□□ 1,68
Rab3aP63011 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rab3aP63011 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Rab3aP63011 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rab3aP63011 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Rab3aP63011 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Rab3aP63011 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rab3aP63011 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Rab3aP63011 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Rab3aP63011 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Rab3aP63011 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Rab3aP63011 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,09■■□□□ 1,61
Rab3aP63011 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Rab3aP63011 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Rab3aP63011 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Rab3aP63011 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Rab3aP63011 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Rab3aP63011 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Rab3aP63011 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Rab3aP63011 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
Rab3aP63011 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Rab3aP63011 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Rab3aP63011 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Rab3aP63011 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Rab3aP63011 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Rab3aP63011 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Rab3aP63011 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Rab3aP63011 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Rab3aP63011 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Rab3aP63011 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Rab3aP63011 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Rab3aP63011 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Rab3aP63011 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Rab3aP63011 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Rab3aP63011 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Rab3aP63011 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Rab3aP63011 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Rab3aP63011 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,21■■□□□ 1,47
Rab3aP63011 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Rab3aP63011 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,21■■□□□ 1,47
Rab3aP63011 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Rab3aP63011 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Rab3aP63011 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Rab3aP63011 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Rab3aP63011 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Rab3aP63011 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Rab3aP63011 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Rab3aP63011 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Rab3aP63011 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Rab3aP63011 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Rab3aP63011 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,05■■□□□ 1,44
Rab3aP63011 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Rab3aP63011 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Rab3aP63011 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Rab3aP63011 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Rab3aP63011 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Rab3aP63011 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Rab3aP63011 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Rab3aP63011 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,43
Rab3aP63011 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Rab3aP63011 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
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