Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Rab3aP63011 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rab3aP63011 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rab3aP63011 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rab3aP63011 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab3aP63011 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab3aP63011 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab3aP63011 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rab3aP63011 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rab3aP63011 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab3aP63011 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab3aP63011 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rab3aP63011 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rab3aP63011 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab3aP63011 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab3aP63011 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab3aP63011 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rab3aP63011 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab3aP63011 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rab3aP63011 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab3aP63011 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab3aP63011 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rab3aP63011 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rab3aP63011 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rab3aP63011 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rab3aP63011 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rab3aP63011 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab3aP63011 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab3aP63011 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rab3aP63011 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rab3aP63011 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab3aP63011 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab3aP63011 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab3aP63011 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab3aP63011 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3aP63011 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab3aP63011 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rab3aP63011 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab3aP63011 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rab3aP63011 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab3aP63011 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab3aP63011 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab3aP63011 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab3aP63011 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab3aP63011 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab3aP63011 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab3aP63011 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab3aP63011 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab3aP63011 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3aP63011 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3aP63011 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3aP63011 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab3aP63011 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3aP63011 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab3aP63011 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rab3aP63011 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab3aP63011 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab3aP63011 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3aP63011 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab3aP63011 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab3aP63011 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab3aP63011 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab3aP63011 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab3aP63011 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab3aP63011 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab3aP63011 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab3aP63011 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab3aP63011 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab3aP63011 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab3aP63011 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab3aP63011 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3aP63011 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3aP63011 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3aP63011 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3aP63011 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3aP63011 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3aP63011 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3aP63011 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3aP63011 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3aP63011 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab3aP63011 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab3aP63011 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab3aP63011 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab3aP63011 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3aP63011 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3aP63011 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3aP63011 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3aP63011 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab3aP63011 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab3aP63011 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab3aP63011 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3aP63011 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3aP63011 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3aP63011 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3aP63011 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab3aP63011 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab3aP63011 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab3aP63011 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rab3aP63011 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab3aP63011 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms