Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2kP61087 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ube2kP61087 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2kP61087 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2kP61087 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2kP61087 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2kP61087 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube2kP61087 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2kP61087 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2kP61087 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2kP61087 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2kP61087 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2kP61087 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2kP61087 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2kP61087 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2kP61087 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2kP61087 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2kP61087 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2kP61087 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2kP61087 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2kP61087 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2kP61087 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ube2kP61087 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2kP61087 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2kP61087 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2kP61087 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2kP61087 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2kP61087 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2kP61087 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2kP61087 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2kP61087 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2kP61087 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2kP61087 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2kP61087 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2kP61087 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2kP61087 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2kP61087 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2kP61087 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2kP61087 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2kP61087 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2kP61087 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2kP61087 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2kP61087 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2kP61087 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2kP61087 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2kP61087 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2kP61087 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2kP61087 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2kP61087 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2kP61087 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2kP61087 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2kP61087 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2kP61087 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2kP61087 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2kP61087 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube2kP61087 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube2kP61087 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube2kP61087 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2kP61087 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2kP61087 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2kP61087 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2kP61087 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2kP61087 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2kP61087 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2kP61087 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2kP61087 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2kP61087 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2kP61087 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2kP61087 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2kP61087 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2kP61087 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2kP61087 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2kP61087 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2kP61087 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2kP61087 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2kP61087 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2kP61087 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2kP61087 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2kP61087 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2kP61087 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2kP61087 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2kP61087 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2kP61087 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2kP61087 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2kP61087 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2kP61087 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2kP61087 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2kP61087 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2kP61087 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2kP61087 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2kP61087 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube2kP61087 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube2kP61087 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ube2kP61087 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ube2kP61087 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube2kP61087 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ube2kP61087 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ube2kP61087 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ube2kP61087 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ube2kP61087 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms