Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ppfia3P60469 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ppfia3P60469 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ppfia3P60469 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ppfia3P60469 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ppfia3P60469 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ppfia3P60469 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ppfia3P60469 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ppfia3P60469 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ppfia3P60469 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ppfia3P60469 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppfia3P60469 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ppfia3P60469 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ppfia3P60469 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ppfia3P60469 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ppfia3P60469 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ppfia3P60469 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ppfia3P60469 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ppfia3P60469 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ppfia3P60469 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ppfia3P60469 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ppfia3P60469 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ppfia3P60469 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ppfia3P60469 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ppfia3P60469 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ppfia3P60469 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ppfia3P60469 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ppfia3P60469 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ppfia3P60469 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ppfia3P60469 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ppfia3P60469 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ppfia3P60469 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppfia3P60469 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ppfia3P60469 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ppfia3P60469 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppfia3P60469 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppfia3P60469 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppfia3P60469 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppfia3P60469 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppfia3P60469 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppfia3P60469 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ppfia3P60469 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ppfia3P60469 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ppfia3P60469 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ppfia3P60469 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ppfia3P60469 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ppfia3P60469 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ppfia3P60469 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppfia3P60469 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppfia3P60469 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ppfia3P60469 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Ppfia3P60469 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ppfia3P60469 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ppfia3P60469 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ppfia3P60469 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppfia3P60469 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppfia3P60469 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppfia3P60469 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Ppfia3P60469 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ppfia3P60469 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ppfia3P60469 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ppfia3P60469 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppfia3P60469 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppfia3P60469 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ppfia3P60469 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppfia3P60469 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppfia3P60469 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ppfia3P60469 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ppfia3P60469 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ppfia3P60469 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ppfia3P60469 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ppfia3P60469 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ppfia3P60469 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ppfia3P60469 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ppfia3P60469 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ppfia3P60469 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppfia3P60469 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppfia3P60469 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppfia3P60469 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppfia3P60469 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppfia3P60469 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppfia3P60469 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ppfia3P60469 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ppfia3P60469 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ppfia3P60469 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppfia3P60469 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppfia3P60469 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppfia3P60469 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ppfia3P60469 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ppfia3P60469 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ppfia3P60469 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ppfia3P60469 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ppfia3P60469 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ppfia3P60469 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ppfia3P60469 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ppfia3P60469 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ppfia3P60469 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ppfia3P60469 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ppfia3P60469 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ppfia3P60469 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms