Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdo1P60334 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdo1P60334 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdo1P60334 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdo1P60334 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdo1P60334 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdo1P60334 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdo1P60334 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdo1P60334 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdo1P60334 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdo1P60334 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdo1P60334 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdo1P60334 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdo1P60334 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdo1P60334 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdo1P60334 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdo1P60334 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdo1P60334 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdo1P60334 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdo1P60334 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdo1P60334 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdo1P60334 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdo1P60334 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdo1P60334 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdo1P60334 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdo1P60334 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdo1P60334 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdo1P60334 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdo1P60334 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdo1P60334 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdo1P60334 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdo1P60334 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdo1P60334 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdo1P60334 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdo1P60334 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdo1P60334 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdo1P60334 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdo1P60334 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdo1P60334 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdo1P60334 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdo1P60334 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdo1P60334 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdo1P60334 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdo1P60334 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdo1P60334 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdo1P60334 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdo1P60334 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdo1P60334 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdo1P60334 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdo1P60334 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdo1P60334 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdo1P60334 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdo1P60334 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdo1P60334 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdo1P60334 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdo1P60334 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdo1P60334 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdo1P60334 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdo1P60334 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdo1P60334 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cdo1P60334 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdo1P60334 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdo1P60334 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdo1P60334 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdo1P60334 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdo1P60334 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdo1P60334 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdo1P60334 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdo1P60334 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdo1P60334 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdo1P60334 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdo1P60334 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdo1P60334 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdo1P60334 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdo1P60334 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdo1P60334 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdo1P60334 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdo1P60334 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdo1P60334 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdo1P60334 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdo1P60334 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdo1P60334 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdo1P60334 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdo1P60334 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdo1P60334 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdo1P60334 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdo1P60334 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdo1P60334 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdo1P60334 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdo1P60334 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdo1P60334 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdo1P60334 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdo1P60334 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdo1P60334 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdo1P60334 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdo1P60334 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdo1P60334 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdo1P60334 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdo1P60334 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdo1P60334 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.9 ms