Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Tpm1P58771 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Tpm1P58771 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Tpm1P58771 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Tpm1P58771 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Tpm1P58771 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Tpm1P58771 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Tpm1P58771 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Tpm1P58771 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Tpm1P58771 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Tpm1P58771 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Tpm1P58771 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tpm1P58771 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tpm1P58771 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Tpm1P58771 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Tpm1P58771 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Tpm1P58771 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Tpm1P58771 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Tpm1P58771 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Tpm1P58771 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Tpm1P58771 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Tpm1P58771 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Tpm1P58771 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Tpm1P58771 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Tpm1P58771 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tpm1P58771 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tpm1P58771 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Tpm1P58771 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Tpm1P58771 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Tpm1P58771 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tpm1P58771 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Tpm1P58771 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Tpm1P58771 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Tpm1P58771 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Tpm1P58771 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Tpm1P58771 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Tpm1P58771 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Tpm1P58771 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Tpm1P58771 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Tpm1P58771 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Tpm1P58771 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Tpm1P58771 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Tpm1P58771 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Tpm1P58771 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Tpm1P58771 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tpm1P58771 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tpm1P58771 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Tpm1P58771 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Tpm1P58771 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Tpm1P58771 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Tpm1P58771 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Tpm1P58771 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Tpm1P58771 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Tpm1P58771 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Tpm1P58771 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Tpm1P58771 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Tpm1P58771 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Tpm1P58771 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Tpm1P58771 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Tpm1P58771 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Tpm1P58771 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Tpm1P58771 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Tpm1P58771 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Tpm1P58771 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Tpm1P58771 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Tpm1P58771 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Tpm1P58771 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,11
Tpm1P58771 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Tpm1P58771 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Tpm1P58771 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Tpm1P58771 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Tpm1P58771 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Tpm1P58771 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Tpm1P58771 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Tpm1P58771 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Tpm1P58771 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Tpm1P58771 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Tpm1P58771 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tpm1P58771 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Tpm1P58771 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Tpm1P58771 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Tpm1P58771 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Tpm1P58771 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tpm1P58771 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tpm1P58771 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tpm1P58771 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Tpm1P58771 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Tpm1P58771 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Tpm1P58771 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
Tpm1P58771 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Tpm1P58771 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Tpm1P58771 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Tpm1P58771 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Tpm1P58771 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Tpm1P58771 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2,07
Tpm1P58771 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Tpm1P58771 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Tpm1P58771 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Tpm1P58771 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Tpm1P58771 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms