Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Lim2P56563 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lim2P56563 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lim2P56563 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lim2P56563 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Lim2P56563 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lim2P56563 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lim2P56563 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lim2P56563 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lim2P56563 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lim2P56563 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lim2P56563 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lim2P56563 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lim2P56563 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lim2P56563 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lim2P56563 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lim2P56563 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lim2P56563 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lim2P56563 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Lim2P56563 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lim2P56563 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lim2P56563 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lim2P56563 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lim2P56563 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lim2P56563 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lim2P56563 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lim2P56563 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lim2P56563 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lim2P56563 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lim2P56563 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lim2P56563 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lim2P56563 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lim2P56563 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lim2P56563 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lim2P56563 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lim2P56563 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Lim2P56563 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lim2P56563 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lim2P56563 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lim2P56563 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lim2P56563 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lim2P56563 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lim2P56563 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lim2P56563 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lim2P56563 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lim2P56563 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lim2P56563 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lim2P56563 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lim2P56563 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lim2P56563 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lim2P56563 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lim2P56563 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lim2P56563 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Lim2P56563 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lim2P56563 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lim2P56563 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lim2P56563 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lim2P56563 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lim2P56563 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lim2P56563 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lim2P56563 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lim2P56563 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lim2P56563 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lim2P56563 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lim2P56563 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lim2P56563 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lim2P56563 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Lim2P56563 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lim2P56563 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lim2P56563 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lim2P56563 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Lim2P56563 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lim2P56563 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lim2P56563 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lim2P56563 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lim2P56563 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lim2P56563 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lim2P56563 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lim2P56563 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lim2P56563 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lim2P56563 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lim2P56563 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lim2P56563 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lim2P56563 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lim2P56563 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lim2P56563 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lim2P56563 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lim2P56563 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lim2P56563 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lim2P56563 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lim2P56563 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lim2P56563 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lim2P56563 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lim2P56563 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lim2P56563 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lim2P56563 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lim2P56563 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lim2P56563 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lim2P56563 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lim2P56563 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms