Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp5g3P56384 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp5g3P56384 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp5g3P56384 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp5g3P56384 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp5g3P56384 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp5g3P56384 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp5g3P56384 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp5g3P56384 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp5g3P56384 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp5g3P56384 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp5g3P56384 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp5g3P56384 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp5g3P56384 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp5g3P56384 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp5g3P56384 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp5g3P56384 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp5g3P56384 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp5g3P56384 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5g3P56384 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5g3P56384 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5g3P56384 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5g3P56384 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5g3P56384 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5g3P56384 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5g3P56384 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5g3P56384 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5g3P56384 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5g3P56384 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5g3P56384 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5g3P56384 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp5g3P56384 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp5g3P56384 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp5g3P56384 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp5g3P56384 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp5g3P56384 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp5g3P56384 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp5g3P56384 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp5g3P56384 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5g3P56384 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5g3P56384 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5g3P56384 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5g3P56384 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5g3P56384 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp5g3P56384 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp5g3P56384 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5g3P56384 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp5g3P56384 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp5g3P56384 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp5g3P56384 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5g3P56384 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5g3P56384 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5g3P56384 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5g3P56384 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5g3P56384 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5g3P56384 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5g3P56384 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp5g3P56384 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5g3P56384 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5g3P56384 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5g3P56384 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5g3P56384 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5g3P56384 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5g3P56384 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5g3P56384 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5g3P56384 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5g3P56384 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5g3P56384 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp5g3P56384 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms