Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pms2P54279 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pms2P54279 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pms2P54279 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pms2P54279 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pms2P54279 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pms2P54279 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pms2P54279 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pms2P54279 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pms2P54279 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pms2P54279 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pms2P54279 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pms2P54279 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pms2P54279 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pms2P54279 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Pms2P54279 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Pms2P54279 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pms2P54279 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pms2P54279 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pms2P54279 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Pms2P54279 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pms2P54279 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pms2P54279 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pms2P54279 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pms2P54279 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pms2P54279 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pms2P54279 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Pms2P54279 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pms2P54279 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pms2P54279 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pms2P54279 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pms2P54279 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pms2P54279 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pms2P54279 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pms2P54279 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pms2P54279 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pms2P54279 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pms2P54279 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pms2P54279 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pms2P54279 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pms2P54279 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pms2P54279 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pms2P54279 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pms2P54279 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pms2P54279 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pms2P54279 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Pms2P54279 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pms2P54279 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pms2P54279 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pms2P54279 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pms2P54279 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pms2P54279 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pms2P54279 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pms2P54279 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pms2P54279 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pms2P54279 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pms2P54279 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pms2P54279 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pms2P54279 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pms2P54279 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pms2P54279 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pms2P54279 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pms2P54279 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pms2P54279 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pms2P54279 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pms2P54279 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pms2P54279 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pms2P54279 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pms2P54279 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pms2P54279 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pms2P54279 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pms2P54279 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pms2P54279 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pms2P54279 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pms2P54279 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pms2P54279 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pms2P54279 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pms2P54279 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pms2P54279 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pms2P54279 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pms2P54279 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pms2P54279 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pms2P54279 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pms2P54279 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pms2P54279 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pms2P54279 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pms2P54279 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pms2P54279 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pms2P54279 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pms2P54279 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pms2P54279 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pms2P54279 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pms2P54279 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pms2P54279 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pms2P54279 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pms2P54279 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pms2P54279 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pms2P54279 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pms2P54279 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pms2P54279 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 351.7 ms