Protein–RNA interactions for Protein: P54070

KTR6, Mannosyltransferase KTR6, yeast

Predictions only

Length 446 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR6	P54070	YDR094W	YDR094W	336 nt		11.32	□□□□□ -0.6
KTR6	P54070	CRR1	YLR213C	1269 nt		11.32	□□□□□ -0.6
KTR6	P54070	YFL067W	YFL067W	528 nt		11.28	□□□□□ -0.6
KTR6	P54070	STB1	YNL309W	1263 nt		11.27	□□□□□ -0.61
KTR6	P54070	DDR2	YOL052C-A	186 nt		11.27	□□□□□ -0.61
KTR6	P54070	PAC11	YDR488C	1602 nt		11.27	□□□□□ -0.61
KTR6	P54070	PTK1	YKL198C	1989 nt		11.27	□□□□□ -0.61
KTR6	P54070	SPC25	YER018C	666 nt		11.26	□□□□□ -0.61
KTR6	P54070	YDR524C-B	YDR524C-B	201 nt		11.23	□□□□□ -0.61
KTR6	P54070	YDL086C-A	YDL086C-A	435 nt		11.22	□□□□□ -0.61
KTR6	P54070	SNG1	YGR197C	1644 nt		11.21	□□□□□ -0.61
KTR6	P54070	CCT4	YDL143W	1587 nt		11.2	□□□□□ -0.62
KTR6	P54070	MIC10	YCL057C-A	294 nt		11.2	□□□□□ -0.62
KTR6	P54070	GPI16	YHR188C	1833 nt		11.19	□□□□□ -0.62
KTR6	P54070	HEM12	YDR047W	1089 nt		11.19	□□□□□ -0.62
KTR6	P54070	ANP1	YEL036C	1503 nt		11.19	□□□□□ -0.62
KTR6	P54070	YFR018C	YFR018C	1092 nt		11.18	□□□□□ -0.62
KTR6	P54070	VPS60	YDR486C	690 nt		11.17	□□□□□ -0.62
KTR6	P54070	BDH1	YAL060W	1149 nt		11.17	□□□□□ -0.62
KTR6	P54070	FEN2	YCR028C	1539 nt		11.15	□□□□□ -0.62
KTR6	P54070	PRE6	YOL038W	765 nt		11.13	□□□□□ -0.63
KTR6	P54070	ALG3	YBL082C	1377 nt		11.13	□□□□□ -0.63
KTR6	P54070	YSP3	YOR003W	1437 nt		11.12	□□□□□ -0.63
KTR6	P54070	SWC5	YBR231C	912 nt		11.12	□□□□□ -0.63
KTR6	P54070	NVJ2	YPR091C	2313 nt		11.12	□□□□□ -0.63
KTR6	P54070	YLR415C	YLR415C	339 nt		11.11	□□□□□ -0.63
KTR6	P54070	YFL066C	YFL066C	1179 nt		11.08	□□□□□ -0.64
KTR6	P54070	PEX25	YPL112C	1185 nt		11.08	□□□□□ -0.64
KTR6	P54070	YHR056W-A	YHR056W-A	435 nt		11.07	□□□□□ -0.64
KTR6	P54070	YFL054C	YFL054C	1941 nt		11.07	□□□□□ -0.64
KTR6	P54070	PAU16	YKL224C	372 nt		11.06	□□□□□ -0.64
KTR6	P54070	YFL015W-A	YFL015W-A	318 nt		11.05	□□□□□ -0.64
KTR6	P54070	YIR016W	YIR016W	798 nt		11.05	□□□□□ -0.64
KTR6	P54070	YNL115C	YNL115C	1935 nt		11.04	□□□□□ -0.64
KTR6	P54070	RRT5	YFR032C	870 nt		11.04	□□□□□ -0.64
KTR6	P54070	RAX1	YOR301W	1308 nt		10.97	□□□□□ -0.65
KTR6	P54070	SPT8	YLR055C	1809 nt		10.97	□□□□□ -0.65
KTR6	P54070	BNA2	YJR078W	1362 nt		10.95	□□□□□ -0.66
KTR6	P54070	MIC12	YBR262C	321 nt		10.95	□□□□□ -0.66
KTR6	P54070	VPS75	YNL246W	795 nt		10.89	□□□□□ -0.67
KTR6	P54070	XDJ1	YLR090W	1380 nt		10.87	□□□□□ -0.67
KTR6	P54070	TIM17	YJL143W	477 nt		10.86	□□□□□ -0.67
KTR6	P54070	SHM2	YLR058C	1410 nt		10.85	□□□□□ -0.67
KTR6	P54070	SWE1	YJL187C	2460 nt		10.83	□□□□□ -0.68
KTR6	P54070	HHO1	YPL127C	777 nt		10.83	□□□□□ -0.68
KTR6	P54070	CCA1	YER168C	1641 nt		10.8	□□□□□ -0.68
KTR6	P54070	YGR201C	YGR201C	678 nt		10.8	□□□□□ -0.68
KTR6	P54070	MIR1	YJR077C	936 nt		10.8	□□□□□ -0.68
KTR6	P54070	GDH3	YAL062W	1374 nt		10.79	□□□□□ -0.68
KTR6	P54070	NAT4	YMR069W	858 nt		10.77	□□□□□ -0.69
KTR6	P54070	GLK1	YCL040W	1503 nt		10.76	□□□□□ -0.69
KTR6	P54070	NIT1	YIL164C	600 nt		10.76	□□□□□ -0.69
KTR6	P54070	AGP1	YCL025C	1902 nt		10.76	□□□□□ -0.69
KTR6	P54070	THI74	YDR438W	1113 nt		10.73	□□□□□ -0.69
KTR6	P54070	SGT2	YOR007C	1041 nt		10.73	□□□□□ -0.69
KTR6	P54070	PAU7	YAR020C	168 nt		10.72	□□□□□ -0.69
KTR6	P54070	AVT6	YER119C	1347 nt		10.71	□□□□□ -0.69
KTR6	P54070	MSF1	YPR047W	1410 nt		10.7	□□□□□ -0.7
KTR6	P54070	DUT1	YBR252W	444 nt		10.69	□□□□□ -0.7
KTR6	P54070	SHB17	YKR043C	816 nt		10.66	□□□□□ -0.7
KTR6	P54070	GOR1	YNL274C	1053 nt		10.66	□□□□□ -0.7
KTR6	P54070	DAT1	YML113W	747 nt		10.65	□□□□□ -0.7
KTR6	P54070	SBA1	YKL117W	651 nt		10.64	□□□□□ -0.71
KTR6	P54070	UBA4	YHR111W	1323 nt		10.62	□□□□□ -0.71
KTR6	P54070	YDR010C	YDR010C	333 nt		10.62	□□□□□ -0.71
KTR6	P54070	YJL225C	YJL225C	5277 nt		10.58	□□□□□ -0.72
KTR6	P54070	DUS1	YML080W	1272 nt		10.56	□□□□□ -0.72
KTR6	P54070	YCR102C	YCR102C	1107 nt		10.54	□□□□□ -0.72
KTR6	P54070	YGL034C	YGL034C	366 nt		10.54	□□□□□ -0.72
KTR6	P54070	YSR3	YKR053C	1215 nt		10.54	□□□□□ -0.72
KTR6	P54070	RET2	YFR051C	1641 nt		10.53	□□□□□ -0.72
KTR6	P54070	STR3	YGL184C	1398 nt		10.5	□□□□□ -0.73
KTR6	P54070	PHO89	YBR296C	1725 nt		10.5	□□□□□ -0.73
KTR6	P54070	YCL074W	YCL074W	927 nt		10.49	□□□□□ -0.73
KTR6	P54070	XYL2	YLR070C	1071 nt		10.49	□□□□□ -0.73
KTR6	P54070	RDN18-1	RDN18-1	1800 nt		10.49	□□□□□ -0.73
KTR6	P54070	RDN18-2	RDN18-2	1800 nt		10.49	□□□□□ -0.73
KTR6	P54070	FUR4	YBR021W	1902 nt		10.48	□□□□□ -0.73
KTR6	P54070	NBP35	YGL091C	987 nt		10.47	□□□□□ -0.73
KTR6	P54070	AQY2	YLL052C	450 nt		10.45	□□□□□ -0.74
KTR6	P54070	SFA1	YDL168W	1161 nt		10.44	□□□□□ -0.74
KTR6	P54070	YCR087W	YCR087W	516 nt		10.42	□□□□□ -0.74
KTR6	P54070	SHH4	YLR164W	507 nt		10.41	□□□□□ -0.74
KTR6	P54070	YHL019W-A	YHL019W-A	594 nt		10.39	□□□□□ -0.75
KTR6	P54070	RBG1	YAL036C	1110 nt		10.39	□□□□□ -0.75
KTR6	P54070	COQ2	YNR041C	1119 nt		10.39	□□□□□ -0.75
KTR6	P54070	TIR3	YIL011W	810 nt		10.38	□□□□□ -0.75
KTR6	P54070	AIM45	YPR004C	1035 nt		10.38	□□□□□ -0.75
KTR6	P54070	NDI1	YML120C	1542 nt		10.37	□□□□□ -0.75
KTR6	P54070	MRP20	YDR405W	792 nt		10.35	□□□□□ -0.75
KTR6	P54070	RPM1	RPM1	483 nt		10.33	□□□□□ -0.76
KTR6	P54070	YMR244W	YMR244W	1068 nt		10.33	□□□□□ -0.76
KTR6	P54070	GLR1	YPL091W	1452 nt		10.32	□□□□□ -0.76
KTR6	P54070	HSP60	YLR259C	1719 nt		10.31	□□□□□ -0.76
KTR6	P54070	POM34	YLR018C	900 nt		10.3	□□□□□ -0.76
KTR6	P54070	TOM6	YOR045W	186 nt		10.28	□□□□□ -0.76
KTR6	P54070	PRO1	YDR300C	1287 nt		10.27	□□□□□ -0.77
KTR6	P54070	LSC2	YGR244C	1284 nt		10.27	□□□□□ -0.77
KTR6	P54070	ARP6	YLR085C	1317 nt		10.27	□□□□□ -0.77
KTR6	P54070	YKR005C	YKR005C	1578 nt		10.26	□□□□□ -0.77

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