Protein–RNA interactions for Protein: P53840

TOF1, Topoisomerase 1-associated factor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOF1P53840 LYS4YDR234W 2082 nt12.04□□□□□ -0.48
TOF1P53840 CRR1YLR213C 1269 nt12.03□□□□□ -0.48
TOF1P53840 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.01□□□□□ -0.49
TOF1P53840 TAD3YLR316C 969 nt12□□□□□ -0.49
TOF1P53840 YDR094WYDR094W 336 nt11.99□□□□□ -0.49
TOF1P53840 YFL054CYFL054C 1941 nt11.98□□□□□ -0.49
TOF1P53840 YFL067WYFL067W 528 nt11.97□□□□□ -0.49
TOF1P53840 SPC25YER018C 666 nt11.95□□□□□ -0.5
TOF1P53840 STB1YNL309W 1263 nt11.95□□□□□ -0.5
TOF1P53840 DDR2YOL052C-A 186 nt11.94□□□□□ -0.5
TOF1P53840 YJL225CYJL225C 5277 nt11.93□□□□□ -0.5
TOF1P53840 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.91□□□□□ -0.5
TOF1P53840 SNG1YGR197C 1644 nt11.9□□□□□ -0.5
TOF1P53840 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.9□□□□□ -0.5
TOF1P53840 MIC10YCL057C-A 294 nt11.89□□□□□ -0.51
TOF1P53840 SPT8YLR055C 1809 nt11.88□□□□□ -0.51
TOF1P53840 CCT4YDL143W 1587 nt11.88□□□□□ -0.51
TOF1P53840 ANP1YEL036C 1503 nt11.87□□□□□ -0.51
TOF1P53840 HEM12YDR047W 1089 nt11.87□□□□□ -0.51
TOF1P53840 GPI16YHR188C 1833 nt11.86□□□□□ -0.51
TOF1P53840 BDH1YAL060W 1149 nt11.86□□□□□ -0.51
TOF1P53840 VPS60YDR486C 690 nt11.85□□□□□ -0.51
TOF1P53840 YFR018CYFR018C 1092 nt11.85□□□□□ -0.51
TOF1P53840 FEN2YCR028C 1539 nt11.83□□□□□ -0.52
TOF1P53840 ALG3YBL082C 1377 nt11.81□□□□□ -0.52
TOF1P53840 YSP3YOR003W 1437 nt11.8□□□□□ -0.52
TOF1P53840 PRE6YOL038W 765 nt11.79□□□□□ -0.52
TOF1P53840 SWC5YBR231C 912 nt11.77□□□□□ -0.53
TOF1P53840 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.76□□□□□ -0.53
TOF1P53840 YLR415CYLR415C 339 nt11.76□□□□□ -0.53
TOF1P53840 YFL066CYFL066C 1179 nt11.74□□□□□ -0.53
TOF1P53840 PEX25YPL112C 1185 nt11.74□□□□□ -0.53
TOF1P53840 YIR016WYIR016W 798 nt11.73□□□□□ -0.53
TOF1P53840 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.71□□□□□ -0.53
TOF1P53840 PAU16YKL224C 372 nt11.71□□□□□ -0.53
TOF1P53840 SWE1YJL187C 2460 nt11.71□□□□□ -0.53
TOF1P53840 YNL115CYNL115C 1935 nt11.7□□□□□ -0.54
TOF1P53840 RRT5YFR032C 870 nt11.68□□□□□ -0.54
TOF1P53840 RAX1YOR301W 1308 nt11.64□□□□□ -0.55
TOF1P53840 MIC12YBR262C 321 nt11.64□□□□□ -0.55
TOF1P53840 BNA2YJR078W 1362 nt11.6□□□□□ -0.55
TOF1P53840 VPS75YNL246W 795 nt11.54□□□□□ -0.56
TOF1P53840 XDJ1YLR090W 1380 nt11.53□□□□□ -0.56
TOF1P53840 SHM2YLR058C 1410 nt11.52□□□□□ -0.57
TOF1P53840 CCA1YER168C 1641 nt11.51□□□□□ -0.57
TOF1P53840 TIM17YJL143W 477 nt11.5□□□□□ -0.57
TOF1P53840 HHO1YPL127C 777 nt11.48□□□□□ -0.57
TOF1P53840 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.46□□□□□ -0.57
TOF1P53840 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.46□□□□□ -0.57
TOF1P53840 YGR201CYGR201C 678 nt11.46□□□□□ -0.57
TOF1P53840 MIR1YJR077C 936 nt11.44□□□□□ -0.58
TOF1P53840 GDH3YAL062W 1374 nt11.43□□□□□ -0.58
TOF1P53840 AGP1YCL025C 1902 nt11.43□□□□□ -0.58
TOF1P53840 NIT1YIL164C 600 nt11.43□□□□□ -0.58
TOF1P53840 BOR1YNL275W 1731 nt11.4□□□□□ -0.58
TOF1P53840 NAT4YMR069W 858 nt11.39□□□□□ -0.59
TOF1P53840 SGT2YOR007C 1041 nt11.38□□□□□ -0.59
TOF1P53840 GLK1YCL040W 1503 nt11.38□□□□□ -0.59
TOF1P53840 FUR4YBR021W 1902 nt11.36□□□□□ -0.59
TOF1P53840 HSP60YLR259C 1719 nt11.35□□□□□ -0.59
TOF1P53840 THI74YDR438W 1113 nt11.35□□□□□ -0.59
TOF1P53840 DUT1YBR252W 444 nt11.35□□□□□ -0.59
TOF1P53840 AVT6YER119C 1347 nt11.35□□□□□ -0.59
TOF1P53840 PAU7YAR020C 168 nt11.33□□□□□ -0.6
TOF1P53840 MSF1YPR047W 1410 nt11.33□□□□□ -0.6
TOF1P53840 SHB17YKR043C 816 nt11.29□□□□□ -0.6
TOF1P53840 DAT1YML113W 747 nt11.29□□□□□ -0.6
TOF1P53840 GOR1YNL274C 1053 nt11.28□□□□□ -0.6
TOF1P53840 YDR010CYDR010C 333 nt11.27□□□□□ -0.61
TOF1P53840 SBA1YKL117W 651 nt11.26□□□□□ -0.61
TOF1P53840 UBA4YHR111W 1323 nt11.26□□□□□ -0.61
TOF1P53840 DUS1YML080W 1272 nt11.25□□□□□ -0.61
TOF1P53840 UME6YDR207C 2511 nt11.24□□□□□ -0.61
TOF1P53840 YCL074WYCL074W 927 nt11.2□□□□□ -0.62
TOF1P53840 YCR102CYCR102C 1107 nt11.18□□□□□ -0.62
TOF1P53840 RET2YFR051C 1641 nt11.17□□□□□ -0.62
TOF1P53840 YGL034CYGL034C 366 nt11.16□□□□□ -0.62
TOF1P53840 YSR3YKR053C 1215 nt11.16□□□□□ -0.62
TOF1P53840 STR3YGL184C 1398 nt11.16□□□□□ -0.62
TOF1P53840 PRP4YPR178W 1398 nt11.16□□□□□ -0.62
TOF1P53840 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.14□□□□□ -0.63
TOF1P53840 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.14□□□□□ -0.63
TOF1P53840 NBP35YGL091C 987 nt11.12□□□□□ -0.63
TOF1P53840 PHO89YBR296C 1725 nt11.12□□□□□ -0.63
TOF1P53840 XYL2YLR070C 1071 nt11.1□□□□□ -0.63
TOF1P53840 YKR005CYKR005C 1578 nt11.1□□□□□ -0.63
TOF1P53840 DPS1YLL018C 1674 nt11.08□□□□□ -0.64
TOF1P53840 SFA1YDL168W 1161 nt11.07□□□□□ -0.64
TOF1P53840 AQY2YLL052C 450 nt11.07□□□□□ -0.64
TOF1P53840 BMT6YLR063W 1098 nt11.06□□□□□ -0.64
TOF1P53840 SHH4YLR164W 507 nt11.05□□□□□ -0.64
TOF1P53840 YGR259CYGR259C 441 nt11.04□□□□□ -0.64
TOF1P53840 YCR087WYCR087W 516 nt11.03□□□□□ -0.64
TOF1P53840 AAC1YMR056C 930 nt11.02□□□□□ -0.65
TOF1P53840 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.01□□□□□ -0.65
TOF1P53840 TIR3YIL011W 810 nt11.01□□□□□ -0.65
TOF1P53840 COQ2YNR041C 1119 nt11.01□□□□□ -0.65
TOF1P53840 AIM45YPR004C 1035 nt11□□□□□ -0.65
TOF1P53840 RBG1YAL036C 1110 nt10.99□□□□□ -0.65
TOF1P53840 ALG12YNR030W 1656 nt10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.7 ms