Protein–RNA interactions for Protein: P53756

PDR18, ABC transporter ATP-binding protein/permease PDR18, yeastyeast

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR18P53756 YFL067WYFL067W 528 nt13.07□□□□□ -0.32
PDR18P53756 TAD3YLR316C 969 nt13.07□□□□□ -0.32
PDR18P53756 DDR2YOL052C-A 186 nt13.05□□□□□ -0.32
PDR18P53756 STB1YNL309W 1263 nt13.04□□□□□ -0.32
PDR18P53756 SPC25YER018C 666 nt13.03□□□□□ -0.32
PDR18P53756 UBX6YJL048C 1191 nt13.02□□□□□ -0.33
PDR18P53756 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.01□□□□□ -0.33
PDR18P53756 YDR094WYDR094W 336 nt13□□□□□ -0.33
PDR18P53756 SNG1YGR197C 1644 nt12.99□□□□□ -0.33
PDR18P53756 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.99□□□□□ -0.33
PDR18P53756 MIC10YCL057C-A 294 nt12.99□□□□□ -0.33
PDR18P53756 HEM12YDR047W 1089 nt12.98□□□□□ -0.33
PDR18P53756 ANP1YEL036C 1503 nt12.96□□□□□ -0.33
PDR18P53756 GPI16YHR188C 1833 nt12.95□□□□□ -0.34
PDR18P53756 CCT4YDL143W 1587 nt12.95□□□□□ -0.34
PDR18P53756 VPS60YDR486C 690 nt12.92□□□□□ -0.34
PDR18P53756 BDH1YAL060W 1149 nt12.9□□□□□ -0.34
PDR18P53756 NVJ2YPR091C 2313 nt12.9□□□□□ -0.34
PDR18P53756 FEN2YCR028C 1539 nt12.9□□□□□ -0.34
PDR18P53756 YFL054CYFL054C 1941 nt12.88□□□□□ -0.35
PDR18P53756 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.88□□□□□ -0.35
PDR18P53756 SWC5YBR231C 912 nt12.88□□□□□ -0.35
PDR18P53756 ALG3YBL082C 1377 nt12.87□□□□□ -0.35
PDR18P53756 YFR018CYFR018C 1092 nt12.86□□□□□ -0.35
PDR18P53756 YSP3YOR003W 1437 nt12.83□□□□□ -0.36
PDR18P53756 YLR415CYLR415C 339 nt12.83□□□□□ -0.36
PDR18P53756 PRE6YOL038W 765 nt12.8□□□□□ -0.36
PDR18P53756 PEX25YPL112C 1185 nt12.79□□□□□ -0.36
PDR18P53756 YIR016WYIR016W 798 nt12.78□□□□□ -0.36
PDR18P53756 SPT8YLR055C 1809 nt12.76□□□□□ -0.37
PDR18P53756 YNL115CYNL115C 1935 nt12.73□□□□□ -0.37
PDR18P53756 RAX1YOR301W 1308 nt12.73□□□□□ -0.37
PDR18P53756 YFL066CYFL066C 1179 nt12.73□□□□□ -0.37
PDR18P53756 PAU16YKL224C 372 nt12.71□□□□□ -0.37
PDR18P53756 MIC12YBR262C 321 nt12.71□□□□□ -0.37
PDR18P53756 BNA2YJR078W 1362 nt12.71□□□□□ -0.38
PDR18P53756 RRT5YFR032C 870 nt12.68□□□□□ -0.38
PDR18P53756 SWE1YJL187C 2460 nt12.64□□□□□ -0.39
PDR18P53756 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.63□□□□□ -0.39
PDR18P53756 XDJ1YLR090W 1380 nt12.59□□□□□ -0.39
PDR18P53756 VPS75YNL246W 795 nt12.58□□□□□ -0.4
PDR18P53756 TIM17YJL143W 477 nt12.57□□□□□ -0.4
PDR18P53756 CCA1YER168C 1641 nt12.56□□□□□ -0.4
PDR18P53756 YGR201CYGR201C 678 nt12.55□□□□□ -0.4
PDR18P53756 HHO1YPL127C 777 nt12.55□□□□□ -0.4
PDR18P53756 SHM2YLR058C 1410 nt12.54□□□□□ -0.4
PDR18P53756 AGP1YCL025C 1902 nt12.49□□□□□ -0.41
PDR18P53756 GDH3YAL062W 1374 nt12.47□□□□□ -0.41
PDR18P53756 NIT1YIL164C 600 nt12.44□□□□□ -0.42
PDR18P53756 MIR1YJR077C 936 nt12.44□□□□□ -0.42
PDR18P53756 SGT2YOR007C 1041 nt12.42□□□□□ -0.42
PDR18P53756 YJL225CYJL225C 5277 nt12.41□□□□□ -0.42
PDR18P53756 AVT6YER119C 1347 nt12.4□□□□□ -0.42
PDR18P53756 GLK1YCL040W 1503 nt12.38□□□□□ -0.43
PDR18P53756 NAT4YMR069W 858 nt12.37□□□□□ -0.43
PDR18P53756 PAU7YAR020C 168 nt12.37□□□□□ -0.43
PDR18P53756 DUT1YBR252W 444 nt12.37□□□□□ -0.43
PDR18P53756 THI74YDR438W 1113 nt12.35□□□□□ -0.43
PDR18P53756 DAT1YML113W 747 nt12.33□□□□□ -0.44
PDR18P53756 GOR1YNL274C 1053 nt12.33□□□□□ -0.44
PDR18P53756 MSF1YPR047W 1410 nt12.31□□□□□ -0.44
PDR18P53756 SHB17YKR043C 816 nt12.3□□□□□ -0.44
PDR18P53756 DUS1YML080W 1272 nt12.28□□□□□ -0.44
PDR18P53756 YDR010CYDR010C 333 nt12.26□□□□□ -0.45
PDR18P53756 UBA4YHR111W 1323 nt12.24□□□□□ -0.45
PDR18P53756 FUR4YBR021W 1902 nt12.22□□□□□ -0.45
PDR18P53756 YCL074WYCL074W 927 nt12.19□□□□□ -0.46
PDR18P53756 YCR102CYCR102C 1107 nt12.19□□□□□ -0.46
PDR18P53756 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.17□□□□□ -0.46
PDR18P53756 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.17□□□□□ -0.46
PDR18P53756 STR3YGL184C 1398 nt12.17□□□□□ -0.46
PDR18P53756 RET2YFR051C 1641 nt12.16□□□□□ -0.46
PDR18P53756 SBA1YKL117W 651 nt12.15□□□□□ -0.46
PDR18P53756 YSR3YKR053C 1215 nt12.15□□□□□ -0.46
PDR18P53756 YGL034CYGL034C 366 nt12.12□□□□□ -0.47
PDR18P53756 AQY2YLL052C 450 nt12.12□□□□□ -0.47
PDR18P53756 NBP35YGL091C 987 nt12.11□□□□□ -0.47
PDR18P53756 PHO89YBR296C 1725 nt12.11□□□□□ -0.47
PDR18P53756 XYL2YLR070C 1071 nt12.07□□□□□ -0.48
PDR18P53756 SFA1YDL168W 1161 nt12.06□□□□□ -0.48
PDR18P53756 HSP60YLR259C 1719 nt12.05□□□□□ -0.48
PDR18P53756 YCR087WYCR087W 516 nt12.04□□□□□ -0.48
PDR18P53756 SHH4YLR164W 507 nt12.03□□□□□ -0.48
PDR18P53756 TIR3YIL011W 810 nt12.02□□□□□ -0.49
PDR18P53756 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.01□□□□□ -0.49
PDR18P53756 UME6YDR207C 2511 nt12□□□□□ -0.49
PDR18P53756 COQ2YNR041C 1119 nt11.99□□□□□ -0.49
PDR18P53756 AIM45YPR004C 1035 nt11.98□□□□□ -0.49
PDR18P53756 YKR005CYKR005C 1578 nt11.97□□□□□ -0.49
PDR18P53756 RTN2YDL204W 1182 nt11.95□□□□□ -0.5
PDR18P53756 RBG1YAL036C 1110 nt11.95□□□□□ -0.5
PDR18P53756 MRP20YDR405W 792 nt11.94□□□□□ -0.5
PDR18P53756 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.94□□□□□ -0.5
PDR18P53756 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.94□□□□□ -0.5
PDR18P53756 PRP4YPR178W 1398 nt11.92□□□□□ -0.5
PDR18P53756 BOR1YNL275W 1731 nt11.92□□□□□ -0.5
PDR18P53756 ARP6YLR085C 1317 nt11.92□□□□□ -0.5
PDR18P53756 NDI1YML120C 1542 nt11.91□□□□□ -0.5
PDR18P53756 YGR259CYGR259C 441 nt11.91□□□□□ -0.5
PDR18P53756 POM34YLR018C 900 nt11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms