Protein–RNA interactions for Protein: P53167

PUS2, tRNA pseudouridine(27/28) synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS2P53167 YFL067WYFL067W 528 nt11.51□□□□□ -0.57
PUS2P53167 AHT1YHR093W 549 nt11.51□□□□□ -0.57
PUS2P53167 SNG1YGR197C 1644 nt11.5□□□□□ -0.57
PUS2P53167 HEM12YDR047W 1089 nt11.5□□□□□ -0.57
PUS2P53167 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.5□□□□□ -0.57
PUS2P53167 STB1YNL309W 1263 nt11.5□□□□□ -0.57
PUS2P53167 TAD3YLR316C 969 nt11.48□□□□□ -0.57
PUS2P53167 AQY1YPR192W 918 nt11.48□□□□□ -0.57
PUS2P53167 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.47□□□□□ -0.57
PUS2P53167 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.44□□□□□ -0.58
PUS2P53167 SPC25YER018C 666 nt11.43□□□□□ -0.58
PUS2P53167 CCT4YDL143W 1587 nt11.42□□□□□ -0.58
PUS2P53167 VPS60YDR486C 690 nt11.42□□□□□ -0.58
PUS2P53167 FEN2YCR028C 1539 nt11.4□□□□□ -0.58
PUS2P53167 UBX6YJL048C 1191 nt11.4□□□□□ -0.58
PUS2P53167 ANP1YEL036C 1503 nt11.4□□□□□ -0.59
PUS2P53167 GPI16YHR188C 1833 nt11.39□□□□□ -0.59
PUS2P53167 SWC5YBR231C 912 nt11.39□□□□□ -0.59
PUS2P53167 ALG3YBL082C 1377 nt11.38□□□□□ -0.59
PUS2P53167 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.35□□□□□ -0.59
PUS2P53167 SPT8YLR055C 1809 nt11.34□□□□□ -0.59
PUS2P53167 BDH1YAL060W 1149 nt11.33□□□□□ -0.6
PUS2P53167 YIR016WYIR016W 798 nt11.3□□□□□ -0.6
PUS2P53167 YFL066CYFL066C 1179 nt11.29□□□□□ -0.6
PUS2P53167 YDR094WYDR094W 336 nt11.28□□□□□ -0.6
PUS2P53167 YLR415CYLR415C 339 nt11.28□□□□□ -0.6
PUS2P53167 BNA2YJR078W 1362 nt11.28□□□□□ -0.6
PUS2P53167 PRE6YOL038W 765 nt11.27□□□□□ -0.61
PUS2P53167 RAX1YOR301W 1308 nt11.27□□□□□ -0.61
PUS2P53167 YSP3YOR003W 1437 nt11.24□□□□□ -0.61
PUS2P53167 SWE1YJL187C 2460 nt11.22□□□□□ -0.61
PUS2P53167 YNL115CYNL115C 1935 nt11.22□□□□□ -0.61
PUS2P53167 YFR018CYFR018C 1092 nt11.19□□□□□ -0.62
PUS2P53167 PEX25YPL112C 1185 nt11.19□□□□□ -0.62
PUS2P53167 PAC11YDR488C 1602 nt11.18□□□□□ -0.62
PUS2P53167 CCA1YER168C 1641 nt11.17□□□□□ -0.62
PUS2P53167 MIC12YBR262C 321 nt11.16□□□□□ -0.62
PUS2P53167 HHO1YPL127C 777 nt11.15□□□□□ -0.62
PUS2P53167 PAU16YKL224C 372 nt11.13□□□□□ -0.63
PUS2P53167 XDJ1YLR090W 1380 nt11.13□□□□□ -0.63
PUS2P53167 RRT5YFR032C 870 nt11.09□□□□□ -0.63
PUS2P53167 SHM2YLR058C 1410 nt11.09□□□□□ -0.63
PUS2P53167 AGP1YCL025C 1902 nt11.08□□□□□ -0.64
PUS2P53167 GDH3YAL062W 1374 nt11.07□□□□□ -0.64
PUS2P53167 TIM17YJL143W 477 nt11.06□□□□□ -0.64
PUS2P53167 DUT1YBR252W 444 nt11.06□□□□□ -0.64
PUS2P53167 AVT6YER119C 1347 nt11.03□□□□□ -0.64
PUS2P53167 YGR201CYGR201C 678 nt11□□□□□ -0.65
PUS2P53167 DUS1YML080W 1272 nt11□□□□□ -0.65
PUS2P53167 VPS75YNL246W 795 nt10.98□□□□□ -0.65
PUS2P53167 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.97□□□□□ -0.65
PUS2P53167 SGT2YOR007C 1041 nt10.97□□□□□ -0.65
PUS2P53167 NIT1YIL164C 600 nt10.96□□□□□ -0.65
PUS2P53167 GOR1YNL274C 1053 nt10.95□□□□□ -0.66
PUS2P53167 PAU7YAR020C 168 nt10.93□□□□□ -0.66
PUS2P53167 GLK1YCL040W 1503 nt10.89□□□□□ -0.67
PUS2P53167 FUR4YBR021W 1902 nt10.88□□□□□ -0.67
PUS2P53167 MIR1YJR077C 936 nt10.88□□□□□ -0.67
PUS2P53167 AQY2YLL052C 450 nt10.85□□□□□ -0.67
PUS2P53167 NAT4YMR069W 858 nt10.85□□□□□ -0.67
PUS2P53167 THI74YDR438W 1113 nt10.83□□□□□ -0.68
PUS2P53167 SHB17YKR043C 816 nt10.83□□□□□ -0.68
PUS2P53167 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.82□□□□□ -0.68
PUS2P53167 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.82□□□□□ -0.68
PUS2P53167 YJL225CYJL225C 5277 nt10.8□□□□□ -0.68
PUS2P53167 STR3YGL184C 1398 nt10.8□□□□□ -0.68
PUS2P53167 YCL074WYCL074W 927 nt10.8□□□□□ -0.68
PUS2P53167 MSF1YPR047W 1410 nt10.77□□□□□ -0.68
PUS2P53167 YDR010CYDR010C 333 nt10.77□□□□□ -0.69
PUS2P53167 DAT1YML113W 747 nt10.77□□□□□ -0.69
PUS2P53167 UBA4YHR111W 1323 nt10.76□□□□□ -0.69
PUS2P53167 YCR102CYCR102C 1107 nt10.75□□□□□ -0.69
PUS2P53167 HSP60YLR259C 1719 nt10.75□□□□□ -0.69
PUS2P53167 YSR3YKR053C 1215 nt10.72□□□□□ -0.69
PUS2P53167 BOR1YNL275W 1731 nt10.69□□□□□ -0.7
PUS2P53167 PHO89YBR296C 1725 nt10.69□□□□□ -0.7
PUS2P53167 NBP35YGL091C 987 nt10.68□□□□□ -0.7
PUS2P53167 XYL2YLR070C 1071 nt10.68□□□□□ -0.7
PUS2P53167 SHH4YLR164W 507 nt10.67□□□□□ -0.7
PUS2P53167 YGL034CYGL034C 366 nt10.65□□□□□ -0.7
PUS2P53167 RET2YFR051C 1641 nt10.65□□□□□ -0.7
PUS2P53167 YKR005CYKR005C 1578 nt10.64□□□□□ -0.71
PUS2P53167 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.63□□□□□ -0.71
PUS2P53167 SBA1YKL117W 651 nt10.63□□□□□ -0.71
PUS2P53167 PRP4YPR178W 1398 nt10.63□□□□□ -0.71
PUS2P53167 SFA1YDL168W 1161 nt10.62□□□□□ -0.71
PUS2P53167 YGR259CYGR259C 441 nt10.6□□□□□ -0.71
PUS2P53167 NME1NME1 340 nt10.58□□□□□ -0.72
PUS2P53167 DPS1YLL018C 1674 nt10.57□□□□□ -0.72
PUS2P53167 RBG1YAL036C 1110 nt10.57□□□□□ -0.72
PUS2P53167 COQ2YNR041C 1119 nt10.56□□□□□ -0.72
PUS2P53167 PRO1YDR300C 1287 nt10.54□□□□□ -0.72
PUS2P53167 TIR3YIL011W 810 nt10.54□□□□□ -0.72
PUS2P53167 TOM6YOR045W 186 nt10.54□□□□□ -0.72
PUS2P53167 MRP20YDR405W 792 nt10.53□□□□□ -0.72
PUS2P53167 PLB1YMR008C 1995 nt10.52□□□□□ -0.73
PUS2P53167 RTN2YDL204W 1182 nt10.51□□□□□ -0.73
PUS2P53167 BMT6YLR063W 1098 nt10.51□□□□□ -0.73
PUS2P53167 NDI1YML120C 1542 nt10.5□□□□□ -0.73
PUS2P53167 YCR087WYCR087W 516 nt10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65.2 ms