Protein–RNA interactions for Protein: P53044

UFD1, Ubiquitin fusion degradation protein 1, yeastyeast

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFD1P53044 GLK1YCL040W 1503 nt9.44□□□□□ -0.9
UFD1P53044 TRM5YHR070W 1500 nt9.43□□□□□ -0.9
UFD1P53044 HEM12YDR047W 1089 nt9.43□□□□□ -0.9
UFD1P53044 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.43□□□□□ -0.9
UFD1P53044 MIC10YCL057C-A 294 nt9.42□□□□□ -0.9
UFD1P53044 SNG1YGR197C 1644 nt9.42□□□□□ -0.9
UFD1P53044 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.41□□□□□ -0.9
UFD1P53044 YEL076CYEL076C 651 nt9.41□□□□□ -0.9
UFD1P53044 YLR464WYLR464W 651 nt9.41□□□□□ -0.9
UFD1P53044 DDR2YOL052C-A 186 nt9.39□□□□□ -0.91
UFD1P53044 AQY1YPR192W 918 nt9.39□□□□□ -0.91
UFD1P53044 TIM23YNR017W 669 nt9.38□□□□□ -0.91
UFD1P53044 RTG1YOL067C 534 nt9.37□□□□□ -0.91
UFD1P53044 FUR4YBR021W 1902 nt9.37□□□□□ -0.91
UFD1P53044 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.36□□□□□ -0.91
UFD1P53044 Q0182Q0182 405 nt9.36□□□□□ -0.91
UFD1P53044 YKL030WYKL030W 606 nt9.36□□□□□ -0.91
UFD1P53044 YLR179CYLR179C 606 nt9.34□□□□□ -0.91
UFD1P53044 ANP1YEL036C 1503 nt9.34□□□□□ -0.91
UFD1P53044 RAX1YOR301W 1308 nt9.33□□□□□ -0.92
UFD1P53044 SPC25YER018C 666 nt9.32□□□□□ -0.92
UFD1P53044 HUA1YGR268C 597 nt9.32□□□□□ -0.92
UFD1P53044 STB1YNL309W 1263 nt9.32□□□□□ -0.92
UFD1P53044 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.29□□□□□ -0.92
UFD1P53044 AHT1YHR093W 549 nt9.29□□□□□ -0.92
UFD1P53044 CCA1YER168C 1641 nt9.29□□□□□ -0.92
UFD1P53044 WSC2YNL283C 1512 nt9.29□□□□□ -0.92
UFD1P53044 GPI16YHR188C 1833 nt9.26□□□□□ -0.93
UFD1P53044 PRP4YPR178W 1398 nt9.26□□□□□ -0.93
UFD1P53044 FEN2YCR028C 1539 nt9.26□□□□□ -0.93
UFD1P53044 AAC1YMR056C 930 nt9.24□□□□□ -0.93
UFD1P53044 YPR064WYPR064W 420 nt9.23□□□□□ -0.93
UFD1P53044 MIC12YBR262C 321 nt9.23□□□□□ -0.93
UFD1P53044 BNA2YJR078W 1362 nt9.23□□□□□ -0.93
UFD1P53044 CCT4YDL143W 1587 nt9.22□□□□□ -0.93
UFD1P53044 VPS60YDR486C 690 nt9.22□□□□□ -0.93
UFD1P53044 BMT6YLR063W 1098 nt9.21□□□□□ -0.94
UFD1P53044 DPS1YLL018C 1674 nt9.2□□□□□ -0.94
UFD1P53044 YIR016WYIR016W 798 nt9.19□□□□□ -0.94
UFD1P53044 TAD3YLR316C 969 nt9.18□□□□□ -0.94
UFD1P53044 ALG3YBL082C 1377 nt9.18□□□□□ -0.94
UFD1P53044 NAR1YNL240C 1476 nt9.15□□□□□ -0.94
UFD1P53044 SWC5YBR231C 912 nt9.15□□□□□ -0.94
UFD1P53044 HSL7YBR133C 2484 nt9.15□□□□□ -0.94
UFD1P53044 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.13□□□□□ -0.95
UFD1P53044 YKR005CYKR005C 1578 nt9.12□□□□□ -0.95
UFD1P53044 AGP1YCL025C 1902 nt9.12□□□□□ -0.95
UFD1P53044 HHO1YPL127C 777 nt9.11□□□□□ -0.95
UFD1P53044 YCL074WYCL074W 927 nt9.08□□□□□ -0.96
UFD1P53044 BDH1YAL060W 1149 nt9.08□□□□□ -0.96
UFD1P53044 YGR201CYGR201C 678 nt9.07□□□□□ -0.96
UFD1P53044 DUS1YML080W 1272 nt9.06□□□□□ -0.96
UFD1P53044 YDR094WYDR094W 336 nt9.05□□□□□ -0.96
UFD1P53044 CMP2YML057W 1815 nt9.05□□□□□ -0.96
UFD1P53044 BIO5YNR056C 1686 nt9.04□□□□□ -0.96
UFD1P53044 HEL2YDR266C 1920 nt9.04□□□□□ -0.96
UFD1P53044 YGR259CYGR259C 441 nt9.04□□□□□ -0.96
UFD1P53044 SNF1YDR477W 1902 nt9.03□□□□□ -0.96
UFD1P53044 XDJ1YLR090W 1380 nt9.03□□□□□ -0.96
UFD1P53044 IRC24YIR036C 792 nt9.03□□□□□ -0.96
UFD1P53044 YLR415CYLR415C 339 nt9.03□□□□□ -0.96
UFD1P53044 UBX6YJL048C 1191 nt9□□□□□ -0.97
UFD1P53044 CYT2YKL087C 675 nt9□□□□□ -0.97
UFD1P53044 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.99□□□□□ -0.97
UFD1P53044 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.99□□□□□ -0.97
UFD1P53044 YSP3YOR003W 1437 nt8.99□□□□□ -0.97
UFD1P53044 PBP1YGR178C 2169 nt8.98□□□□□ -0.97
UFD1P53044 DUT1YBR252W 444 nt8.97□□□□□ -0.97
UFD1P53044 GDH3YAL062W 1374 nt8.96□□□□□ -0.98
UFD1P53044 MET2YNL277W 1461 nt8.95□□□□□ -0.98
UFD1P53044 AVT6YER119C 1347 nt8.94□□□□□ -0.98
UFD1P53044 SHM2YLR058C 1410 nt8.93□□□□□ -0.98
UFD1P53044 YAT1YAR035W 2064 nt8.93□□□□□ -0.98
UFD1P53044 STR3YGL184C 1398 nt8.92□□□□□ -0.98
UFD1P53044 GOR1YNL274C 1053 nt8.92□□□□□ -0.98
UFD1P53044 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.91□□□□□ -0.98
UFD1P53044 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.91□□□□□ -0.98
UFD1P53044 YFR018CYFR018C 1092 nt8.91□□□□□ -0.98
UFD1P53044 TIM17YJL143W 477 nt8.91□□□□□ -0.98
UFD1P53044 RRT5YFR032C 870 nt8.88□□□□□ -0.99
UFD1P53044 PEX25YPL112C 1185 nt8.88□□□□□ -0.99
UFD1P53044 SFP1YLR403W 2052 nt8.88□□□□□ -0.99
UFD1P53044 YNL115CYNL115C 1935 nt8.88□□□□□ -0.99
UFD1P53044 SSN3YPL042C 1668 nt8.86□□□□□ -0.99
UFD1P53044 NIT1YIL164C 600 nt8.86□□□□□ -0.99
UFD1P53044 DAT1YML113W 747 nt8.84□□□□□ -0.99
UFD1P53044 NPP1YCR026C 2229 nt8.84□□□□□ -0.99
UFD1P53044 GID7YCL039W 2238 nt8.84□□□□□ -0.99
UFD1P53044 AQY2YLL052C 450 nt8.83□□□□□ -1
UFD1P53044 RTN2YDL204W 1182 nt8.82□□□□□ -1
UFD1P53044 VPS75YNL246W 795 nt8.82□□□□□ -1
UFD1P53044 YFL066CYFL066C 1179 nt8.81□□□□□ -1
UFD1P53044 SGT2YOR007C 1041 nt8.8□□□□□ -1
UFD1P53044 PAU16YKL224C 372 nt8.78□□□□□ -1
UFD1P53044 YCR102CYCR102C 1107 nt8.76□□□□□ -1.01
UFD1P53044 NBP35YGL091C 987 nt8.75□□□□□ -1.01
UFD1P53044 PRE6YOL038W 765 nt8.74□□□□□ -1.01
UFD1P53044 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.73□□□□□ -1.01
UFD1P53044 NDI1YML120C 1542 nt8.73□□□□□ -1.01
UFD1P53044 PAU7YAR020C 168 nt8.69□□□□□ -1.02
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