Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Epb41l4aP52963 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Epb41l4aP52963 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Epb41l4aP52963 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Epb41l4aP52963 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Epb41l4aP52963 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Epb41l4aP52963 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Epb41l4aP52963 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Epb41l4aP52963 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Epb41l4aP52963 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Epb41l4aP52963 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Epb41l4aP52963 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Epb41l4aP52963 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Epb41l4aP52963 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Epb41l4aP52963 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Epb41l4aP52963 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Epb41l4aP52963 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Epb41l4aP52963 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Epb41l4aP52963 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Epb41l4aP52963 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Epb41l4aP52963 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Epb41l4aP52963 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Epb41l4aP52963 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Epb41l4aP52963 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Epb41l4aP52963 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Epb41l4aP52963 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Epb41l4aP52963 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Epb41l4aP52963 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Epb41l4aP52963 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Epb41l4aP52963 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Epb41l4aP52963 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Epb41l4aP52963 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Epb41l4aP52963 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Epb41l4aP52963 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Epb41l4aP52963 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Epb41l4aP52963 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Epb41l4aP52963 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Epb41l4aP52963 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Epb41l4aP52963 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Epb41l4aP52963 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Epb41l4aP52963 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Epb41l4aP52963 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Epb41l4aP52963 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Epb41l4aP52963 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Epb41l4aP52963 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Epb41l4aP52963 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Epb41l4aP52963 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Epb41l4aP52963 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Epb41l4aP52963 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Epb41l4aP52963 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Epb41l4aP52963 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Epb41l4aP52963 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Epb41l4aP52963 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Epb41l4aP52963 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Epb41l4aP52963 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Epb41l4aP52963 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Epb41l4aP52963 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Epb41l4aP52963 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Epb41l4aP52963 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Epb41l4aP52963 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Epb41l4aP52963 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Epb41l4aP52963 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Epb41l4aP52963 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Epb41l4aP52963 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Epb41l4aP52963 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Epb41l4aP52963 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Epb41l4aP52963 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Epb41l4aP52963 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Epb41l4aP52963 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Epb41l4aP52963 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Epb41l4aP52963 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Epb41l4aP52963 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Epb41l4aP52963 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Epb41l4aP52963 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Epb41l4aP52963 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Epb41l4aP52963 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Epb41l4aP52963 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Epb41l4aP52963 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Epb41l4aP52963 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Epb41l4aP52963 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Epb41l4aP52963 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Epb41l4aP52963 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Epb41l4aP52963 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Epb41l4aP52963 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Epb41l4aP52963 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Epb41l4aP52963 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Epb41l4aP52963 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Epb41l4aP52963 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Epb41l4aP52963 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Epb41l4aP52963 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Epb41l4aP52963 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Epb41l4aP52963 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Epb41l4aP52963 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Epb41l4aP52963 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Epb41l4aP52963 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Epb41l4aP52963 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Epb41l4aP52963 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Epb41l4aP52963 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Epb41l4aP52963 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Epb41l4aP52963 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
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