Protein–RNA interactions for Protein: P50428

Arsa, Arylsulfatase A, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArsaP50428 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ArsaP50428 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ArsaP50428 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ArsaP50428 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ArsaP50428 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArsaP50428 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArsaP50428 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArsaP50428 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ArsaP50428 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ArsaP50428 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ArsaP50428 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ArsaP50428 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ArsaP50428 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ArsaP50428 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArsaP50428 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ArsaP50428 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ArsaP50428 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ArsaP50428 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArsaP50428 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArsaP50428 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ArsaP50428 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ArsaP50428 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ArsaP50428 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArsaP50428 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ArsaP50428 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ArsaP50428 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ArsaP50428 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ArsaP50428 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArsaP50428 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ArsaP50428 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ArsaP50428 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArsaP50428 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArsaP50428 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArsaP50428 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ArsaP50428 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArsaP50428 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArsaP50428 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArsaP50428 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ArsaP50428 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ArsaP50428 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArsaP50428 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArsaP50428 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArsaP50428 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ArsaP50428 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ArsaP50428 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ArsaP50428 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArsaP50428 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArsaP50428 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ArsaP50428 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ArsaP50428 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ArsaP50428 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ArsaP50428 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ArsaP50428 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArsaP50428 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArsaP50428 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArsaP50428 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArsaP50428 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArsaP50428 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArsaP50428 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ArsaP50428 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ArsaP50428 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ArsaP50428 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ArsaP50428 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ArsaP50428 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ArsaP50428 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArsaP50428 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArsaP50428 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArsaP50428 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArsaP50428 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArsaP50428 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArsaP50428 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArsaP50428 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ArsaP50428 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArsaP50428 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArsaP50428 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArsaP50428 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArsaP50428 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArsaP50428 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ArsaP50428 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ArsaP50428 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ArsaP50428 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ArsaP50428 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ArsaP50428 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArsaP50428 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArsaP50428 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ArsaP50428 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArsaP50428 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ArsaP50428 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ArsaP50428 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ArsaP50428 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ArsaP50428 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ArsaP50428 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ArsaP50428 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArsaP50428 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArsaP50428 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ArsaP50428 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ArsaP50428 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ArsaP50428 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ArsaP50428 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArsaP50428 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms