Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

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Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp9P49962 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp9P49962 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp9P49962 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp9P49962 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srp9P49962 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srp9P49962 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp9P49962 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp9P49962 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp9P49962 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp9P49962 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp9P49962 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp9P49962 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp9P49962 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp9P49962 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp9P49962 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp9P49962 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp9P49962 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp9P49962 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp9P49962 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp9P49962 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp9P49962 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp9P49962 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srp9P49962 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srp9P49962 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp9P49962 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp9P49962 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp9P49962 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp9P49962 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp9P49962 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp9P49962 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp9P49962 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp9P49962 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp9P49962 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp9P49962 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srp9P49962 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Srp9P49962 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srp9P49962 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srp9P49962 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srp9P49962 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp9P49962 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp9P49962 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp9P49962 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp9P49962 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp9P49962 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srp9P49962 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srp9P49962 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Srp9P49962 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srp9P49962 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srp9P49962 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srp9P49962 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srp9P49962 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srp9P49962 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Srp9P49962 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srp9P49962 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srp9P49962 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp9P49962 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp9P49962 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srp9P49962 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srp9P49962 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srp9P49962 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Srp9P49962 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srp9P49962 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp9P49962 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp9P49962 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp9P49962 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp9P49962 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp9P49962 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp9P49962 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp9P49962 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp9P49962 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srp9P49962 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srp9P49962 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srp9P49962 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srp9P49962 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srp9P49962 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Srp9P49962 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srp9P49962 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Srp9P49962 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Srp9P49962 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srp9P49962 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Srp9P49962 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srp9P49962 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Srp9P49962 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srp9P49962 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Srp9P49962 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srp9P49962 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Srp9P49962 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srp9P49962 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srp9P49962 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp9P49962 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srp9P49962 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srp9P49962 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srp9P49962 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp9P49962 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp9P49962 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp9P49962 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp9P49962 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp9P49962 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srp9P49962 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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