Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rph3aP47708 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rph3aP47708 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rph3aP47708 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rph3aP47708 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rph3aP47708 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rph3aP47708 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rph3aP47708 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rph3aP47708 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rph3aP47708 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rph3aP47708 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rph3aP47708 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rph3aP47708 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rph3aP47708 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rph3aP47708 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rph3aP47708 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rph3aP47708 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rph3aP47708 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rph3aP47708 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rph3aP47708 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rph3aP47708 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rph3aP47708 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rph3aP47708 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rph3aP47708 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rph3aP47708 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rph3aP47708 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rph3aP47708 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rph3aP47708 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rph3aP47708 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rph3aP47708 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rph3aP47708 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rph3aP47708 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rph3aP47708 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rph3aP47708 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rph3aP47708 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rph3aP47708 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rph3aP47708 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rph3aP47708 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rph3aP47708 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rph3aP47708 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rph3aP47708 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rph3aP47708 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rph3aP47708 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rph3aP47708 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rph3aP47708 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rph3aP47708 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rph3aP47708 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rph3aP47708 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rph3aP47708 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rph3aP47708 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rph3aP47708 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rph3aP47708 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rph3aP47708 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rph3aP47708 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rph3aP47708 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rph3aP47708 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rph3aP47708 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rph3aP47708 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rph3aP47708 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rph3aP47708 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rph3aP47708 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rph3aP47708 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rph3aP47708 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rph3aP47708 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rph3aP47708 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rph3aP47708 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rph3aP47708 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rph3aP47708 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rph3aP47708 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rph3aP47708 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rph3aP47708 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rph3aP47708 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rph3aP47708 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rph3aP47708 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rph3aP47708 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rph3aP47708 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rph3aP47708 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rph3aP47708 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rph3aP47708 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rph3aP47708 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rph3aP47708 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rph3aP47708 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rph3aP47708 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rph3aP47708 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rph3aP47708 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rph3aP47708 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rph3aP47708 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rph3aP47708 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rph3aP47708 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rph3aP47708 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rph3aP47708 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rph3aP47708 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rph3aP47708 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rph3aP47708 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rph3aP47708 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rph3aP47708 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rph3aP47708 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rph3aP47708 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rph3aP47708 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rph3aP47708 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms