Protein–RNA interactions for Protein: P43618

CNN1, Inner kinetochore subunit CNN1, yeastyeast

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CNN1P43618 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.3□□□□□ -0.6
CNN1P43618 YPR064WYPR064W 420 nt11.3□□□□□ -0.6
CNN1P43618 ERF2YLR246W 1080 nt11.28□□□□□ -0.6
CNN1P43618 TAD3YLR316C 969 nt11.27□□□□□ -0.61
CNN1P43618 LYS4YDR234W 2082 nt11.27□□□□□ -0.61
CNN1P43618 CRR1YLR213C 1269 nt11.26□□□□□ -0.61
CNN1P43618 ATF2YGR177C 1608 nt11.26□□□□□ -0.61
CNN1P43618 TRM5YHR070W 1500 nt11.25□□□□□ -0.61
CNN1P43618 SPC25YER018C 666 nt11.21□□□□□ -0.61
CNN1P43618 YFL067WYFL067W 528 nt11.21□□□□□ -0.61
CNN1P43618 PTK1YKL198C 1989 nt11.19□□□□□ -0.62
CNN1P43618 YFR018CYFR018C 1092 nt11.18□□□□□ -0.62
CNN1P43618 STB1YNL309W 1263 nt11.18□□□□□ -0.62
CNN1P43618 DDR2YOL052C-A 186 nt11.15□□□□□ -0.62
CNN1P43618 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.14□□□□□ -0.63
CNN1P43618 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.14□□□□□ -0.63
CNN1P43618 ANP1YEL036C 1503 nt11.14□□□□□ -0.63
CNN1P43618 CCT4YDL143W 1587 nt11.13□□□□□ -0.63
CNN1P43618 BDH1YAL060W 1149 nt11.13□□□□□ -0.63
CNN1P43618 SNG1YGR197C 1644 nt11.12□□□□□ -0.63
CNN1P43618 GPI16YHR188C 1833 nt11.12□□□□□ -0.63
CNN1P43618 MIC10YCL057C-A 294 nt11.1□□□□□ -0.63
CNN1P43618 YSP3YOR003W 1437 nt11.09□□□□□ -0.63
CNN1P43618 HEM12YDR047W 1089 nt11.09□□□□□ -0.63
CNN1P43618 UME6YDR207C 2511 nt11.09□□□□□ -0.63
CNN1P43618 VPS60YDR486C 690 nt11.08□□□□□ -0.64
CNN1P43618 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.07□□□□□ -0.64
CNN1P43618 FEN2YCR028C 1539 nt11.06□□□□□ -0.64
CNN1P43618 PRE6YOL038W 765 nt11.06□□□□□ -0.64
CNN1P43618 ALG3YBL082C 1377 nt11.05□□□□□ -0.64
CNN1P43618 YGR139WYGR139W 339 nt11.05□□□□□ -0.64
CNN1P43618 PEX25YPL112C 1185 nt11.05□□□□□ -0.64
CNN1P43618 YLR415CYLR415C 339 nt11.03□□□□□ -0.64
CNN1P43618 PAU16YKL224C 372 nt11.01□□□□□ -0.65
CNN1P43618 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11□□□□□ -0.65
CNN1P43618 SWC5YBR231C 912 nt11□□□□□ -0.65
CNN1P43618 YFL066CYFL066C 1179 nt10.98□□□□□ -0.65
CNN1P43618 RRT5YFR032C 870 nt10.98□□□□□ -0.65
CNN1P43618 YNL115CYNL115C 1935 nt10.97□□□□□ -0.65
CNN1P43618 YIR016WYIR016W 798 nt10.96□□□□□ -0.65
CNN1P43618 YFL054CYFL054C 1941 nt10.94□□□□□ -0.66
CNN1P43618 MIC12YBR262C 321 nt10.92□□□□□ -0.66
CNN1P43618 SPT8YLR055C 1809 nt10.91□□□□□ -0.66
CNN1P43618 RAX1YOR301W 1308 nt10.86□□□□□ -0.67
CNN1P43618 VPS75YNL246W 795 nt10.86□□□□□ -0.67
CNN1P43618 RPM1RPM1 483 nt10.85□□□□□ -0.67
CNN1P43618 BNA2YJR078W 1362 nt10.82□□□□□ -0.68
CNN1P43618 XDJ1YLR090W 1380 nt10.77□□□□□ -0.68
CNN1P43618 TIM17YJL143W 477 nt10.77□□□□□ -0.69
CNN1P43618 MIR1YJR077C 936 nt10.77□□□□□ -0.69
CNN1P43618 SHM2YLR058C 1410 nt10.76□□□□□ -0.69
CNN1P43618 YGR201CYGR201C 678 nt10.76□□□□□ -0.69
CNN1P43618 SWE1YJL187C 2460 nt10.75□□□□□ -0.69
CNN1P43618 BOR1YNL275W 1731 nt10.72□□□□□ -0.69
CNN1P43618 NIT1YIL164C 600 nt10.71□□□□□ -0.69
CNN1P43618 CCA1YER168C 1641 nt10.7□□□□□ -0.7
CNN1P43618 NAT4YMR069W 858 nt10.7□□□□□ -0.7
CNN1P43618 HHO1YPL127C 777 nt10.7□□□□□ -0.7
CNN1P43618 AGP1YCL025C 1902 nt10.68□□□□□ -0.7
CNN1P43618 GDH3YAL062W 1374 nt10.67□□□□□ -0.7
CNN1P43618 GLK1YCL040W 1503 nt10.67□□□□□ -0.7
CNN1P43618 THI74YDR438W 1113 nt10.66□□□□□ -0.7
CNN1P43618 MSF1YPR047W 1410 nt10.66□□□□□ -0.7
CNN1P43618 SGT2YOR007C 1041 nt10.65□□□□□ -0.7
CNN1P43618 SBA1YKL117W 651 nt10.61□□□□□ -0.71
CNN1P43618 DAT1YML113W 747 nt10.61□□□□□ -0.71
CNN1P43618 YDR010CYDR010C 333 nt10.59□□□□□ -0.71
CNN1P43618 AVT6YER119C 1347 nt10.58□□□□□ -0.71
CNN1P43618 SHB17YKR043C 816 nt10.58□□□□□ -0.72
CNN1P43618 PAU7YAR020C 168 nt10.58□□□□□ -0.72
CNN1P43618 UBA4YHR111W 1323 nt10.57□□□□□ -0.72
CNN1P43618 DUT1YBR252W 444 nt10.56□□□□□ -0.72
CNN1P43618 FRE6YLL051C 2139 nt10.55□□□□□ -0.72
CNN1P43618 GOR1YNL274C 1053 nt10.52□□□□□ -0.73
CNN1P43618 RET2YFR051C 1641 nt10.5□□□□□ -0.73
CNN1P43618 HSP60YLR259C 1719 nt10.5□□□□□ -0.73
CNN1P43618 YGL034CYGL034C 366 nt10.48□□□□□ -0.73
CNN1P43618 YCR102CYCR102C 1107 nt10.46□□□□□ -0.73
CNN1P43618 YSR3YKR053C 1215 nt10.46□□□□□ -0.73
CNN1P43618 NBP35YGL091C 987 nt10.41□□□□□ -0.74
CNN1P43618 STR3YGL184C 1398 nt10.4□□□□□ -0.74
CNN1P43618 PHO89YBR296C 1725 nt10.4□□□□□ -0.74
CNN1P43618 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.4□□□□□ -0.75
CNN1P43618 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.4□□□□□ -0.75
CNN1P43618 YCL074WYCL074W 927 nt10.39□□□□□ -0.75
CNN1P43618 YCR087WYCR087W 516 nt10.39□□□□□ -0.75
CNN1P43618 XYL2YLR070C 1071 nt10.39□□□□□ -0.75
CNN1P43618 SFA1YDL168W 1161 nt10.38□□□□□ -0.75
CNN1P43618 DUS1YML080W 1272 nt10.38□□□□□ -0.75
CNN1P43618 FUR4YBR021W 1902 nt10.37□□□□□ -0.75
CNN1P43618 MCH5YOR306C 1566 nt10.35□□□□□ -0.75
CNN1P43618 CSM2YIL132C 642 nt10.35□□□□□ -0.75
CNN1P43618 AIM45YPR004C 1035 nt10.34□□□□□ -0.75
CNN1P43618 TIR3YIL011W 810 nt10.33□□□□□ -0.76
CNN1P43618 SHH4YLR164W 507 nt10.33□□□□□ -0.76
CNN1P43618 COQ2YNR041C 1119 nt10.32□□□□□ -0.76
CNN1P43618 YMR244WYMR244W 1068 nt10.3□□□□□ -0.76
CNN1P43618 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.29□□□□□ -0.76
CNN1P43618 ALG12YNR030W 1656 nt10.28□□□□□ -0.76
CNN1P43618 RBG1YAL036C 1110 nt10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.3 ms