Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tac1P41539 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tac1P41539 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tac1P41539 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tac1P41539 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tac1P41539 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tac1P41539 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tac1P41539 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tac1P41539 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tac1P41539 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tac1P41539 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tac1P41539 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tac1P41539 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tac1P41539 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tac1P41539 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tac1P41539 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tac1P41539 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tac1P41539 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tac1P41539 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tac1P41539 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tac1P41539 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tac1P41539 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tac1P41539 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tac1P41539 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tac1P41539 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tac1P41539 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tac1P41539 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tac1P41539 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tac1P41539 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tac1P41539 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tac1P41539 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tac1P41539 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tac1P41539 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tac1P41539 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tac1P41539 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tac1P41539 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tac1P41539 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tac1P41539 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tac1P41539 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tac1P41539 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tac1P41539 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tac1P41539 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tac1P41539 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tac1P41539 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tac1P41539 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tac1P41539 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tac1P41539 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tac1P41539 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tac1P41539 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tac1P41539 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tac1P41539 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tac1P41539 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tac1P41539 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tac1P41539 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tac1P41539 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tac1P41539 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tac1P41539 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tac1P41539 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tac1P41539 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tac1P41539 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tac1P41539 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tac1P41539 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tac1P41539 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tac1P41539 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tac1P41539 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tac1P41539 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tac1P41539 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tac1P41539 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tac1P41539 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tac1P41539 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tac1P41539 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tac1P41539 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tac1P41539 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tac1P41539 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tac1P41539 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tac1P41539 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tac1P41539 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tac1P41539 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tac1P41539 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tac1P41539 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tac1P41539 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tac1P41539 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tac1P41539 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tac1P41539 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tac1P41539 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tac1P41539 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tac1P41539 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tac1P41539 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tac1P41539 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tac1P41539 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tac1P41539 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tac1P41539 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tac1P41539 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tac1P41539 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tac1P41539 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tac1P41539 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tac1P41539 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tac1P41539 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tac1P41539 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tac1P41539 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms