Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox7P40646 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox7P40646 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox7P40646 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox7P40646 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox7P40646 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox7P40646 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox7P40646 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox7P40646 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox7P40646 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox7P40646 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox7P40646 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox7P40646 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox7P40646 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox7P40646 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox7P40646 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox7P40646 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox7P40646 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox7P40646 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox7P40646 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox7P40646 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox7P40646 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox7P40646 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox7P40646 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox7P40646 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox7P40646 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox7P40646 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox7P40646 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox7P40646 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox7P40646 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox7P40646 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox7P40646 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox7P40646 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox7P40646 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox7P40646 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox7P40646 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox7P40646 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox7P40646 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox7P40646 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox7P40646 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox7P40646 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox7P40646 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox7P40646 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox7P40646 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox7P40646 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox7P40646 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox7P40646 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox7P40646 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox7P40646 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox7P40646 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox7P40646 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox7P40646 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox7P40646 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox7P40646 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox7P40646 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox7P40646 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox7P40646 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox7P40646 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox7P40646 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox7P40646 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox7P40646 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox7P40646 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox7P40646 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox7P40646 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox7P40646 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox7P40646 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox7P40646 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox7P40646 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox7P40646 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox7P40646 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox7P40646 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sox7P40646 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox7P40646 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox7P40646 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox7P40646 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox7P40646 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox7P40646 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox7P40646 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox7P40646 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox7P40646 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox7P40646 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox7P40646 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox7P40646 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox7P40646 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms