Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Sox7P40646 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sox7P40646 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sox7P40646 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sox7P40646 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sox7P40646 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sox7P40646 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Sox7P40646 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sox7P40646 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Sox7P40646 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sox7P40646 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sox7P40646 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Sox7P40646 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sox7P40646 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox7P40646 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sox7P40646 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sox7P40646 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sox7P40646 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sox7P40646 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox7P40646 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sox7P40646 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox7P40646 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sox7P40646 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sox7P40646 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox7P40646 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox7P40646 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox7P40646 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sox7P40646 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sox7P40646 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sox7P40646 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sox7P40646 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sox7P40646 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sox7P40646 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox7P40646 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox7P40646 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox7P40646 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sox7P40646 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sox7P40646 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox7P40646 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sox7P40646 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox7P40646 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sox7P40646 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sox7P40646 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sox7P40646 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox7P40646 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox7P40646 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox7P40646 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox7P40646 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox7P40646 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox7P40646 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox7P40646 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox7P40646 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sox7P40646 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox7P40646 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox7P40646 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox7P40646 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox7P40646 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox7P40646 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox7P40646 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox7P40646 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox7P40646 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox7P40646 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox7P40646 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox7P40646 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sox7P40646 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox7P40646 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox7P40646 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox7P40646 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox7P40646 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox7P40646 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox7P40646 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox7P40646 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox7P40646 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox7P40646 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox7P40646 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox7P40646 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox7P40646 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox7P40646 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox7P40646 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox7P40646 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sox7P40646 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox7P40646 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox7P40646 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox7P40646 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox7P40646 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox7P40646 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sox7P40646 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox7P40646 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox7P40646 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox7P40646 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox7P40646 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox7P40646 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox7P40646 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox7P40646 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox7P40646 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox7P40646 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox7P40646 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox7P40646 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox7P40646 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox7P40646 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms