Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 YFL067WYFL067W 528 nt12.66□□□□□ -0.38
VID28P40547 SNG1YGR197C 1644 nt12.66□□□□□ -0.38
VID28P40547 HUA1YGR268C 597 nt12.65□□□□□ -0.38
VID28P40547 AQY1YPR192W 918 nt12.65□□□□□ -0.38
VID28P40547 HEM12YDR047W 1089 nt12.62□□□□□ -0.39
VID28P40547 DDR2YOL052C-A 186 nt12.62□□□□□ -0.39
VID28P40547 SPT8YLR055C 1809 nt12.61□□□□□ -0.39
VID28P40547 SPC25YER018C 666 nt12.61□□□□□ -0.39
VID28P40547 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.6□□□□□ -0.39
VID28P40547 STB1YNL309W 1263 nt12.6□□□□□ -0.39
VID28P40547 YPR064WYPR064W 420 nt12.6□□□□□ -0.39
VID28P40547 ANP1YEL036C 1503 nt12.59□□□□□ -0.39
VID28P40547 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.58□□□□□ -0.4
VID28P40547 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.55□□□□□ -0.4
VID28P40547 TAD3YLR316C 969 nt12.55□□□□□ -0.4
VID28P40547 CCT4YDL143W 1587 nt12.52□□□□□ -0.41
VID28P40547 FEN2YCR028C 1539 nt12.51□□□□□ -0.41
VID28P40547 VPS60YDR486C 690 nt12.5□□□□□ -0.41
VID28P40547 GPI16YHR188C 1833 nt12.5□□□□□ -0.41
VID28P40547 ALG3YBL082C 1377 nt12.48□□□□□ -0.41
VID28P40547 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.48□□□□□ -0.41
VID28P40547 SWE1YJL187C 2460 nt12.45□□□□□ -0.42
VID28P40547 BDH1YAL060W 1149 nt12.45□□□□□ -0.42
VID28P40547 UBX6YJL048C 1191 nt12.43□□□□□ -0.42
VID28P40547 RAX1YOR301W 1308 nt12.4□□□□□ -0.42
VID28P40547 YIR016WYIR016W 798 nt12.4□□□□□ -0.42
VID28P40547 SWC5YBR231C 912 nt12.39□□□□□ -0.43
VID28P40547 MIC12YBR262C 321 nt12.37□□□□□ -0.43
VID28P40547 YSP3YOR003W 1437 nt12.35□□□□□ -0.43
VID28P40547 CCA1YER168C 1641 nt12.32□□□□□ -0.44
VID28P40547 YDR094WYDR094W 336 nt12.3□□□□□ -0.44
VID28P40547 YLR415CYLR415C 339 nt12.3□□□□□ -0.44
VID28P40547 BNA2YJR078W 1362 nt12.3□□□□□ -0.44
VID28P40547 YFR018CYFR018C 1092 nt12.26□□□□□ -0.45
VID28P40547 AGP1YCL025C 1902 nt12.25□□□□□ -0.45
VID28P40547 YFL066CYFL066C 1179 nt12.25□□□□□ -0.45
VID28P40547 PRE6YOL038W 765 nt12.25□□□□□ -0.45
VID28P40547 PEX25YPL112C 1185 nt12.23□□□□□ -0.45
VID28P40547 YNL115CYNL115C 1935 nt12.23□□□□□ -0.45
VID28P40547 HHO1YPL127C 777 nt12.19□□□□□ -0.46
VID28P40547 XDJ1YLR090W 1380 nt12.18□□□□□ -0.46
VID28P40547 SHM2YLR058C 1410 nt12.14□□□□□ -0.47
VID28P40547 YGR201CYGR201C 678 nt12.14□□□□□ -0.47
VID28P40547 DUT1YBR252W 444 nt12.12□□□□□ -0.47
VID28P40547 GDH3YAL062W 1374 nt12.09□□□□□ -0.47
VID28P40547 NIT1YIL164C 600 nt12.07□□□□□ -0.48
VID28P40547 TIM17YJL143W 477 nt12.07□□□□□ -0.48
VID28P40547 PAU16YKL224C 372 nt12.07□□□□□ -0.48
VID28P40547 FUR4YBR021W 1902 nt12.04□□□□□ -0.48
VID28P40547 VPS75YNL246W 795 nt12.04□□□□□ -0.48
VID28P40547 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.02□□□□□ -0.49
VID28P40547 RRT5YFR032C 870 nt12.02□□□□□ -0.49
VID28P40547 AVT6YER119C 1347 nt12.02□□□□□ -0.49
VID28P40547 SGT2YOR007C 1041 nt11.98□□□□□ -0.49
VID28P40547 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.95□□□□□ -0.5
VID28P40547 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.95□□□□□ -0.5
VID28P40547 HSP60YLR259C 1719 nt11.95□□□□□ -0.5
VID28P40547 DUS1YML080W 1272 nt11.94□□□□□ -0.5
VID28P40547 GOR1YNL274C 1053 nt11.94□□□□□ -0.5
VID28P40547 DAT1YML113W 747 nt11.92□□□□□ -0.5
VID28P40547 STR3YGL184C 1398 nt11.92□□□□□ -0.5
VID28P40547 YCL074WYCL074W 927 nt11.91□□□□□ -0.5
VID28P40547 MIR1YJR077C 936 nt11.9□□□□□ -0.5
VID28P40547 GLK1YCL040W 1503 nt11.9□□□□□ -0.5
VID28P40547 UME6YDR207C 2511 nt11.86□□□□□ -0.51
VID28P40547 BOR1YNL275W 1731 nt11.86□□□□□ -0.51
VID28P40547 YJL225CYJL225C 5277 nt11.85□□□□□ -0.51
VID28P40547 YDR010CYDR010C 333 nt11.82□□□□□ -0.52
VID28P40547 SHB17YKR043C 816 nt11.8□□□□□ -0.52
VID28P40547 AQY2YLL052C 450 nt11.8□□□□□ -0.52
VID28P40547 PAU7YAR020C 168 nt11.8□□□□□ -0.52
VID28P40547 YCR102CYCR102C 1107 nt11.79□□□□□ -0.52
VID28P40547 NBP35YGL091C 987 nt11.79□□□□□ -0.52
VID28P40547 YKR005CYKR005C 1578 nt11.77□□□□□ -0.53
VID28P40547 THI74YDR438W 1113 nt11.77□□□□□ -0.53
VID28P40547 PRP4YPR178W 1398 nt11.76□□□□□ -0.53
VID28P40547 UBA4YHR111W 1323 nt11.73□□□□□ -0.53
VID28P40547 NAT4YMR069W 858 nt11.73□□□□□ -0.53
VID28P40547 MSF1YPR047W 1410 nt11.71□□□□□ -0.53
VID28P40547 DPS1YLL018C 1674 nt11.71□□□□□ -0.54
VID28P40547 SHH4YLR164W 507 nt11.7□□□□□ -0.54
VID28P40547 YGR259CYGR259C 441 nt11.68□□□□□ -0.54
VID28P40547 SFA1YDL168W 1161 nt11.67□□□□□ -0.54
VID28P40547 RET2YFR051C 1641 nt11.67□□□□□ -0.54
VID28P40547 SBA1YKL117W 651 nt11.64□□□□□ -0.55
VID28P40547 TIR3YIL011W 810 nt11.62□□□□□ -0.55
VID28P40547 ARP6YLR085C 1317 nt11.61□□□□□ -0.55
VID28P40547 RTN2YDL204W 1182 nt11.61□□□□□ -0.55
VID28P40547 YSR3YKR053C 1215 nt11.61□□□□□ -0.55
VID28P40547 PHO89YBR296C 1725 nt11.6□□□□□ -0.55
VID28P40547 SNF1YDR477W 1902 nt11.6□□□□□ -0.55
VID28P40547 PLB1YMR008C 1995 nt11.58□□□□□ -0.56
VID28P40547 YGL034CYGL034C 366 nt11.58□□□□□ -0.56
VID28P40547 XYL2YLR070C 1071 nt11.57□□□□□ -0.56
VID28P40547 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.56□□□□□ -0.56
VID28P40547 BMT6YLR063W 1098 nt11.56□□□□□ -0.56
VID28P40547 POM34YLR018C 900 nt11.55□□□□□ -0.56
VID28P40547 AAC1YMR056C 930 nt11.55□□□□□ -0.56
VID28P40547 COQ2YNR041C 1119 nt11.54□□□□□ -0.56
VID28P40547 PRO1YDR300C 1287 nt11.53□□□□□ -0.56
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