Protein–RNA interactions for Protein: P40416

ATM1, Iron-sulfur clusters transporter ATM1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATM1P40416 YPR064WYPR064W 420 nt11.2□□□□□ -0.62
ATM1P40416 YFL067WYFL067W 528 nt11.18□□□□□ -0.62
ATM1P40416 DDR2YOL052C-A 186 nt11.17□□□□□ -0.62
ATM1P40416 MIC10YCL057C-A 294 nt11.16□□□□□ -0.62
ATM1P40416 SPC25YER018C 666 nt11.15□□□□□ -0.62
ATM1P40416 TAD3YLR316C 969 nt11.15□□□□□ -0.62
ATM1P40416 STB1YNL309W 1263 nt11.15□□□□□ -0.62
ATM1P40416 SNG1YGR197C 1644 nt11.14□□□□□ -0.63
ATM1P40416 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.14□□□□□ -0.63
ATM1P40416 HEM12YDR047W 1089 nt11.13□□□□□ -0.63
ATM1P40416 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.12□□□□□ -0.63
ATM1P40416 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.12□□□□□ -0.63
ATM1P40416 ANP1YEL036C 1503 nt11.1□□□□□ -0.63
ATM1P40416 YFL054CYFL054C 1941 nt11.09□□□□□ -0.63
ATM1P40416 UBX6YJL048C 1191 nt11.08□□□□□ -0.64
ATM1P40416 CCT4YDL143W 1587 nt11.07□□□□□ -0.64
ATM1P40416 VPS60YDR486C 690 nt11.06□□□□□ -0.64
ATM1P40416 GPI16YHR188C 1833 nt11.06□□□□□ -0.64
ATM1P40416 FEN2YCR028C 1539 nt11.04□□□□□ -0.64
ATM1P40416 YDR094WYDR094W 336 nt11.04□□□□□ -0.64
ATM1P40416 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.03□□□□□ -0.64
ATM1P40416 BDH1YAL060W 1149 nt11.03□□□□□ -0.64
ATM1P40416 ALG3YBL082C 1377 nt11.03□□□□□ -0.64
ATM1P40416 SPT8YLR055C 1809 nt11□□□□□ -0.65
ATM1P40416 SWC5YBR231C 912 nt10.98□□□□□ -0.65
ATM1P40416 YSP3YOR003W 1437 nt10.97□□□□□ -0.65
ATM1P40416 YFR018CYFR018C 1092 nt10.96□□□□□ -0.65
ATM1P40416 YIR016WYIR016W 798 nt10.95□□□□□ -0.66
ATM1P40416 YLR415CYLR415C 339 nt10.93□□□□□ -0.66
ATM1P40416 PRE6YOL038W 765 nt10.93□□□□□ -0.66
ATM1P40416 RAX1YOR301W 1308 nt10.9□□□□□ -0.66
ATM1P40416 YFL066CYFL066C 1179 nt10.9□□□□□ -0.66
ATM1P40416 PEX25YPL112C 1185 nt10.89□□□□□ -0.67
ATM1P40416 MIC12YBR262C 321 nt10.89□□□□□ -0.67
ATM1P40416 YJL225CYJL225C 5277 nt10.88□□□□□ -0.67
ATM1P40416 YNL115CYNL115C 1935 nt10.88□□□□□ -0.67
ATM1P40416 SWE1YJL187C 2460 nt10.87□□□□□ -0.67
ATM1P40416 BNA2YJR078W 1362 nt10.86□□□□□ -0.67
ATM1P40416 PAU16YKL224C 372 nt10.82□□□□□ -0.68
ATM1P40416 CCA1YER168C 1641 nt10.8□□□□□ -0.68
ATM1P40416 RRT5YFR032C 870 nt10.78□□□□□ -0.68
ATM1P40416 XDJ1YLR090W 1380 nt10.77□□□□□ -0.69
ATM1P40416 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.75□□□□□ -0.69
ATM1P40416 AGP1YCL025C 1902 nt10.74□□□□□ -0.69
ATM1P40416 HHO1YPL127C 777 nt10.74□□□□□ -0.69
ATM1P40416 SHM2YLR058C 1410 nt10.74□□□□□ -0.69
ATM1P40416 YGR201CYGR201C 678 nt10.71□□□□□ -0.69
ATM1P40416 TIM17YJL143W 477 nt10.71□□□□□ -0.69
ATM1P40416 VPS75YNL246W 795 nt10.71□□□□□ -0.69
ATM1P40416 GDH3YAL062W 1374 nt10.69□□□□□ -0.7
ATM1P40416 NIT1YIL164C 600 nt10.66□□□□□ -0.7
ATM1P40416 DUT1YBR252W 444 nt10.64□□□□□ -0.71
ATM1P40416 SGT2YOR007C 1041 nt10.62□□□□□ -0.71
ATM1P40416 AVT6YER119C 1347 nt10.61□□□□□ -0.71
ATM1P40416 MIR1YJR077C 936 nt10.61□□□□□ -0.71
ATM1P40416 GOR1YNL274C 1053 nt10.55□□□□□ -0.72
ATM1P40416 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.54□□□□□ -0.72
ATM1P40416 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.54□□□□□ -0.72
ATM1P40416 DAT1YML113W 747 nt10.53□□□□□ -0.72
ATM1P40416 GLK1YCL040W 1503 nt10.53□□□□□ -0.72
ATM1P40416 PAU7YAR020C 168 nt10.52□□□□□ -0.73
ATM1P40416 FUR4YBR021W 1902 nt10.51□□□□□ -0.73
ATM1P40416 THI74YDR438W 1113 nt10.51□□□□□ -0.73
ATM1P40416 DUS1YML080W 1272 nt10.51□□□□□ -0.73
ATM1P40416 NAT4YMR069W 858 nt10.51□□□□□ -0.73
ATM1P40416 YDR010CYDR010C 333 nt10.49□□□□□ -0.73
ATM1P40416 SHB17YKR043C 816 nt10.49□□□□□ -0.73
ATM1P40416 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.48□□□□□ -0.73
ATM1P40416 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.48□□□□□ -0.73
ATM1P40416 MSF1YPR047W 1410 nt10.48□□□□□ -0.73
ATM1P40416 STR3YGL184C 1398 nt10.46□□□□□ -0.74
ATM1P40416 YCL074WYCL074W 927 nt10.45□□□□□ -0.74
ATM1P40416 UBA4YHR111W 1323 nt10.44□□□□□ -0.74
ATM1P40416 YCR102CYCR102C 1107 nt10.43□□□□□ -0.74
ATM1P40416 HSP60YLR259C 1719 nt10.39□□□□□ -0.75
ATM1P40416 NBP35YGL091C 987 nt10.39□□□□□ -0.75
ATM1P40416 AQY2YLL052C 450 nt10.39□□□□□ -0.75
ATM1P40416 RET2YFR051C 1641 nt10.38□□□□□ -0.75
ATM1P40416 YSR3YKR053C 1215 nt10.36□□□□□ -0.75
ATM1P40416 SBA1YKL117W 651 nt10.34□□□□□ -0.75
ATM1P40416 SHH4YLR164W 507 nt10.34□□□□□ -0.75
ATM1P40416 YGL034CYGL034C 366 nt10.33□□□□□ -0.76
ATM1P40416 PHO89YBR296C 1725 nt10.33□□□□□ -0.76
ATM1P40416 SFA1YDL168W 1161 nt10.32□□□□□ -0.76
ATM1P40416 XYL2YLR070C 1071 nt10.31□□□□□ -0.76
ATM1P40416 BOR1YNL275W 1731 nt10.28□□□□□ -0.76
ATM1P40416 YKR005CYKR005C 1578 nt10.28□□□□□ -0.76
ATM1P40416 UME6YDR207C 2511 nt10.27□□□□□ -0.77
ATM1P40416 TIR3YIL011W 810 nt10.27□□□□□ -0.77
ATM1P40416 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.26□□□□□ -0.77
ATM1P40416 PRP4YPR178W 1398 nt10.26□□□□□ -0.77
ATM1P40416 COQ2YNR041C 1119 nt10.25□□□□□ -0.77
ATM1P40416 YGR259CYGR259C 441 nt10.23□□□□□ -0.77
ATM1P40416 YCR087WYCR087W 516 nt10.22□□□□□ -0.77
ATM1P40416 RTN2YDL204W 1182 nt10.22□□□□□ -0.77
ATM1P40416 ARP6YLR085C 1317 nt10.21□□□□□ -0.78
ATM1P40416 DPS1YLL018C 1674 nt10.21□□□□□ -0.78
ATM1P40416 POM34YLR018C 900 nt10.2□□□□□ -0.78
ATM1P40416 AIM45YPR004C 1035 nt10.2□□□□□ -0.78
ATM1P40416 RBG1YAL036C 1110 nt10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.9 ms