Protein–RNA interactions for Protein: P40215

NDE1, External NADH-ubiquinone oxidoreductase 1, mitochondrial, yeastyeast

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Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDE1P40215 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.62□□□□□ -0.71
NDE1P40215 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.62□□□□□ -0.71
NDE1P40215 CRR1YLR213C 1269 nt10.61□□□□□ -0.71
NDE1P40215 UME6YDR207C 2511 nt10.61□□□□□ -0.71
NDE1P40215 ATF2YGR177C 1608 nt10.6□□□□□ -0.71
NDE1P40215 AHT1YHR093W 549 nt10.6□□□□□ -0.71
NDE1P40215 DDR2YOL052C-A 186 nt10.6□□□□□ -0.71
NDE1P40215 WSC2YNL283C 1512 nt10.59□□□□□ -0.71
NDE1P40215 LYS4YDR234W 2082 nt10.59□□□□□ -0.71
NDE1P40215 BOR1YNL275W 1731 nt10.58□□□□□ -0.72
NDE1P40215 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.58□□□□□ -0.72
NDE1P40215 TAD3YLR316C 969 nt10.57□□□□□ -0.72
NDE1P40215 STB1YNL309W 1263 nt10.55□□□□□ -0.72
NDE1P40215 HEM12YDR047W 1089 nt10.53□□□□□ -0.72
NDE1P40215 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.53□□□□□ -0.72
NDE1P40215 SPC25YER018C 666 nt10.53□□□□□ -0.72
NDE1P40215 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.52□□□□□ -0.73
NDE1P40215 GPI16YHR188C 1833 nt10.51□□□□□ -0.73
NDE1P40215 SNG1YGR197C 1644 nt10.5□□□□□ -0.73
NDE1P40215 CCT4YDL143W 1587 nt10.48□□□□□ -0.73
NDE1P40215 YDR094WYDR094W 336 nt10.47□□□□□ -0.73
NDE1P40215 MIC10YCL057C-A 294 nt10.47□□□□□ -0.73
NDE1P40215 ANP1YEL036C 1503 nt10.46□□□□□ -0.74
NDE1P40215 YFL054CYFL054C 1941 nt10.45□□□□□ -0.74
NDE1P40215 UBX6YJL048C 1191 nt10.45□□□□□ -0.74
NDE1P40215 FEN2YCR028C 1539 nt10.44□□□□□ -0.74
NDE1P40215 VPS60YDR486C 690 nt10.44□□□□□ -0.74
NDE1P40215 SWC5YBR231C 912 nt10.44□□□□□ -0.74
NDE1P40215 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.39□□□□□ -0.75
NDE1P40215 BDH1YAL060W 1149 nt10.39□□□□□ -0.75
NDE1P40215 YLR415CYLR415C 339 nt10.39□□□□□ -0.75
NDE1P40215 YFR018CYFR018C 1092 nt10.36□□□□□ -0.75
NDE1P40215 ALG3YBL082C 1377 nt10.36□□□□□ -0.75
NDE1P40215 SPT8YLR055C 1809 nt10.35□□□□□ -0.75
NDE1P40215 BNA2YJR078W 1362 nt10.35□□□□□ -0.75
NDE1P40215 RAX1YOR301W 1308 nt10.34□□□□□ -0.75
NDE1P40215 YIR016WYIR016W 798 nt10.34□□□□□ -0.75
NDE1P40215 YSP3YOR003W 1437 nt10.33□□□□□ -0.76
NDE1P40215 MCH5YOR306C 1566 nt10.31□□□□□ -0.76
NDE1P40215 PEX25YPL112C 1185 nt10.31□□□□□ -0.76
NDE1P40215 RRT5YFR032C 870 nt10.29□□□□□ -0.76
NDE1P40215 SSN3YPL042C 1668 nt10.28□□□□□ -0.76
NDE1P40215 YNL115CYNL115C 1935 nt10.27□□□□□ -0.76
NDE1P40215 BSP1YPR171W 1731 nt10.27□□□□□ -0.77
NDE1P40215 YFL066CYFL066C 1179 nt10.26□□□□□ -0.77
NDE1P40215 MIC12YBR262C 321 nt10.26□□□□□ -0.77
NDE1P40215 PRE6YOL038W 765 nt10.25□□□□□ -0.77
NDE1P40215 HSP60YLR259C 1719 nt10.23□□□□□ -0.77
NDE1P40215 PAU16YKL224C 372 nt10.21□□□□□ -0.77
NDE1P40215 SWE1YJL187C 2460 nt10.2□□□□□ -0.78
NDE1P40215 ALG12YNR030W 1656 nt10.2□□□□□ -0.78
NDE1P40215 HHO1YPL127C 777 nt10.2□□□□□ -0.78
NDE1P40215 TIM17YJL143W 477 nt10.19□□□□□ -0.78
NDE1P40215 XDJ1YLR090W 1380 nt10.18□□□□□ -0.78
NDE1P40215 YGR201CYGR201C 678 nt10.17□□□□□ -0.78
NDE1P40215 VPS75YNL246W 795 nt10.16□□□□□ -0.78
NDE1P40215 SHM2YLR058C 1410 nt10.14□□□□□ -0.79
NDE1P40215 CCA1YER168C 1641 nt10.14□□□□□ -0.79
NDE1P40215 GDH3YAL062W 1374 nt10.13□□□□□ -0.79
NDE1P40215 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.11□□□□□ -0.79
NDE1P40215 PAU7YAR020C 168 nt10.07□□□□□ -0.8
NDE1P40215 AVT6YER119C 1347 nt10.07□□□□□ -0.8
NDE1P40215 GLK1YCL040W 1503 nt10.06□□□□□ -0.8
NDE1P40215 AGP1YCL025C 1902 nt10.04□□□□□ -0.8
NDE1P40215 NAT4YMR069W 858 nt10.04□□□□□ -0.8
NDE1P40215 GOR1YNL274C 1053 nt10.04□□□□□ -0.8
NDE1P40215 NIT1YIL164C 600 nt10.02□□□□□ -0.81
NDE1P40215 SGT2YOR007C 1041 nt10.02□□□□□ -0.81
NDE1P40215 MIR1YJR077C 936 nt10□□□□□ -0.81
NDE1P40215 DUS1YML080W 1272 nt9.99□□□□□ -0.81
NDE1P40215 THI74YDR438W 1113 nt9.98□□□□□ -0.81
NDE1P40215 DAT1YML113W 747 nt9.96□□□□□ -0.82
NDE1P40215 DUT1YBR252W 444 nt9.95□□□□□ -0.82
NDE1P40215 MSF1YPR047W 1410 nt9.94□□□□□ -0.82
NDE1P40215 NAR1YNL240C 1476 nt9.93□□□□□ -0.82
NDE1P40215 SHB17YKR043C 816 nt9.92□□□□□ -0.82
NDE1P40215 YCR102CYCR102C 1107 nt9.91□□□□□ -0.82
NDE1P40215 UBA4YHR111W 1323 nt9.89□□□□□ -0.83
NDE1P40215 YCL074WYCL074W 927 nt9.89□□□□□ -0.83
NDE1P40215 FUR4YBR021W 1902 nt9.89□□□□□ -0.83
NDE1P40215 YDR010CYDR010C 333 nt9.86□□□□□ -0.83
NDE1P40215 YSR3YKR053C 1215 nt9.85□□□□□ -0.83
NDE1P40215 STR3YGL184C 1398 nt9.85□□□□□ -0.83
NDE1P40215 AQY2YLL052C 450 nt9.84□□□□□ -0.83
NDE1P40215 AAC1YMR056C 930 nt9.82□□□□□ -0.84
NDE1P40215 RET2YFR051C 1641 nt9.82□□□□□ -0.84
NDE1P40215 PRP4YPR178W 1398 nt9.81□□□□□ -0.84
NDE1P40215 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.8□□□□□ -0.84
NDE1P40215 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.8□□□□□ -0.84
NDE1P40215 PHO89YBR296C 1725 nt9.8□□□□□ -0.84
NDE1P40215 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.8□□□□□ -0.84
NDE1P40215 YGL034CYGL034C 366 nt9.8□□□□□ -0.84
NDE1P40215 NBP35YGL091C 987 nt9.79□□□□□ -0.84
NDE1P40215 YCR087WYCR087W 516 nt9.78□□□□□ -0.84
NDE1P40215 DPS1YLL018C 1674 nt9.76□□□□□ -0.85
NDE1P40215 XYL2YLR070C 1071 nt9.75□□□□□ -0.85
NDE1P40215 TIR3YIL011W 810 nt9.73□□□□□ -0.85
NDE1P40215 BIO5YNR056C 1686 nt9.72□□□□□ -0.85
NDE1P40215 MRP20YDR405W 792 nt9.72□□□□□ -0.85
NDE1P40215 SBA1YKL117W 651 nt9.72□□□□□ -0.85
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