Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fen1P39749 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fen1P39749 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fen1P39749 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fen1P39749 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fen1P39749 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fen1P39749 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fen1P39749 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fen1P39749 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fen1P39749 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fen1P39749 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fen1P39749 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fen1P39749 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fen1P39749 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fen1P39749 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fen1P39749 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fen1P39749 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fen1P39749 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fen1P39749 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fen1P39749 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fen1P39749 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fen1P39749 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fen1P39749 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fen1P39749 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fen1P39749 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fen1P39749 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fen1P39749 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fen1P39749 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fen1P39749 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fen1P39749 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fen1P39749 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fen1P39749 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Fen1P39749 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fen1P39749 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fen1P39749 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fen1P39749 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Fen1P39749 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fen1P39749 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fen1P39749 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fen1P39749 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fen1P39749 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fen1P39749 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fen1P39749 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Fen1P39749 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fen1P39749 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fen1P39749 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Fen1P39749 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fen1P39749 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fen1P39749 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fen1P39749 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fen1P39749 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fen1P39749 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fen1P39749 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fen1P39749 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fen1P39749 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fen1P39749 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fen1P39749 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fen1P39749 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fen1P39749 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fen1P39749 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fen1P39749 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fen1P39749 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fen1P39749 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fen1P39749 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fen1P39749 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fen1P39749 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fen1P39749 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fen1P39749 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fen1P39749 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fen1P39749 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fen1P39749 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fen1P39749 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fen1P39749 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fen1P39749 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fen1P39749 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fen1P39749 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fen1P39749 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fen1P39749 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fen1P39749 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fen1P39749 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fen1P39749 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fen1P39749 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fen1P39749 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fen1P39749 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fen1P39749 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fen1P39749 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fen1P39749 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fen1P39749 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fen1P39749 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fen1P39749 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fen1P39749 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fen1P39749 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fen1P39749 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fen1P39749 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fen1P39749 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fen1P39749 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fen1P39749 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fen1P39749 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fen1P39749 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fen1P39749 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms