Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 GAL1YBR020W 1587 nt10.28□□□□□ -0.76
YAR028WP39548 FUR4YBR021W 1902 nt10.28□□□□□ -0.76
YAR028WP39548 CCA1YER168C 1641 nt10.28□□□□□ -0.76
YAR028WP39548 TRM5YHR070W 1500 nt10.28□□□□□ -0.76
YAR028WP39548 DDR2YOL052C-A 186 nt10.26□□□□□ -0.77
YAR028WP39548 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.22□□□□□ -0.77
YAR028WP39548 ANP1YEL036C 1503 nt10.19□□□□□ -0.78
YAR028WP39548 AQY1YPR192W 918 nt10.19□□□□□ -0.78
YAR028WP39548 ALG12YNR030W 1656 nt10.18□□□□□ -0.78
YAR028WP39548 PAU21YOR394W 495 nt10.18□□□□□ -0.78
YAR028WP39548 PAU22YPL282C 495 nt10.18□□□□□ -0.78
YAR028WP39548 UME6YDR207C 2511 nt10.18□□□□□ -0.78
YAR028WP39548 BNA2YJR078W 1362 nt10.14□□□□□ -0.79
YAR028WP39548 PRP4YPR178W 1398 nt10.14□□□□□ -0.79
YAR028WP39548 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.12□□□□□ -0.79
YAR028WP39548 YEL076CYEL076C 651 nt10.12□□□□□ -0.79
YAR028WP39548 YLR464WYLR464W 651 nt10.12□□□□□ -0.79
YAR028WP39548 STB1YNL309W 1263 nt10.12□□□□□ -0.79
YAR028WP39548 MET8YBR213W 825 nt10.12□□□□□ -0.79
YAR028WP39548 MIC12YBR262C 321 nt10.12□□□□□ -0.79
YAR028WP39548 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.11□□□□□ -0.79
YAR028WP39548 SPC25YER018C 666 nt10.11□□□□□ -0.79
YAR028WP39548 PTH1YHR189W 573 nt10.11□□□□□ -0.79
YAR028WP39548 YLR235CYLR235C 399 nt10.1□□□□□ -0.79
YAR028WP39548 TIM23YNR017W 669 nt10.09□□□□□ -0.79
YAR028WP39548 FEN2YCR028C 1539 nt10.08□□□□□ -0.8
YAR028WP39548 ARO7YPR060C 771 nt10.08□□□□□ -0.8
YAR028WP39548 DPS1YLL018C 1674 nt10.07□□□□□ -0.8
YAR028WP39548 AAC1YMR056C 930 nt10.07□□□□□ -0.8
YAR028WP39548 GPI16YHR188C 1833 nt10.06□□□□□ -0.8
YAR028WP39548 YLR179CYLR179C 606 nt10.06□□□□□ -0.8
YAR028WP39548 AGP1YCL025C 1902 nt10.05□□□□□ -0.8
YAR028WP39548 WSC2YNL283C 1512 nt10.05□□□□□ -0.8
YAR028WP39548 SPP1YPL138C 1062 nt10.04□□□□□ -0.8
YAR028WP39548 MCH5YOR306C 1566 nt10.04□□□□□ -0.8
YAR028WP39548 YKR005CYKR005C 1578 nt10.02□□□□□ -0.81
YAR028WP39548 YIR016WYIR016W 798 nt10.01□□□□□ -0.81
YAR028WP39548 BMT6YLR063W 1098 nt10.01□□□□□ -0.81
YAR028WP39548 HHO1YPL127C 777 nt10.01□□□□□ -0.81
YAR028WP39548 YCL074WYCL074W 927 nt10□□□□□ -0.81
YAR028WP39548 VPS60YDR486C 690 nt10□□□□□ -0.81
YAR028WP39548 CLB6YGR109C 1143 nt10□□□□□ -0.81
YAR028WP39548 AHT1YHR093W 549 nt9.99□□□□□ -0.81
YAR028WP39548 DUS1YML080W 1272 nt9.99□□□□□ -0.81
YAR028WP39548 CCT4YDL143W 1587 nt9.99□□□□□ -0.81
YAR028WP39548 ALG3YBL082C 1377 nt9.95□□□□□ -0.82
YAR028WP39548 YGR201CYGR201C 678 nt9.94□□□□□ -0.82
YAR028WP39548 YKL030WYKL030W 606 nt9.94□□□□□ -0.82
YAR028WP39548 XDJ1YLR090W 1380 nt9.93□□□□□ -0.82
YAR028WP39548 YGR259CYGR259C 441 nt9.93□□□□□ -0.82
YAR028WP39548 SWC5YBR231C 912 nt9.92□□□□□ -0.82
YAR028WP39548 SNF1YDR477W 1902 nt9.92□□□□□ -0.82
YAR028WP39548 YPR064WYPR064W 420 nt9.9□□□□□ -0.82
YAR028WP39548 BIO5YNR056C 1686 nt9.9□□□□□ -0.83
YAR028WP39548 NAR1YNL240C 1476 nt9.89□□□□□ -0.83
YAR028WP39548 IRC24YIR036C 792 nt9.88□□□□□ -0.83
YAR028WP39548 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.86□□□□□ -0.83
YAR028WP39548 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.86□□□□□ -0.83
YAR028WP39548 STR3YGL184C 1398 nt9.85□□□□□ -0.83
YAR028WP39548 TAD3YLR316C 969 nt9.84□□□□□ -0.83
YAR028WP39548 DUT1YBR252W 444 nt9.83□□□□□ -0.84
YAR028WP39548 PBP1YGR178C 2169 nt9.79□□□□□ -0.84
YAR028WP39548 AVT6YER119C 1347 nt9.79□□□□□ -0.84
YAR028WP39548 CYT2YKL087C 675 nt9.78□□□□□ -0.84
YAR028WP39548 GDH3YAL062W 1374 nt9.77□□□□□ -0.84
YAR028WP39548 GOR1YNL274C 1053 nt9.77□□□□□ -0.85
YAR028WP39548 AQY2YLL052C 450 nt9.75□□□□□ -0.85
YAR028WP39548 BDH1YAL060W 1149 nt9.73□□□□□ -0.85
YAR028WP39548 RTN2YDL204W 1182 nt9.72□□□□□ -0.85
YAR028WP39548 REG2YBR050C 1017 nt9.71□□□□□ -0.86
YAR028WP39548 YLR415CYLR415C 339 nt9.7□□□□□ -0.86
YAR028WP39548 RTG1YOL067C 534 nt9.7□□□□□ -0.86
YAR028WP39548 SHM2YLR058C 1410 nt9.68□□□□□ -0.86
YAR028WP39548 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt9.66□□□□□ -0.86
YAR028WP39548 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.65□□□□□ -0.86
YAR028WP39548 TIM17YJL143W 477 nt9.63□□□□□ -0.87
YAR028WP39548 DAT1YML113W 747 nt9.62□□□□□ -0.87
YAR028WP39548 YSP3YOR003W 1437 nt9.61□□□□□ -0.87
YAR028WP39548 NIT1YIL164C 600 nt9.59□□□□□ -0.87
YAR028WP39548 PAM17YKR065C 594 nt9.56□□□□□ -0.88
YAR028WP39548 NBP35YGL091C 987 nt9.55□□□□□ -0.88
YAR028WP39548 YJR154WYJR154W 1041 nt9.55□□□□□ -0.88
YAR028WP39548 YCR102CYCR102C 1107 nt9.54□□□□□ -0.88
YAR028WP39548 ARP6YLR085C 1317 nt9.54□□□□□ -0.88
YAR028WP39548 PLB1YMR008C 1995 nt9.53□□□□□ -0.88
YAR028WP39548 HUA1YGR268C 597 nt9.52□□□□□ -0.89
YAR028WP39548 SGT2YOR007C 1041 nt9.52□□□□□ -0.89
YAR028WP39548 CMP2YML057W 1815 nt9.51□□□□□ -0.89
YAR028WP39548 YAT1YAR035W 2064 nt9.51□□□□□ -0.89
YAR028WP39548 ARA2YMR041C 1008 nt9.49□□□□□ -0.89
YAR028WP39548 YNL115CYNL115C 1935 nt9.48□□□□□ -0.89
YAR028WP39548 HIF1YLL022C 1158 nt9.46□□□□□ -0.9
YAR028WP39548 PRM5YIL117C 957 nt9.45□□□□□ -0.9
YAR028WP39548 Q0010Q0010 387 nt9.45□□□□□ -0.9
YAR028WP39548 NDI1YML120C 1542 nt9.45□□□□□ -0.9
YAR028WP39548 YLR122CYLR122C 378 nt9.44□□□□□ -0.9
YAR028WP39548 PEX25YPL112C 1185 nt9.44□□□□□ -0.9
YAR028WP39548 ALD4YOR374W 1560 nt9.44□□□□□ -0.9
YAR028WP39548 VPS75YNL246W 795 nt9.41□□□□□ -0.9
YAR028WP39548 UTR1YJR049C 1593 nt9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.5 ms