Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdh4P39038 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh4P39038 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh4P39038 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh4P39038 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdh4P39038 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdh4P39038 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh4P39038 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh4P39038 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdh4P39038 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh4P39038 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh4P39038 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh4P39038 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh4P39038 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh4P39038 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh4P39038 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh4P39038 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdh4P39038 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdh4P39038 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdh4P39038 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh4P39038 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh4P39038 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh4P39038 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdh4P39038 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdh4P39038 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh4P39038 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh4P39038 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh4P39038 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh4P39038 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh4P39038 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh4P39038 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh4P39038 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh4P39038 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh4P39038 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh4P39038 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh4P39038 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh4P39038 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh4P39038 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh4P39038 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh4P39038 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh4P39038 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh4P39038 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh4P39038 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh4P39038 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh4P39038 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdh4P39038 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdh4P39038 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh4P39038 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh4P39038 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdh4P39038 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdh4P39038 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdh4P39038 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdh4P39038 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdh4P39038 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdh4P39038 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdh4P39038 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdh4P39038 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh4P39038 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh4P39038 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh4P39038 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh4P39038 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh4P39038 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh4P39038 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh4P39038 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdh4P39038 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh4P39038 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh4P39038 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh4P39038 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh4P39038 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh4P39038 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh4P39038 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh4P39038 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh4P39038 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh4P39038 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh4P39038 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh4P39038 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh4P39038 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh4P39038 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh4P39038 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdh4P39038 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdh4P39038 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh4P39038 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh4P39038 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh4P39038 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh4P39038 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh4P39038 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh4P39038 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh4P39038 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh4P39038 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh4P39038 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh4P39038 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh4P39038 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh4P39038 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh4P39038 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh4P39038 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh4P39038 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh4P39038 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh4P39038 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh4P39038 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh4P39038 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms