Protein–RNA interactions for Protein: P38798

NMD2, Nonsense-mediated mRNA decay protein 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD2P38798 AHT1YHR093W 549 nt13.26□□□□□ -0.29
NMD2P38798 UME6YDR207C 2511 nt13.24□□□□□ -0.29
NMD2P38798 DDR2YOL052C-A 186 nt13.22□□□□□ -0.29
NMD2P38798 YPR064WYPR064W 420 nt13.22□□□□□ -0.29
NMD2P38798 MIC10YCL057C-A 294 nt13.22□□□□□ -0.29
NMD2P38798 YFL054CYFL054C 1941 nt13.21□□□□□ -0.29
NMD2P38798 SNG1YGR197C 1644 nt13.21□□□□□ -0.3
NMD2P38798 HEM12YDR047W 1089 nt13.2□□□□□ -0.3
NMD2P38798 STB1YNL309W 1263 nt13.19□□□□□ -0.3
NMD2P38798 SPC25YER018C 666 nt13.18□□□□□ -0.3
NMD2P38798 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.17□□□□□ -0.3
NMD2P38798 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.16□□□□□ -0.3
NMD2P38798 TAD3YLR316C 969 nt13.16□□□□□ -0.3
NMD2P38798 ANP1YEL036C 1503 nt13.14□□□□□ -0.31
NMD2P38798 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.13□□□□□ -0.31
NMD2P38798 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt13.12□□□□□ -0.31
NMD2P38798 YJL225CYJL225C 5277 nt13.12□□□□□ -0.31
NMD2P38798 GPI16YHR188C 1833 nt13.11□□□□□ -0.31
NMD2P38798 SPT8YLR055C 1809 nt13.1□□□□□ -0.31
NMD2P38798 CCT4YDL143W 1587 nt13.1□□□□□ -0.31
NMD2P38798 VPS60YDR486C 690 nt13.07□□□□□ -0.32
NMD2P38798 FEN2YCR028C 1539 nt13.07□□□□□ -0.32
NMD2P38798 ALG3YBL082C 1377 nt13.03□□□□□ -0.32
NMD2P38798 BDH1YAL060W 1149 nt13□□□□□ -0.33
NMD2P38798 SWC5YBR231C 912 nt13□□□□□ -0.33
NMD2P38798 RAX1YOR301W 1308 nt12.98□□□□□ -0.33
NMD2P38798 SWE1YJL187C 2460 nt12.95□□□□□ -0.34
NMD2P38798 YIR016WYIR016W 798 nt12.94□□□□□ -0.34
NMD2P38798 YDR094WYDR094W 336 nt12.93□□□□□ -0.34
NMD2P38798 YLR415CYLR415C 339 nt12.92□□□□□ -0.34
NMD2P38798 MIC12YBR262C 321 nt12.92□□□□□ -0.34
NMD2P38798 YSP3YOR003W 1437 nt12.91□□□□□ -0.34
NMD2P38798 BNA2YJR078W 1362 nt12.91□□□□□ -0.34
NMD2P38798 UBX6YJL048C 1191 nt12.9□□□□□ -0.34
NMD2P38798 YFR018CYFR018C 1092 nt12.87□□□□□ -0.35
NMD2P38798 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.85□□□□□ -0.35
NMD2P38798 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.85□□□□□ -0.35
NMD2P38798 PEX25YPL112C 1185 nt12.84□□□□□ -0.35
NMD2P38798 CCA1YER168C 1641 nt12.84□□□□□ -0.35
NMD2P38798 YNL115CYNL115C 1935 nt12.81□□□□□ -0.36
NMD2P38798 PRE6YOL038W 765 nt12.8□□□□□ -0.36
NMD2P38798 YFL066CYFL066C 1179 nt12.79□□□□□ -0.36
NMD2P38798 BOR1YNL275W 1731 nt12.75□□□□□ -0.37
NMD2P38798 XDJ1YLR090W 1380 nt12.74□□□□□ -0.37
NMD2P38798 HHO1YPL127C 777 nt12.74□□□□□ -0.37
NMD2P38798 AGP1YCL025C 1902 nt12.73□□□□□ -0.37
NMD2P38798 YGR201CYGR201C 678 nt12.73□□□□□ -0.37
NMD2P38798 SHM2YLR058C 1410 nt12.69□□□□□ -0.38
NMD2P38798 PAU16YKL224C 372 nt12.68□□□□□ -0.38
NMD2P38798 RRT5YFR032C 870 nt12.67□□□□□ -0.38
NMD2P38798 TIM17YJL143W 477 nt12.67□□□□□ -0.38
NMD2P38798 VPS75YNL246W 795 nt12.65□□□□□ -0.38
NMD2P38798 GDH3YAL062W 1374 nt12.65□□□□□ -0.38
NMD2P38798 MCH5YOR306C 1566 nt12.6□□□□□ -0.39
NMD2P38798 NIT1YIL164C 600 nt12.59□□□□□ -0.39
NMD2P38798 DUT1YBR252W 444 nt12.58□□□□□ -0.4
NMD2P38798 AVT6YER119C 1347 nt12.58□□□□□ -0.4
NMD2P38798 SGT2YOR007C 1041 nt12.54□□□□□ -0.4
NMD2P38798 FUR4YBR021W 1902 nt12.53□□□□□ -0.4
NMD2P38798 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.52□□□□□ -0.41
NMD2P38798 DUS1YML080W 1272 nt12.51□□□□□ -0.41
NMD2P38798 GOR1YNL274C 1053 nt12.51□□□□□ -0.41
NMD2P38798 DAT1YML113W 747 nt12.49□□□□□ -0.41
NMD2P38798 MIR1YJR077C 936 nt12.47□□□□□ -0.41
NMD2P38798 YCL074WYCL074W 927 nt12.45□□□□□ -0.42
NMD2P38798 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.42□□□□□ -0.42
NMD2P38798 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.42□□□□□ -0.42
NMD2P38798 PAU7YAR020C 168 nt12.42□□□□□ -0.42
NMD2P38798 HSP60YLR259C 1719 nt12.42□□□□□ -0.42
NMD2P38798 STR3YGL184C 1398 nt12.41□□□□□ -0.42
NMD2P38798 GLK1YCL040W 1503 nt12.39□□□□□ -0.43
NMD2P38798 SHB17YKR043C 816 nt12.37□□□□□ -0.43
NMD2P38798 YCR102CYCR102C 1107 nt12.36□□□□□ -0.43
NMD2P38798 THI74YDR438W 1113 nt12.36□□□□□ -0.43
NMD2P38798 NAT4YMR069W 858 nt12.36□□□□□ -0.43
NMD2P38798 YDR010CYDR010C 333 nt12.35□□□□□ -0.43
NMD2P38798 AQY2YLL052C 450 nt12.33□□□□□ -0.44
NMD2P38798 MSF1YPR047W 1410 nt12.31□□□□□ -0.44
NMD2P38798 UBA4YHR111W 1323 nt12.3□□□□□ -0.44
NMD2P38798 NBP35YGL091C 987 nt12.29□□□□□ -0.44
NMD2P38798 ALG12YNR030W 1656 nt12.28□□□□□ -0.44
NMD2P38798 YKR005CYKR005C 1578 nt12.26□□□□□ -0.45
NMD2P38798 RPM1RPM1 483 nt12.25□□□□□ -0.45
NMD2P38798 PRP4YPR178W 1398 nt12.25□□□□□ -0.45
NMD2P38798 RET2YFR051C 1641 nt12.24□□□□□ -0.45
NMD2P38798 YSR3YKR053C 1215 nt12.21□□□□□ -0.45
NMD2P38798 YGR259CYGR259C 441 nt12.2□□□□□ -0.46
NMD2P38798 PHO89YBR296C 1725 nt12.18□□□□□ -0.46
NMD2P38798 RTN2YDL204W 1182 nt12.18□□□□□ -0.46
NMD2P38798 SHH4YLR164W 507 nt12.18□□□□□ -0.46
NMD2P38798 DPS1YLL018C 1674 nt12.18□□□□□ -0.46
NMD2P38798 SFA1YDL168W 1161 nt12.17□□□□□ -0.46
NMD2P38798 TIR3YIL011W 810 nt12.17□□□□□ -0.46
NMD2P38798 YGL034CYGL034C 366 nt12.15□□□□□ -0.46
NMD2P38798 FRE6YLL051C 2139 nt12.14□□□□□ -0.47
NMD2P38798 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.12□□□□□ -0.47
NMD2P38798 BMT6YLR063W 1098 nt12.12□□□□□ -0.47
NMD2P38798 XYL2YLR070C 1071 nt12.12□□□□□ -0.47
NMD2P38798 ARP6YLR085C 1317 nt12.11□□□□□ -0.47
NMD2P38798 YCR087WYCR087W 516 nt12.09□□□□□ -0.47
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