Protein–RNA interactions for Protein: P36166

PXL1, Paxillin-like protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PXL1P36166 YLR235CYLR235C 399 nt11.87□□□□□ -0.51
PXL1P36166 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.86□□□□□ -0.51
PXL1P36166 STB1YNL309W 1263 nt11.84□□□□□ -0.51
PXL1P36166 ANP1YEL036C 1503 nt11.82□□□□□ -0.52
PXL1P36166 HSP60YLR259C 1719 nt11.82□□□□□ -0.52
PXL1P36166 RTG1YOL067C 534 nt11.8□□□□□ -0.52
PXL1P36166 FEN2YCR028C 1539 nt11.8□□□□□ -0.52
PXL1P36166 MRPL8YJL063C 717 nt11.79□□□□□ -0.52
PXL1P36166 FUR4YBR021W 1902 nt11.78□□□□□ -0.52
PXL1P36166 YKL030WYKL030W 606 nt11.78□□□□□ -0.52
PXL1P36166 WSC2YNL283C 1512 nt11.77□□□□□ -0.52
PXL1P36166 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.77□□□□□ -0.53
PXL1P36166 YEL076CYEL076C 651 nt11.77□□□□□ -0.53
PXL1P36166 YLR464WYLR464W 651 nt11.77□□□□□ -0.53
PXL1P36166 BNA2YJR078W 1362 nt11.77□□□□□ -0.53
PXL1P36166 VPS60YDR486C 690 nt11.75□□□□□ -0.53
PXL1P36166 SPC25YER018C 666 nt11.75□□□□□ -0.53
PXL1P36166 AQY1YPR192W 918 nt11.74□□□□□ -0.53
PXL1P36166 GLK1YCL040W 1503 nt11.74□□□□□ -0.53
PXL1P36166 ALG3YBL082C 1377 nt11.73□□□□□ -0.53
PXL1P36166 AGP1YCL025C 1902 nt11.72□□□□□ -0.53
PXL1P36166 YIR016WYIR016W 798 nt11.72□□□□□ -0.53
PXL1P36166 CCT4YDL143W 1587 nt11.71□□□□□ -0.53
PXL1P36166 ADO1YJR105W 1023 nt11.71□□□□□ -0.53
PXL1P36166 GPI16YHR188C 1833 nt11.7□□□□□ -0.54
PXL1P36166 AHT1YHR093W 549 nt11.7□□□□□ -0.54
PXL1P36166 HHO1YPL127C 777 nt11.68□□□□□ -0.54
PXL1P36166 SWC5YBR231C 912 nt11.66□□□□□ -0.54
PXL1P36166 MIC12YBR262C 321 nt11.66□□□□□ -0.54
PXL1P36166 HUA1YGR268C 597 nt11.65□□□□□ -0.54
PXL1P36166 Q0182Q0182 405 nt11.65□□□□□ -0.54
PXL1P36166 DUS1YML080W 1272 nt11.65□□□□□ -0.54
PXL1P36166 YPR064WYPR064W 420 nt11.65□□□□□ -0.54
PXL1P36166 DUT1YBR252W 444 nt11.65□□□□□ -0.54
PXL1P36166 TAD3YLR316C 969 nt11.59□□□□□ -0.55
PXL1P36166 PRP4YPR178W 1398 nt11.56□□□□□ -0.56
PXL1P36166 XDJ1YLR090W 1380 nt11.51□□□□□ -0.57
PXL1P36166 DPS1YLL018C 1674 nt11.5□□□□□ -0.57
PXL1P36166 BDH1YAL060W 1149 nt11.49□□□□□ -0.57
PXL1P36166 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.47□□□□□ -0.57
PXL1P36166 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.47□□□□□ -0.57
PXL1P36166 YKR005CYKR005C 1578 nt11.47□□□□□ -0.57
PXL1P36166 GDH3YAL062W 1374 nt11.47□□□□□ -0.57
PXL1P36166 AVT6YER119C 1347 nt11.47□□□□□ -0.57
PXL1P36166 YCL074WYCL074W 927 nt11.47□□□□□ -0.57
PXL1P36166 YJL225CYJL225C 5277 nt11.46□□□□□ -0.57
PXL1P36166 AQY2YLL052C 450 nt11.44□□□□□ -0.58
PXL1P36166 STR3YGL184C 1398 nt11.43□□□□□ -0.58
PXL1P36166 ALG12YNR030W 1656 nt11.43□□□□□ -0.58
PXL1P36166 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.41□□□□□ -0.58
PXL1P36166 YGR201CYGR201C 678 nt11.41□□□□□ -0.58
PXL1P36166 YLR415CYLR415C 339 nt11.41□□□□□ -0.58
PXL1P36166 GOR1YNL274C 1053 nt11.4□□□□□ -0.58
PXL1P36166 SHM2YLR058C 1410 nt11.39□□□□□ -0.59
PXL1P36166 YGR259CYGR259C 441 nt11.38□□□□□ -0.59
PXL1P36166 AAC1YMR056C 930 nt11.38□□□□□ -0.59
PXL1P36166 SNF1YDR477W 1902 nt11.37□□□□□ -0.59
PXL1P36166 BMT6YLR063W 1098 nt11.35□□□□□ -0.59
PXL1P36166 UME6YDR207C 2511 nt11.35□□□□□ -0.59
PXL1P36166 YSP3YOR003W 1437 nt11.35□□□□□ -0.59
PXL1P36166 BIO5YNR056C 1686 nt11.32□□□□□ -0.6
PXL1P36166 MCH5YOR306C 1566 nt11.32□□□□□ -0.6
PXL1P36166 YFL066CYFL066C 1179 nt11.31□□□□□ -0.6
PXL1P36166 UBX6YJL048C 1191 nt11.3□□□□□ -0.6
PXL1P36166 YNL115CYNL115C 1935 nt11.29□□□□□ -0.6
PXL1P36166 YDR094WYDR094W 336 nt11.28□□□□□ -0.6
PXL1P36166 NIT1YIL164C 600 nt11.26□□□□□ -0.61
PXL1P36166 TIM17YJL143W 477 nt11.26□□□□□ -0.61
PXL1P36166 SGT2YOR007C 1041 nt11.23□□□□□ -0.61
PXL1P36166 NAR1YNL240C 1476 nt11.23□□□□□ -0.61
PXL1P36166 YFR018CYFR018C 1092 nt11.17□□□□□ -0.62
PXL1P36166 IRC24YIR036C 792 nt11.17□□□□□ -0.62
PXL1P36166 PEX25YPL112C 1185 nt11.16□□□□□ -0.62
PXL1P36166 PRE6YOL038W 765 nt11.15□□□□□ -0.62
PXL1P36166 NBP35YGL091C 987 nt11.11□□□□□ -0.63
PXL1P36166 RRT5YFR032C 870 nt11.1□□□□□ -0.63
PXL1P36166 DAT1YML113W 747 nt11.09□□□□□ -0.63
PXL1P36166 PLB1YMR008C 1995 nt11.08□□□□□ -0.64
PXL1P36166 YCR102CYCR102C 1107 nt11.08□□□□□ -0.64
PXL1P36166 RTN2YDL204W 1182 nt11.07□□□□□ -0.64
PXL1P36166 PBP1YGR178C 2169 nt11.06□□□□□ -0.64
PXL1P36166 PAU16YKL224C 372 nt11.05□□□□□ -0.64
PXL1P36166 SHH4YLR164W 507 nt11.04□□□□□ -0.64
PXL1P36166 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.04□□□□□ -0.64
PXL1P36166 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.04□□□□□ -0.64
PXL1P36166 VPS75YNL246W 795 nt11.01□□□□□ -0.65
PXL1P36166 PRM5YIL117C 957 nt11□□□□□ -0.65
PXL1P36166 CYT2YKL087C 675 nt10.98□□□□□ -0.65
PXL1P36166 PAU7YAR020C 168 nt10.97□□□□□ -0.65
PXL1P36166 ARP6YLR085C 1317 nt10.94□□□□□ -0.66
PXL1P36166 PRO1YDR300C 1287 nt10.92□□□□□ -0.66
PXL1P36166 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.92□□□□□ -0.66
PXL1P36166 UTR1YJR049C 1593 nt10.91□□□□□ -0.66
PXL1P36166 YAT1YAR035W 2064 nt10.91□□□□□ -0.66
PXL1P36166 YDR010CYDR010C 333 nt10.9□□□□□ -0.66
PXL1P36166 SHB17YKR043C 816 nt10.9□□□□□ -0.66
PXL1P36166 HIF1YLL022C 1158 nt10.89□□□□□ -0.67
PXL1P36166 SFA1YDL168W 1161 nt10.86□□□□□ -0.67
PXL1P36166 TIR3YIL011W 810 nt10.86□□□□□ -0.67
PXL1P36166 GAP1YKR039W 1809 nt10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.1 ms