Protein–RNA interactions for Protein: P36113

HEL1, E3 ubiquitin-protein ligase HEL1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEL1P36113 TAD3YLR316C 969 nt11.78□□□□□ -0.52
HEL1P36113 PRE6YOL038W 765 nt11.76□□□□□ -0.53
HEL1P36113 RRT5YFR032C 870 nt11.74□□□□□ -0.53
HEL1P36113 BIO4YNR057C 714 nt11.73□□□□□ -0.53
HEL1P36113 YLL053CYLL053C 459 nt11.72□□□□□ -0.53
HEL1P36113 AQY1YPR192W 918 nt11.69□□□□□ -0.54
HEL1P36113 HSP60YLR259C 1719 nt11.69□□□□□ -0.54
HEL1P36113 MCH5YOR306C 1566 nt11.68□□□□□ -0.54
HEL1P36113 FTR1YER145C 1215 nt11.68□□□□□ -0.54
HEL1P36113 SIM1YIL123W 1431 nt11.68□□□□□ -0.54
HEL1P36113 SWE1YJL187C 2460 nt11.66□□□□□ -0.54
HEL1P36113 GAL1YBR020W 1587 nt11.65□□□□□ -0.54
HEL1P36113 PEX25YPL112C 1185 nt11.62□□□□□ -0.55
HEL1P36113 ALG12YNR030W 1656 nt11.62□□□□□ -0.55
HEL1P36113 SBA1YKL117W 651 nt11.61□□□□□ -0.55
HEL1P36113 YJL225CYJL225C 5277 nt11.6□□□□□ -0.55
HEL1P36113 YFL066CYFL066C 1179 nt11.59□□□□□ -0.55
HEL1P36113 BDH1YAL060W 1149 nt11.59□□□□□ -0.55
HEL1P36113 TRM5YHR070W 1500 nt11.59□□□□□ -0.55
HEL1P36113 YSP3YOR003W 1437 nt11.58□□□□□ -0.56
HEL1P36113 SPC25YER018C 666 nt11.55□□□□□ -0.56
HEL1P36113 STB1YNL309W 1263 nt11.55□□□□□ -0.56
HEL1P36113 YNL115CYNL115C 1935 nt11.52□□□□□ -0.56
HEL1P36113 YLR415CYLR415C 339 nt11.52□□□□□ -0.57
HEL1P36113 CCT4YDL143W 1587 nt11.52□□□□□ -0.57
HEL1P36113 ATF2YGR177C 1608 nt11.52□□□□□ -0.57
HEL1P36113 ERF2YLR246W 1080 nt11.51□□□□□ -0.57
HEL1P36113 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.5□□□□□ -0.57
HEL1P36113 LYS4YDR234W 2082 nt11.5□□□□□ -0.57
HEL1P36113 GPI16YHR188C 1833 nt11.49□□□□□ -0.57
HEL1P36113 YFL067WYFL067W 528 nt11.48□□□□□ -0.57
HEL1P36113 CRR1YLR213C 1269 nt11.48□□□□□ -0.57
HEL1P36113 GLK1YCL040W 1503 nt11.48□□□□□ -0.57
HEL1P36113 DDR2YOL052C-A 186 nt11.47□□□□□ -0.57
HEL1P36113 VPS60YDR486C 690 nt11.45□□□□□ -0.58
HEL1P36113 NAT4YMR069W 858 nt11.45□□□□□ -0.58
HEL1P36113 SWC5YBR231C 912 nt11.44□□□□□ -0.58
HEL1P36113 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.43□□□□□ -0.58
HEL1P36113 ALG3YBL082C 1377 nt11.41□□□□□ -0.58
HEL1P36113 ANP1YEL036C 1503 nt11.4□□□□□ -0.58
HEL1P36113 VPS75YNL246W 795 nt11.38□□□□□ -0.59
HEL1P36113 FEN2YCR028C 1539 nt11.38□□□□□ -0.59
HEL1P36113 MIR1YJR077C 936 nt11.37□□□□□ -0.59
HEL1P36113 SNG1YGR197C 1644 nt11.36□□□□□ -0.59
HEL1P36113 FUR4YBR021W 1902 nt11.35□□□□□ -0.59
HEL1P36113 MSF1YPR047W 1410 nt11.35□□□□□ -0.59
HEL1P36113 THI74YDR438W 1113 nt11.33□□□□□ -0.6
HEL1P36113 HEM12YDR047W 1089 nt11.32□□□□□ -0.6
HEL1P36113 MIC10YCL057C-A 294 nt11.31□□□□□ -0.6
HEL1P36113 NAR1YNL240C 1476 nt11.28□□□□□ -0.6
HEL1P36113 YIR016WYIR016W 798 nt11.26□□□□□ -0.61
HEL1P36113 PRP4YPR178W 1398 nt11.22□□□□□ -0.61
HEL1P36113 TIM17YJL143W 477 nt11.21□□□□□ -0.61
HEL1P36113 DAT1YML113W 747 nt11.2□□□□□ -0.62
HEL1P36113 AAC1YMR056C 930 nt11.2□□□□□ -0.62
HEL1P36113 DPS1YLL018C 1674 nt11.18□□□□□ -0.62
HEL1P36113 PAU7YAR020C 168 nt11.17□□□□□ -0.62
HEL1P36113 CCA1YER168C 1641 nt11.14□□□□□ -0.63
HEL1P36113 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.14□□□□□ -0.63
HEL1P36113 SHM2YLR058C 1410 nt11.14□□□□□ -0.63
HEL1P36113 BIO5YNR056C 1686 nt11.13□□□□□ -0.63
HEL1P36113 UBA4YHR111W 1323 nt11.12□□□□□ -0.63
HEL1P36113 YMR244WYMR244W 1068 nt11.12□□□□□ -0.63
HEL1P36113 XDJ1YLR090W 1380 nt11.12□□□□□ -0.63
HEL1P36113 YGL034CYGL034C 366 nt11.11□□□□□ -0.63
HEL1P36113 SHB17YKR043C 816 nt11.11□□□□□ -0.63
HEL1P36113 MIC12YBR262C 321 nt11.11□□□□□ -0.63
HEL1P36113 PBP1YGR178C 2169 nt11.1□□□□□ -0.63
HEL1P36113 BNA2YJR078W 1362 nt11.09□□□□□ -0.63
HEL1P36113 SNF1YDR477W 1902 nt11.09□□□□□ -0.63
HEL1P36113 NIT1YIL164C 600 nt11.06□□□□□ -0.64
HEL1P36113 GLR1YPL091W 1452 nt11.06□□□□□ -0.64
HEL1P36113 YSR3YKR053C 1215 nt11.05□□□□□ -0.64
HEL1P36113 SGT2YOR007C 1041 nt11.05□□□□□ -0.64
HEL1P36113 YDR010CYDR010C 333 nt11.04□□□□□ -0.64
HEL1P36113 RAX1YOR301W 1308 nt11.03□□□□□ -0.64
HEL1P36113 CYT2YKL087C 675 nt11.02□□□□□ -0.65
HEL1P36113 YKR005CYKR005C 1578 nt11.01□□□□□ -0.65
HEL1P36113 GDH3YAL062W 1374 nt11.01□□□□□ -0.65
HEL1P36113 YGR201CYGR201C 678 nt11□□□□□ -0.65
HEL1P36113 BMT6YLR063W 1098 nt10.99□□□□□ -0.65
HEL1P36113 XYL2YLR070C 1071 nt10.98□□□□□ -0.65
HEL1P36113 RET2YFR051C 1641 nt10.98□□□□□ -0.65
HEL1P36113 NDI1YML120C 1542 nt10.97□□□□□ -0.65
HEL1P36113 HHO1YPL127C 777 nt10.95□□□□□ -0.66
HEL1P36113 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.94□□□□□ -0.66
HEL1P36113 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.94□□□□□ -0.66
HEL1P36113 YCR087WYCR087W 516 nt10.94□□□□□ -0.66
HEL1P36113 RBG1YAL036C 1110 nt10.94□□□□□ -0.66
HEL1P36113 PHO89YBR296C 1725 nt10.93□□□□□ -0.66
HEL1P36113 HSL7YBR133C 2484 nt10.93□□□□□ -0.66
HEL1P36113 RBG2YGR173W 1107 nt10.91□□□□□ -0.66
HEL1P36113 CMP2YML057W 1815 nt10.91□□□□□ -0.66
HEL1P36113 AIM45YPR004C 1035 nt10.9□□□□□ -0.66
HEL1P36113 AVT6YER119C 1347 nt10.87□□□□□ -0.67
HEL1P36113 IRC24YIR036C 792 nt10.85□□□□□ -0.67
HEL1P36113 YGR259CYGR259C 441 nt10.84□□□□□ -0.67
HEL1P36113 AGP1YCL025C 1902 nt10.82□□□□□ -0.68
HEL1P36113 GOR1YNL274C 1053 nt10.8□□□□□ -0.68
HEL1P36113 COQ2YNR041C 1119 nt10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 64.6 ms