Protein–RNA interactions for Protein: P36026

UBP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, yeastyeast

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP11P36026 NCP1YHR042W 2076 nt12.12□□□□□ -0.47
UBP11P36026 GUT2YIL155C 1950 nt12.12□□□□□ -0.47
UBP11P36026 BDH1YAL060W 1149 nt12.1□□□□□ -0.47
UBP11P36026 STB1YNL309W 1263 nt12.1□□□□□ -0.47
UBP11P36026 SPC25YER018C 666 nt12.07□□□□□ -0.48
UBP11P36026 YSP3YOR003W 1437 nt12.06□□□□□ -0.48
UBP11P36026 RRT5YFR032C 870 nt12.06□□□□□ -0.48
UBP11P36026 ERF2YLR246W 1080 nt12.06□□□□□ -0.48
UBP11P36026 DDR2YOL052C-A 186 nt12.06□□□□□ -0.48
UBP11P36026 CCT4YDL143W 1587 nt12.05□□□□□ -0.48
UBP11P36026 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.05□□□□□ -0.48
UBP11P36026 CRR1YLR213C 1269 nt12.04□□□□□ -0.48
UBP11P36026 YFL067WYFL067W 528 nt12.02□□□□□ -0.49
UBP11P36026 PEX25YPL112C 1185 nt12.01□□□□□ -0.49
UBP11P36026 PIB2YGL023C 1908 nt12.01□□□□□ -0.49
UBP11P36026 LYS4YDR234W 2082 nt12.01□□□□□ -0.49
UBP11P36026 YNL115CYNL115C 1935 nt12□□□□□ -0.49
UBP11P36026 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12□□□□□ -0.49
UBP11P36026 VPS60YDR486C 690 nt12□□□□□ -0.49
UBP11P36026 NVJ2YPR091C 2313 nt12□□□□□ -0.49
UBP11P36026 MIC10YCL057C-A 294 nt11.99□□□□□ -0.49
UBP11P36026 ALG3YBL082C 1377 nt11.99□□□□□ -0.49
UBP11P36026 YLR415CYLR415C 339 nt11.98□□□□□ -0.49
UBP11P36026 GPI16YHR188C 1833 nt11.97□□□□□ -0.49
UBP11P36026 RTF1YGL244W 1677 nt11.97□□□□□ -0.49
UBP11P36026 SNG1YGR197C 1644 nt11.97□□□□□ -0.49
UBP11P36026 BOP3YNL042W 1191 nt11.96□□□□□ -0.49
UBP11P36026 FEN2YCR028C 1539 nt11.95□□□□□ -0.5
UBP11P36026 ANP1YEL036C 1503 nt11.95□□□□□ -0.5
UBP11P36026 SWC5YBR231C 912 nt11.94□□□□□ -0.5
UBP11P36026 SBA1YKL117W 651 nt11.93□□□□□ -0.5
UBP11P36026 HEM12YDR047W 1089 nt11.92□□□□□ -0.5
UBP11P36026 YIR016WYIR016W 798 nt11.85□□□□□ -0.51
UBP11P36026 PTK1YKL198C 1989 nt11.83□□□□□ -0.52
UBP11P36026 SPT8YLR055C 1809 nt11.81□□□□□ -0.52
UBP11P36026 MIR1YJR077C 936 nt11.77□□□□□ -0.53
UBP11P36026 NAT4YMR069W 858 nt11.77□□□□□ -0.53
UBP11P36026 VPS75YNL246W 795 nt11.76□□□□□ -0.53
UBP11P36026 GLK1YCL040W 1503 nt11.74□□□□□ -0.53
UBP11P36026 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.72□□□□□ -0.53
UBP11P36026 THI74YDR438W 1113 nt11.7□□□□□ -0.54
UBP11P36026 MSF1YPR047W 1410 nt11.69□□□□□ -0.54
UBP11P36026 SHM2YLR058C 1410 nt11.68□□□□□ -0.54
UBP11P36026 TIM17YJL143W 477 nt11.66□□□□□ -0.54
UBP11P36026 MIC12YBR262C 321 nt11.66□□□□□ -0.54
UBP11P36026 XDJ1YLR090W 1380 nt11.65□□□□□ -0.55
UBP11P36026 YFL054CYFL054C 1941 nt11.64□□□□□ -0.55
UBP11P36026 BNA2YJR078W 1362 nt11.63□□□□□ -0.55
UBP11P36026 RAX1YOR301W 1308 nt11.62□□□□□ -0.55
UBP11P36026 DAT1YML113W 747 nt11.61□□□□□ -0.55
UBP11P36026 PAU7YAR020C 168 nt11.6□□□□□ -0.55
UBP11P36026 NIT1YIL164C 600 nt11.59□□□□□ -0.55
UBP11P36026 GDH3YAL062W 1374 nt11.57□□□□□ -0.56
UBP11P36026 SGT2YOR007C 1041 nt11.57□□□□□ -0.56
UBP11P36026 SHB17YKR043C 816 nt11.56□□□□□ -0.56
UBP11P36026 HHO1YPL127C 777 nt11.55□□□□□ -0.56
UBP11P36026 UBA4YHR111W 1323 nt11.55□□□□□ -0.56
UBP11P36026 YDR010CYDR010C 333 nt11.53□□□□□ -0.56
UBP11P36026 YGL034CYGL034C 366 nt11.49□□□□□ -0.57
UBP11P36026 YGR201CYGR201C 678 nt11.48□□□□□ -0.57
UBP11P36026 DUT1YBR252W 444 nt11.47□□□□□ -0.57
UBP11P36026 AVT6YER119C 1347 nt11.46□□□□□ -0.57
UBP11P36026 AGP1YCL025C 1902 nt11.46□□□□□ -0.58
UBP11P36026 YSR3YKR053C 1215 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP11P36026 XYL2YLR070C 1071 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP11P36026 CCA1YER168C 1641 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP11P36026 YMR244WYMR244W 1068 nt11.42□□□□□ -0.58
UBP11P36026 SWE1YJL187C 2460 nt11.4□□□□□ -0.58
UBP11P36026 PHO89YBR296C 1725 nt11.38□□□□□ -0.59
UBP11P36026 RBG1YAL036C 1110 nt11.37□□□□□ -0.59
UBP11P36026 RET2YFR051C 1641 nt11.37□□□□□ -0.59
UBP11P36026 GOR1YNL274C 1053 nt11.36□□□□□ -0.59
UBP11P36026 NDI1YML120C 1542 nt11.35□□□□□ -0.59
UBP11P36026 GLR1YPL091W 1452 nt11.33□□□□□ -0.6
UBP11P36026 SFA1YDL168W 1161 nt11.29□□□□□ -0.6
UBP11P36026 YCR102CYCR102C 1107 nt11.27□□□□□ -0.61
UBP11P36026 COQ2YNR041C 1119 nt11.27□□□□□ -0.61
UBP11P36026 AIM45YPR004C 1035 nt11.25□□□□□ -0.61
UBP11P36026 YCR087WYCR087W 516 nt11.23□□□□□ -0.61
UBP11P36026 SHH4YLR164W 507 nt11.23□□□□□ -0.61
UBP11P36026 NBP35YGL091C 987 nt11.21□□□□□ -0.61
UBP11P36026 MRP20YDR405W 792 nt11.2□□□□□ -0.62
UBP11P36026 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.2□□□□□ -0.62
UBP11P36026 DUS1YML080W 1272 nt11.19□□□□□ -0.62
UBP11P36026 RBG2YGR173W 1107 nt11.18□□□□□ -0.62
UBP11P36026 STR3YGL184C 1398 nt11.16□□□□□ -0.62
UBP11P36026 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.16□□□□□ -0.62
UBP11P36026 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.16□□□□□ -0.62
UBP11P36026 AQY2YLL052C 450 nt11.13□□□□□ -0.63
UBP11P36026 UME6YDR207C 2511 nt11.1□□□□□ -0.63
UBP11P36026 TOM6YOR045W 186 nt11.1□□□□□ -0.63
UBP11P36026 TIR3YIL011W 810 nt11.09□□□□□ -0.63
UBP11P36026 YCL074WYCL074W 927 nt11.06□□□□□ -0.64
UBP11P36026 RPL4BYDR012W 1089 nt11.05□□□□□ -0.64
UBP11P36026 RPL4AYBR031W 1089 nt11.05□□□□□ -0.64
UBP11P36026 PEX2YJL210W 816 nt11.04□□□□□ -0.64
UBP11P36026 POM34YLR018C 900 nt11.04□□□□□ -0.64
UBP11P36026 RPS14BYJL191W 417 nt11.03□□□□□ -0.64
UBP11P36026 PRO1YDR300C 1287 nt11.02□□□□□ -0.65
UBP11P36026 FUR4YBR021W 1902 nt11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.2 ms