Protein–RNA interactions for Protein: P34968

Htr2c, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr2cP34968 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Htr2cP34968 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Htr2cP34968 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Htr2cP34968 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Htr2cP34968 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Htr2cP34968 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Htr2cP34968 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Htr2cP34968 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Htr2cP34968 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Htr2cP34968 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Htr2cP34968 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Htr2cP34968 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Htr2cP34968 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Htr2cP34968 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Htr2cP34968 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Htr2cP34968 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Htr2cP34968 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Htr2cP34968 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Htr2cP34968 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Htr2cP34968 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Htr2cP34968 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Htr2cP34968 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Htr2cP34968 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Htr2cP34968 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Htr2cP34968 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Htr2cP34968 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Htr2cP34968 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Htr2cP34968 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Htr2cP34968 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Htr2cP34968 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Htr2cP34968 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Htr2cP34968 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Htr2cP34968 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Htr2cP34968 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Htr2cP34968 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Htr2cP34968 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Htr2cP34968 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Htr2cP34968 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Htr2cP34968 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Htr2cP34968 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Htr2cP34968 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Htr2cP34968 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Htr2cP34968 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Htr2cP34968 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Htr2cP34968 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Htr2cP34968 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Htr2cP34968 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Htr2cP34968 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Htr2cP34968 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Htr2cP34968 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Htr2cP34968 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Htr2cP34968 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Htr2cP34968 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Htr2cP34968 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Htr2cP34968 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Htr2cP34968 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Htr2cP34968 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Htr2cP34968 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Htr2cP34968 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Htr2cP34968 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Htr2cP34968 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Htr2cP34968 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Htr2cP34968 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Htr2cP34968 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Htr2cP34968 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Htr2cP34968 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Htr2cP34968 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Htr2cP34968 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Htr2cP34968 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Htr2cP34968 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Htr2cP34968 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Htr2cP34968 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Htr2cP34968 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Htr2cP34968 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Htr2cP34968 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Htr2cP34968 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Htr2cP34968 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Htr2cP34968 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Htr2cP34968 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Htr2cP34968 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Htr2cP34968 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Htr2cP34968 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Htr2cP34968 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Htr2cP34968 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Htr2cP34968 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Htr2cP34968 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Htr2cP34968 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Htr2cP34968 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Htr2cP34968 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Htr2cP34968 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Htr2cP34968 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Htr2cP34968 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Htr2cP34968 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Htr2cP34968 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Htr2cP34968 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Htr2cP34968 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Htr2cP34968 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Htr2cP34968 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Htr2cP34968 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Htr2cP34968 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms