Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Cdh15P33146 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Cdh15P33146 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Cdh15P33146 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Cdh15P33146 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Cdh15P33146 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Cdh15P33146 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Cdh15P33146 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Cdh15P33146 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Cdh15P33146 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cdh15P33146 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Cdh15P33146 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Cdh15P33146 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Cdh15P33146 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Cdh15P33146 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Cdh15P33146 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Cdh15P33146 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Cdh15P33146 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Cdh15P33146 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Cdh15P33146 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Cdh15P33146 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Cdh15P33146 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Cdh15P33146 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Cdh15P33146 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Cdh15P33146 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Cdh15P33146 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Cdh15P33146 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Cdh15P33146 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Cdh15P33146 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Cdh15P33146 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Cdh15P33146 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Cdh15P33146 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Cdh15P33146 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Cdh15P33146 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Cdh15P33146 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Cdh15P33146 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cdh15P33146 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cdh15P33146 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Cdh15P33146 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Cdh15P33146 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Cdh15P33146 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Cdh15P33146 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Cdh15P33146 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Cdh15P33146 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Cdh15P33146 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Cdh15P33146 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Cdh15P33146 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,2■■■□□ 2,27
Cdh15P33146 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Cdh15P33146 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Cdh15P33146 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Cdh15P33146 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Cdh15P33146 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
Cdh15P33146 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Cdh15P33146 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Cdh15P33146 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Cdh15P33146 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Cdh15P33146 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Cdh15P33146 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Cdh15P33146 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Cdh15P33146 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Cdh15P33146 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Cdh15P33146 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Cdh15P33146 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Cdh15P33146 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Cdh15P33146 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Cdh15P33146 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cdh15P33146 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cdh15P33146 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cdh15P33146 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Cdh15P33146 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Cdh15P33146 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cdh15P33146 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cdh15P33146 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Cdh15P33146 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Cdh15P33146 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Cdh15P33146 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cdh15P33146 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cdh15P33146 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cdh15P33146 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cdh15P33146 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cdh15P33146 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Cdh15P33146 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Cdh15P33146 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cdh15P33146 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cdh15P33146 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Cdh15P33146 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Cdh15P33146 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Cdh15P33146 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Cdh15P33146 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Cdh15P33146 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Cdh15P33146 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Cdh15P33146 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Cdh15P33146 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Cdh15P33146 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Cdh15P33146 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cdh15P33146 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cdh15P33146 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Cdh15P33146 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Cdh15P33146 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Cdh15P33146 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms