Protein–RNA interactions for Protein: P32776

TFB1, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB1, yeastyeast

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB1P32776 TAD3YLR316C 969 nt10.87□□□□□ -0.67
TFB1P32776 SWE1YJL187C 2460 nt10.85□□□□□ -0.67
TFB1P32776 RPM1RPM1 483 nt10.83□□□□□ -0.68
TFB1P32776 NAT4YMR069W 858 nt10.83□□□□□ -0.68
TFB1P32776 SIM1YIL123W 1431 nt10.82□□□□□ -0.68
TFB1P32776 HSP60YLR259C 1719 nt10.8□□□□□ -0.68
TFB1P32776 LYS4YDR234W 2082 nt10.8□□□□□ -0.68
TFB1P32776 RNQ1YCL028W 1218 nt10.79□□□□□ -0.68
TFB1P32776 AHT1YHR093W 549 nt10.78□□□□□ -0.68
TFB1P32776 WSC2YNL283C 1512 nt10.78□□□□□ -0.68
TFB1P32776 BIO4YNR057C 714 nt10.77□□□□□ -0.69
TFB1P32776 PEX25YPL112C 1185 nt10.77□□□□□ -0.69
TFB1P32776 YIH1YCR059C 777 nt10.76□□□□□ -0.69
TFB1P32776 YFL066CYFL066C 1179 nt10.76□□□□□ -0.69
TFB1P32776 GLK1YCL040W 1503 nt10.74□□□□□ -0.69
TFB1P32776 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.73□□□□□ -0.69
TFB1P32776 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.73□□□□□ -0.69
TFB1P32776 YLL053CYLL053C 459 nt10.69□□□□□ -0.7
TFB1P32776 ALG12YNR030W 1656 nt10.69□□□□□ -0.7
TFB1P32776 AQY1YPR192W 918 nt10.67□□□□□ -0.7
TFB1P32776 MSF1YPR047W 1410 nt10.67□□□□□ -0.7
TFB1P32776 MCH5YOR306C 1566 nt10.65□□□□□ -0.7
TFB1P32776 YSP3YOR003W 1437 nt10.65□□□□□ -0.7
TFB1P32776 YNL115CYNL115C 1935 nt10.64□□□□□ -0.71
TFB1P32776 BDH1YAL060W 1149 nt10.63□□□□□ -0.71
TFB1P32776 ERF2YLR246W 1080 nt10.62□□□□□ -0.71
TFB1P32776 YLR415CYLR415C 339 nt10.62□□□□□ -0.71
TFB1P32776 THI74YDR438W 1113 nt10.6□□□□□ -0.71
TFB1P32776 FTR1YER145C 1215 nt10.6□□□□□ -0.71
TFB1P32776 YMR244WYMR244W 1068 nt10.6□□□□□ -0.71
TFB1P32776 CRR1YLR213C 1269 nt10.58□□□□□ -0.72
TFB1P32776 GAL1YBR020W 1587 nt10.57□□□□□ -0.72
TFB1P32776 MIR1YJR077C 936 nt10.57□□□□□ -0.72
TFB1P32776 ATF2YGR177C 1608 nt10.56□□□□□ -0.72
TFB1P32776 TRM5YHR070W 1500 nt10.55□□□□□ -0.72
TFB1P32776 FUR4YBR021W 1902 nt10.55□□□□□ -0.72
TFB1P32776 YFL067WYFL067W 528 nt10.52□□□□□ -0.73
TFB1P32776 VPS75YNL246W 795 nt10.52□□□□□ -0.73
TFB1P32776 GLR1YPL091W 1452 nt10.5□□□□□ -0.73
TFB1P32776 CCT4YDL143W 1587 nt10.5□□□□□ -0.73
TFB1P32776 SPC25YER018C 666 nt10.49□□□□□ -0.73
TFB1P32776 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.49□□□□□ -0.73
TFB1P32776 STB1YNL309W 1263 nt10.49□□□□□ -0.73
TFB1P32776 DDR2YOL052C-A 186 nt10.49□□□□□ -0.73
TFB1P32776 HEM12YDR047W 1089 nt10.47□□□□□ -0.73
TFB1P32776 FRE6YLL051C 2139 nt10.47□□□□□ -0.73
TFB1P32776 MIC10YCL057C-A 294 nt10.47□□□□□ -0.73
TFB1P32776 GPI16YHR188C 1833 nt10.47□□□□□ -0.73
TFB1P32776 SWC5YBR231C 912 nt10.46□□□□□ -0.73
TFB1P32776 SNG1YGR197C 1644 nt10.45□□□□□ -0.74
TFB1P32776 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.44□□□□□ -0.74
TFB1P32776 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.44□□□□□ -0.74
TFB1P32776 PRP4YPR178W 1398 nt10.43□□□□□ -0.74
TFB1P32776 DAT1YML113W 747 nt10.43□□□□□ -0.74
TFB1P32776 CCA1YER168C 1641 nt10.43□□□□□ -0.74
TFB1P32776 RBG2YGR173W 1107 nt10.41□□□□□ -0.74
TFB1P32776 PAU7YAR020C 168 nt10.41□□□□□ -0.74
TFB1P32776 ANP1YEL036C 1503 nt10.4□□□□□ -0.74
TFB1P32776 AAC1YMR056C 930 nt10.4□□□□□ -0.74
TFB1P32776 VPS60YDR486C 690 nt10.39□□□□□ -0.75
TFB1P32776 YGL034CYGL034C 366 nt10.39□□□□□ -0.75
TFB1P32776 DPS1YLL018C 1674 nt10.38□□□□□ -0.75
TFB1P32776 RAX1YOR301W 1308 nt10.37□□□□□ -0.75
TFB1P32776 NAR1YNL240C 1476 nt10.36□□□□□ -0.75
TFB1P32776 FEN2YCR028C 1539 nt10.34□□□□□ -0.75
TFB1P32776 UBA4YHR111W 1323 nt10.33□□□□□ -0.76
TFB1P32776 NDI1YML120C 1542 nt10.33□□□□□ -0.76
TFB1P32776 ALG3YBL082C 1377 nt10.32□□□□□ -0.76
TFB1P32776 YSR3YKR053C 1215 nt10.29□□□□□ -0.76
TFB1P32776 TIM17YJL143W 477 nt10.28□□□□□ -0.76
TFB1P32776 BIO5YNR056C 1686 nt10.28□□□□□ -0.76
TFB1P32776 SNF1YDR477W 1902 nt10.27□□□□□ -0.77
TFB1P32776 YIR016WYIR016W 798 nt10.26□□□□□ -0.77
TFB1P32776 SHB17YKR043C 816 nt10.26□□□□□ -0.77
TFB1P32776 YKR005CYKR005C 1578 nt10.26□□□□□ -0.77
TFB1P32776 BNA2YJR078W 1362 nt10.26□□□□□ -0.77
TFB1P32776 RBG1YAL036C 1110 nt10.25□□□□□ -0.77
TFB1P32776 PBP1YGR178C 2169 nt10.24□□□□□ -0.77
TFB1P32776 BMT6YLR063W 1098 nt10.24□□□□□ -0.77
TFB1P32776 YMR226CYMR226C 804 nt10.24□□□□□ -0.77
TFB1P32776 MIC12YBR262C 321 nt10.23□□□□□ -0.77
TFB1P32776 XYL2YLR070C 1071 nt10.22□□□□□ -0.77
TFB1P32776 YCR087WYCR087W 516 nt10.19□□□□□ -0.78
TFB1P32776 CYT2YKL087C 675 nt10.17□□□□□ -0.78
TFB1P32776 SAM1YLR180W 1149 nt10.17□□□□□ -0.78
TFB1P32776 AGP1YCL025C 1902 nt10.16□□□□□ -0.78
TFB1P32776 YDR010CYDR010C 333 nt10.14□□□□□ -0.79
TFB1P32776 HHO1YPL127C 777 nt10.14□□□□□ -0.79
TFB1P32776 AIM45YPR004C 1035 nt10.13□□□□□ -0.79
TFB1P32776 SHM2YLR058C 1410 nt10.13□□□□□ -0.79
TFB1P32776 YCL074WYCL074W 927 nt10.12□□□□□ -0.79
TFB1P32776 YGR259CYGR259C 441 nt10.12□□□□□ -0.79
TFB1P32776 IRC24YIR036C 792 nt10.12□□□□□ -0.79
TFB1P32776 RET2YFR051C 1641 nt10.11□□□□□ -0.79
TFB1P32776 PHO89YBR296C 1725 nt10.11□□□□□ -0.79
TFB1P32776 YGR201CYGR201C 678 nt10.08□□□□□ -0.8
TFB1P32776 SGT2YOR007C 1041 nt10.08□□□□□ -0.8
TFB1P32776 XDJ1YLR090W 1380 nt10.07□□□□□ -0.8
TFB1P32776 DUS1YML080W 1272 nt10.07□□□□□ -0.8
TFB1P32776 YLR111WYLR111W 333 nt10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 98.9 ms