Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Casp2P29594 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casp2P29594 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Casp2P29594 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casp2P29594 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casp2P29594 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casp2P29594 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casp2P29594 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp2P29594 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp2P29594 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp2P29594 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casp2P29594 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Casp2P29594 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casp2P29594 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp2P29594 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp2P29594 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp2P29594 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casp2P29594 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casp2P29594 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp2P29594 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp2P29594 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casp2P29594 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casp2P29594 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp2P29594 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp2P29594 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp2P29594 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp2P29594 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Casp2P29594 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp2P29594 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casp2P29594 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp2P29594 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp2P29594 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casp2P29594 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp2P29594 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp2P29594 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casp2P29594 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casp2P29594 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp2P29594 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp2P29594 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Casp2P29594 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp2P29594 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp2P29594 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp2P29594 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp2P29594 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp2P29594 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp2P29594 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Casp2P29594 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Casp2P29594 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp2P29594 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp2P29594 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp2P29594 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp2P29594 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp2P29594 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp2P29594 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casp2P29594 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp2P29594 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp2P29594 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp2P29594 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp2P29594 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp2P29594 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp2P29594 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp2P29594 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp2P29594 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp2P29594 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp2P29594 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp2P29594 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp2P29594 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp2P29594 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp2P29594 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Casp2P29594 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp2P29594 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp2P29594 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp2P29594 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp2P29594 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp2P29594 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp2P29594 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp2P29594 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp2P29594 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp2P29594 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp2P29594 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp2P29594 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp2P29594 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp2P29594 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp2P29594 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp2P29594 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp2P29594 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp2P29594 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp2P29594 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casp2P29594 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp2P29594 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp2P29594 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp2P29594 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp2P29594 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp2P29594 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casp2P29594 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casp2P29594 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casp2P29594 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Casp2P29594 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Casp2P29594 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp2P29594 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms