Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,57■■■■□ 3,28
Casp2P29594 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Casp2P29594 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Casp2P29594 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Casp2P29594 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Casp2P29594 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Casp2P29594 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,78■■■□□ 2,68
Casp2P29594 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,74■■■□□ 2,67
Casp2P29594 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Casp2P29594 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,57
Casp2P29594 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,11■■■□□ 2,57
Casp2P29594 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Casp2P29594 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
Casp2P29594 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Casp2P29594 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Casp2P29594 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Casp2P29594 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Casp2P29594 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Casp2P29594 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,49■■■□□ 2,47
Casp2P29594 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Casp2P29594 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Casp2P29594 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Casp2P29594 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Casp2P29594 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Casp2P29594 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Casp2P29594 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Casp2P29594 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
Casp2P29594 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Casp2P29594 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Casp2P29594 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Casp2P29594 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Casp2P29594 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Casp2P29594 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Casp2P29594 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Casp2P29594 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Casp2P29594 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Casp2P29594 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Casp2P29594 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Casp2P29594 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Casp2P29594 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Casp2P29594 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Casp2P29594 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Casp2P29594 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Casp2P29594 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Casp2P29594 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Casp2P29594 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Casp2P29594 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Casp2P29594 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Casp2P29594 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Casp2P29594 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Casp2P29594 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Casp2P29594 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Casp2P29594 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Casp2P29594 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Casp2P29594 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Casp2P29594 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Casp2P29594 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Casp2P29594 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Casp2P29594 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Casp2P29594 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Casp2P29594 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Casp2P29594 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Casp2P29594 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Casp2P29594 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Casp2P29594 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Casp2P29594 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Casp2P29594 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Casp2P29594 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Casp2P29594 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Casp2P29594 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Casp2P29594 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Casp2P29594 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Casp2P29594 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Casp2P29594 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Casp2P29594 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Casp2P29594 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Casp2P29594 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Casp2P29594 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
Casp2P29594 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Casp2P29594 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Casp2P29594 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
Casp2P29594 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Casp2P29594 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Casp2P29594 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Casp2P29594 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Casp2P29594 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Casp2P29594 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Casp2P29594 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Casp2P29594 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Casp2P29594 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Casp2P29594 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Casp2P29594 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Casp2P29594 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Casp2P29594 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Casp2P29594 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Casp2P29594 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Casp2P29594 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Casp2P29594 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Casp2P29594 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Casp2P29594 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,4 ms