Protein–RNA interactions for Protein: P28652

Camk2b, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camk2bP28652 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Camk2bP28652 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Camk2bP28652 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Camk2bP28652 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Camk2bP28652 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Camk2bP28652 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Camk2bP28652 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camk2bP28652 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camk2bP28652 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camk2bP28652 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Camk2bP28652 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camk2bP28652 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Camk2bP28652 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Camk2bP28652 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Camk2bP28652 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Camk2bP28652 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Camk2bP28652 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Camk2bP28652 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Camk2bP28652 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Camk2bP28652 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Camk2bP28652 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Camk2bP28652 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Camk2bP28652 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Camk2bP28652 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Camk2bP28652 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Camk2bP28652 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Camk2bP28652 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Camk2bP28652 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Camk2bP28652 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Camk2bP28652 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Camk2bP28652 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Camk2bP28652 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Camk2bP28652 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Camk2bP28652 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camk2bP28652 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camk2bP28652 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Camk2bP28652 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Camk2bP28652 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Camk2bP28652 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Camk2bP28652 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Camk2bP28652 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Camk2bP28652 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Camk2bP28652 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Camk2bP28652 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Camk2bP28652 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Camk2bP28652 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Camk2bP28652 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Camk2bP28652 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Camk2bP28652 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Camk2bP28652 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Camk2bP28652 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Camk2bP28652 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Camk2bP28652 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Camk2bP28652 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Camk2bP28652 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Camk2bP28652 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Camk2bP28652 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Camk2bP28652 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Camk2bP28652 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Camk2bP28652 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Camk2bP28652 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Camk2bP28652 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Camk2bP28652 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Camk2bP28652 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Camk2bP28652 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Camk2bP28652 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Camk2bP28652 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Camk2bP28652 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Camk2bP28652 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Camk2bP28652 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Camk2bP28652 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Camk2bP28652 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Camk2bP28652 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Camk2bP28652 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Camk2bP28652 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Camk2bP28652 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Camk2bP28652 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Camk2bP28652 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Camk2bP28652 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Camk2bP28652 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Camk2bP28652 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Camk2bP28652 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Camk2bP28652 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Camk2bP28652 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Camk2bP28652 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Camk2bP28652 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Camk2bP28652 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Camk2bP28652 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Camk2bP28652 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Camk2bP28652 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Camk2bP28652 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Camk2bP28652 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Camk2bP28652 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Camk2bP28652 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Camk2bP28652 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Camk2bP28652 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Camk2bP28652 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Camk2bP28652 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Camk2bP28652 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Camk2bP28652 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms