Protein–RNA interactions for Protein: P28272

URA1, Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate), yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
URA1P28272 DDR2YOL052C-A 186 nt12.3□□□□□ -0.44
URA1P28272 SPT8YLR055C 1809 nt12.28□□□□□ -0.44
URA1P28272 AHT1YHR093W 549 nt12.27□□□□□ -0.45
URA1P28272 AQY1YPR192W 918 nt12.27□□□□□ -0.45
URA1P28272 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.25□□□□□ -0.45
URA1P28272 STB1YNL309W 1263 nt12.25□□□□□ -0.45
URA1P28272 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.24□□□□□ -0.45
URA1P28272 HUA1YGR268C 597 nt12.23□□□□□ -0.45
URA1P28272 SPC25YER018C 666 nt12.22□□□□□ -0.45
URA1P28272 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.22□□□□□ -0.45
URA1P28272 YPR064WYPR064W 420 nt12.22□□□□□ -0.45
URA1P28272 ANP1YEL036C 1503 nt12.21□□□□□ -0.45
URA1P28272 ADO1YJR105W 1023 nt12.21□□□□□ -0.45
URA1P28272 TAD3YLR316C 969 nt12.17□□□□□ -0.46
URA1P28272 VPS60YDR486C 690 nt12.16□□□□□ -0.46
URA1P28272 FEN2YCR028C 1539 nt12.16□□□□□ -0.46
URA1P28272 CCT4YDL143W 1587 nt12.15□□□□□ -0.46
URA1P28272 GPI16YHR188C 1833 nt12.15□□□□□ -0.46
URA1P28272 SWE1YJL187C 2460 nt12.14□□□□□ -0.47
URA1P28272 ALG3YBL082C 1377 nt12.14□□□□□ -0.47
URA1P28272 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.09□□□□□ -0.47
URA1P28272 RAX1YOR301W 1308 nt12.09□□□□□ -0.47
URA1P28272 SWC5YBR231C 912 nt12.07□□□□□ -0.48
URA1P28272 BDH1YAL060W 1149 nt12.06□□□□□ -0.48
URA1P28272 YIR016WYIR016W 798 nt12.05□□□□□ -0.48
URA1P28272 NVJ2YPR091C 2313 nt12.05□□□□□ -0.48
URA1P28272 CCA1YER168C 1641 nt12.02□□□□□ -0.49
URA1P28272 BNA2YJR078W 1362 nt12.01□□□□□ -0.49
URA1P28272 MIC12YBR262C 321 nt12□□□□□ -0.49
URA1P28272 YSP3YOR003W 1437 nt11.95□□□□□ -0.5
URA1P28272 YLR415CYLR415C 339 nt11.95□□□□□ -0.5
URA1P28272 AGP1YCL025C 1902 nt11.92□□□□□ -0.5
URA1P28272 HHO1YPL127C 777 nt11.89□□□□□ -0.51
URA1P28272 YFL066CYFL066C 1179 nt11.88□□□□□ -0.51
URA1P28272 PRE6YOL038W 765 nt11.88□□□□□ -0.51
URA1P28272 UBX6YJL048C 1191 nt11.87□□□□□ -0.51
URA1P28272 YNL115CYNL115C 1935 nt11.87□□□□□ -0.51
URA1P28272 XDJ1YLR090W 1380 nt11.85□□□□□ -0.51
URA1P28272 YDR094WYDR094W 336 nt11.85□□□□□ -0.51
URA1P28272 PEX25YPL112C 1185 nt11.85□□□□□ -0.51
URA1P28272 YFR018CYFR018C 1092 nt11.83□□□□□ -0.52
URA1P28272 DUT1YBR252W 444 nt11.82□□□□□ -0.52
URA1P28272 SHM2YLR058C 1410 nt11.79□□□□□ -0.52
URA1P28272 YGR201CYGR201C 678 nt11.79□□□□□ -0.52
URA1P28272 GDH3YAL062W 1374 nt11.78□□□□□ -0.52
URA1P28272 FUR4YBR021W 1902 nt11.76□□□□□ -0.53
URA1P28272 TIM17YJL143W 477 nt11.74□□□□□ -0.53
URA1P28272 AVT6YER119C 1347 nt11.74□□□□□ -0.53
URA1P28272 DUS1YML080W 1272 nt11.72□□□□□ -0.53
URA1P28272 NIT1YIL164C 600 nt11.7□□□□□ -0.54
URA1P28272 PAU16YKL224C 372 nt11.69□□□□□ -0.54
URA1P28272 HSP60YLR259C 1719 nt11.69□□□□□ -0.54
URA1P28272 SGT2YOR007C 1041 nt11.67□□□□□ -0.54
URA1P28272 VPS75YNL246W 795 nt11.65□□□□□ -0.54
URA1P28272 GOR1YNL274C 1053 nt11.64□□□□□ -0.55
URA1P28272 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.64□□□□□ -0.55
URA1P28272 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.64□□□□□ -0.55
URA1P28272 RRT5YFR032C 870 nt11.63□□□□□ -0.55
URA1P28272 GLK1YCL040W 1503 nt11.63□□□□□ -0.55
URA1P28272 BOR1YNL275W 1731 nt11.62□□□□□ -0.55
URA1P28272 YCL074WYCL074W 927 nt11.61□□□□□ -0.55
URA1P28272 STR3YGL184C 1398 nt11.6□□□□□ -0.55
URA1P28272 AQY2YLL052C 450 nt11.56□□□□□ -0.56
URA1P28272 DAT1YML113W 747 nt11.56□□□□□ -0.56
URA1P28272 MIR1YJR077C 936 nt11.52□□□□□ -0.57
URA1P28272 PAU7YAR020C 168 nt11.49□□□□□ -0.57
URA1P28272 PRP4YPR178W 1398 nt11.49□□□□□ -0.57
URA1P28272 YKR005CYKR005C 1578 nt11.49□□□□□ -0.57
URA1P28272 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.48□□□□□ -0.57
URA1P28272 YDR010CYDR010C 333 nt11.46□□□□□ -0.57
URA1P28272 SHB17YKR043C 816 nt11.46□□□□□ -0.57
URA1P28272 YCR102CYCR102C 1107 nt11.45□□□□□ -0.58
URA1P28272 NBP35YGL091C 987 nt11.44□□□□□ -0.58
URA1P28272 DPS1YLL018C 1674 nt11.43□□□□□ -0.58
URA1P28272 YGR259CYGR259C 441 nt11.42□□□□□ -0.58
URA1P28272 THI74YDR438W 1113 nt11.41□□□□□ -0.58
URA1P28272 SHH4YLR164W 507 nt11.39□□□□□ -0.59
URA1P28272 YJL225CYJL225C 5277 nt11.38□□□□□ -0.59
URA1P28272 UBA4YHR111W 1323 nt11.36□□□□□ -0.59
URA1P28272 NAT4YMR069W 858 nt11.36□□□□□ -0.59
URA1P28272 MSF1YPR047W 1410 nt11.34□□□□□ -0.59
URA1P28272 SFA1YDL168W 1161 nt11.32□□□□□ -0.6
URA1P28272 RTN2YDL204W 1182 nt11.32□□□□□ -0.6
URA1P28272 BMT6YLR063W 1098 nt11.32□□□□□ -0.6
URA1P28272 SNF1YDR477W 1902 nt11.32□□□□□ -0.6
URA1P28272 RET2YFR051C 1641 nt11.31□□□□□ -0.6
URA1P28272 AAC1YMR056C 930 nt11.29□□□□□ -0.6
URA1P28272 PHO89YBR296C 1725 nt11.29□□□□□ -0.6
URA1P28272 YSR3YKR053C 1215 nt11.28□□□□□ -0.6
URA1P28272 PLB1YMR008C 1995 nt11.27□□□□□ -0.61
URA1P28272 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.27□□□□□ -0.61
URA1P28272 TIR3YIL011W 810 nt11.27□□□□□ -0.61
URA1P28272 RPM1RPM1 483 nt11.26□□□□□ -0.61
URA1P28272 ARP6YLR085C 1317 nt11.26□□□□□ -0.61
URA1P28272 XYL2YLR070C 1071 nt11.25□□□□□ -0.61
URA1P28272 UME6YDR207C 2511 nt11.24□□□□□ -0.61
URA1P28272 PRO1YDR300C 1287 nt11.22□□□□□ -0.61
URA1P28272 YGL034CYGL034C 366 nt11.22□□□□□ -0.61
URA1P28272 IRC24YIR036C 792 nt11.21□□□□□ -0.61
URA1P28272 ALG12YNR030W 1656 nt11.2□□□□□ -0.62
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