Protein–RNA interactions for Protein: P27784

Ccl6, C-C motif chemokine 6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl6P27784 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Ccl6P27784 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,21■□□□□ 0,83
Ccl6P27784 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Ccl6P27784 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,21■□□□□ 0,83
Ccl6P27784 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20,2■□□□□ 0,82
Ccl6P27784 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20,17■□□□□ 0,82
Ccl6P27784 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20,17■□□□□ 0,82
Ccl6P27784 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Ccl6P27784 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20,15■□□□□ 0,82
Ccl6P27784 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20,13■□□□□ 0,81
Ccl6P27784 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Ccl6P27784 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Ccl6P27784 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20,1■□□□□ 0,81
Ccl6P27784 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Ccl6P27784 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ccl6P27784 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ccl6P27784 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Ccl6P27784 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Ccl6P27784 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Ccl6P27784 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Ccl6P27784 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Ccl6P27784 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Ccl6P27784 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Ccl6P27784 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Ccl6P27784 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Ccl6P27784 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Ccl6P27784 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Ccl6P27784 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Ccl6P27784 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Ccl6P27784 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Ccl6P27784 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Ccl6P27784 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ccl6P27784 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ccl6P27784 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Ccl6P27784 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Ccl6P27784 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19,91■□□□□ 0,78
Ccl6P27784 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Ccl6P27784 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Ccl6P27784 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Ccl6P27784 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19,84■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19,84■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19,84■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Ccl6P27784 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
Ccl6P27784 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Ccl6P27784 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Ccl6P27784 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Ccl6P27784 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Ccl6P27784 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Ccl6P27784 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Ccl6P27784 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Ccl6P27784 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Ccl6P27784 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,75■□□□□ 0,75
Ccl6P27784 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,74■□□□□ 0,75
Ccl6P27784 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Ccl6P27784 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19,74■□□□□ 0,75
Ccl6P27784 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19,74■□□□□ 0,75
Ccl6P27784 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Ccl6P27784 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Ccl6P27784 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Ccl6P27784 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Ccl6P27784 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19,72■□□□□ 0,75
Ccl6P27784 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Ccl6P27784 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Ccl6P27784 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19,7■□□□□ 0,74
Ccl6P27784 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19,69■□□□□ 0,74
Ccl6P27784 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Ccl6P27784 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Ccl6P27784 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Ccl6P27784 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Ccl6P27784 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Ccl6P27784 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19,68■□□□□ 0,74
Ccl6P27784 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Ccl6P27784 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,67■□□□□ 0,74
Ccl6P27784 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,67■□□□□ 0,74
Ccl6P27784 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19,66■□□□□ 0,74
Ccl6P27784 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,73
Ccl6P27784 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,73
Ccl6P27784 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19,63■□□□□ 0,73
Ccl6P27784 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,62■□□□□ 0,73
Ccl6P27784 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Ccl6P27784 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,61■□□□□ 0,73
Ccl6P27784 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Ccl6P27784 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Ccl6P27784 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Ccl6P27784 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19,6■□□□□ 0,73
Ccl6P27784 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,73
Ccl6P27784 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,5 ms