Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabra2P26048 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabra2P26048 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabra2P26048 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabra2P26048 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabra2P26048 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabra2P26048 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabra2P26048 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabra2P26048 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabra2P26048 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabra2P26048 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra2P26048 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra2P26048 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra2P26048 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra2P26048 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra2P26048 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra2P26048 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabra2P26048 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabra2P26048 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabra2P26048 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabra2P26048 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabra2P26048 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra2P26048 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra2P26048 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra2P26048 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra2P26048 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra2P26048 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra2P26048 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra2P26048 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabra2P26048 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabra2P26048 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabra2P26048 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra2P26048 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabra2P26048 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabra2P26048 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabra2P26048 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabra2P26048 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabra2P26048 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra2P26048 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra2P26048 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabra2P26048 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabra2P26048 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabra2P26048 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabra2P26048 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabra2P26048 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra2P26048 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra2P26048 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabra2P26048 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabra2P26048 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra2P26048 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra2P26048 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra2P26048 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra2P26048 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra2P26048 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra2P26048 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra2P26048 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra2P26048 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra2P26048 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra2P26048 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra2P26048 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabra2P26048 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra2P26048 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra2P26048 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabra2P26048 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabra2P26048 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabra2P26048 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabra2P26048 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra2P26048 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabra2P26048 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabra2P26048 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabra2P26048 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabra2P26048 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra2P26048 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabra2P26048 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabra2P26048 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra2P26048 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra2P26048 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabra2P26048 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabra2P26048 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gabra2P26048 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabra2P26048 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gabra2P26048 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabra2P26048 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabra2P26048 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms