Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clk1P22518 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Clk1P22518 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clk1P22518 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clk1P22518 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clk1P22518 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clk1P22518 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clk1P22518 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clk1P22518 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clk1P22518 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clk1P22518 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clk1P22518 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clk1P22518 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clk1P22518 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clk1P22518 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clk1P22518 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clk1P22518 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clk1P22518 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clk1P22518 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clk1P22518 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clk1P22518 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clk1P22518 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clk1P22518 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clk1P22518 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clk1P22518 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clk1P22518 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clk1P22518 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clk1P22518 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clk1P22518 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Clk1P22518 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clk1P22518 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clk1P22518 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clk1P22518 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clk1P22518 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clk1P22518 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clk1P22518 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clk1P22518 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clk1P22518 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clk1P22518 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clk1P22518 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clk1P22518 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clk1P22518 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clk1P22518 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clk1P22518 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clk1P22518 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clk1P22518 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clk1P22518 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clk1P22518 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clk1P22518 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Clk1P22518 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clk1P22518 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clk1P22518 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clk1P22518 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clk1P22518 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Clk1P22518 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clk1P22518 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clk1P22518 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clk1P22518 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clk1P22518 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clk1P22518 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clk1P22518 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clk1P22518 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clk1P22518 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clk1P22518 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clk1P22518 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clk1P22518 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clk1P22518 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clk1P22518 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clk1P22518 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clk1P22518 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clk1P22518 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clk1P22518 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clk1P22518 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clk1P22518 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk1P22518 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk1P22518 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk1P22518 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk1P22518 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clk1P22518 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clk1P22518 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clk1P22518 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clk1P22518 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clk1P22518 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clk1P22518 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clk1P22518 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clk1P22518 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clk1P22518 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Clk1P22518 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Clk1P22518 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clk1P22518 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clk1P22518 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clk1P22518 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clk1P22518 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clk1P22518 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clk1P22518 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clk1P22518 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clk1P22518 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Clk1P22518 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clk1P22518 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clk1P22518 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms