Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Klra1P20937 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Klra1P20937 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Klra1P20937 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Klra1P20937 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Klra1P20937 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Klra1P20937 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Klra1P20937 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Klra1P20937 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Klra1P20937 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Klra1P20937 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Klra1P20937 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Klra1P20937 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Klra1P20937 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Klra1P20937 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Klra1P20937 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Klra1P20937 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Klra1P20937 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Klra1P20937 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Klra1P20937 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Klra1P20937 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Klra1P20937 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klra1P20937 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Klra1P20937 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Klra1P20937 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Klra1P20937 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Klra1P20937 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Klra1P20937 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Klra1P20937 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Klra1P20937 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Klra1P20937 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Klra1P20937 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Klra1P20937 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Klra1P20937 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Klra1P20937 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Klra1P20937 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Klra1P20937 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Klra1P20937 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Klra1P20937 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Klra1P20937 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klra1P20937 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klra1P20937 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klra1P20937 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klra1P20937 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Klra1P20937 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Klra1P20937 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Klra1P20937 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Klra1P20937 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Klra1P20937 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Klra1P20937 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Klra1P20937 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Klra1P20937 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Klra1P20937 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Klra1P20937 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Klra1P20937 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Klra1P20937 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klra1P20937 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klra1P20937 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klra1P20937 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klra1P20937 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Klra1P20937 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Klra1P20937 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klra1P20937 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Klra1P20937 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klra1P20937 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klra1P20937 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klra1P20937 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klra1P20937 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klra1P20937 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klra1P20937 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Klra1P20937 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Klra1P20937 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klra1P20937 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Klra1P20937 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Klra1P20937 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klra1P20937 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klra1P20937 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klra1P20937 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klra1P20937 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klra1P20937 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klra1P20937 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klra1P20937 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klra1P20937 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Klra1P20937 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Klra1P20937 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms