Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
PrphP15331 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
PrphP15331 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
PrphP15331 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,01■■■□□ 2,07
PrphP15331 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
PrphP15331 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
PrphP15331 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
PrphP15331 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
PrphP15331 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
PrphP15331 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
PrphP15331 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,93■■■□□ 2,06
PrphP15331 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
PrphP15331 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
PrphP15331 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
PrphP15331 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
PrphP15331 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
PrphP15331 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
PrphP15331 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
PrphP15331 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
PrphP15331 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
PrphP15331 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,75■■■□□ 2,03
PrphP15331 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
PrphP15331 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
PrphP15331 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
PrphP15331 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
PrphP15331 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
PrphP15331 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
PrphP15331 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
PrphP15331 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
PrphP15331 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
PrphP15331 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
PrphP15331 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
PrphP15331 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,59■■■□□ 2,01
PrphP15331 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
PrphP15331 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
PrphP15331 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
PrphP15331 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
PrphP15331 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
PrphP15331 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
PrphP15331 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
PrphP15331 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
PrphP15331 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
PrphP15331 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
PrphP15331 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
PrphP15331 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
PrphP15331 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
PrphP15331 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27,47■■□□□ 1,99
PrphP15331 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
PrphP15331 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
PrphP15331 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
PrphP15331 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
PrphP15331 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
PrphP15331 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
PrphP15331 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
PrphP15331 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
PrphP15331 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
PrphP15331 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
PrphP15331 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
PrphP15331 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
PrphP15331 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
PrphP15331 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
PrphP15331 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
PrphP15331 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
PrphP15331 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
PrphP15331 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
PrphP15331 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
PrphP15331 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
PrphP15331 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
PrphP15331 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,29■■□□□ 1,96
PrphP15331 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
PrphP15331 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
PrphP15331 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
PrphP15331 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
PrphP15331 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
PrphP15331 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
PrphP15331 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
PrphP15331 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
PrphP15331 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
PrphP15331 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
PrphP15331 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
PrphP15331 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
PrphP15331 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
PrphP15331 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
PrphP15331 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
PrphP15331 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
PrphP15331 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,18■■□□□ 1,94
PrphP15331 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
PrphP15331 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,18■■□□□ 1,94
PrphP15331 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
PrphP15331 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
PrphP15331 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,16■■□□□ 1,94
PrphP15331 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
PrphP15331 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
PrphP15331 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
PrphP15331 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27,13■■□□□ 1,93
PrphP15331 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
PrphP15331 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
PrphP15331 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
PrphP15331 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
PrphP15331 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,7 ms