Protein–RNA interactions for Protein: P13712

MSI1, Chromatin assembly factor 1 subunit p50, yeastyeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSI1P13712 YFL067WYFL067W 528 nt9.43□□□□□ -0.9
MSI1P13712 UBX6YJL048C 1191 nt9.43□□□□□ -0.9
MSI1P13712 AQY1YPR192W 918 nt9.43□□□□□ -0.9
MSI1P13712 YFL054CYFL054C 1941 nt9.41□□□□□ -0.9
MSI1P13712 YDR094WYDR094W 336 nt9.4□□□□□ -0.9
MSI1P13712 AHT1YHR093W 549 nt9.4□□□□□ -0.9
MSI1P13712 DDR2YOL052C-A 186 nt9.39□□□□□ -0.91
MSI1P13712 WSC2YNL283C 1512 nt9.39□□□□□ -0.91
MSI1P13712 YPR064WYPR064W 420 nt9.37□□□□□ -0.91
MSI1P13712 SNG1YGR197C 1644 nt9.36□□□□□ -0.91
MSI1P13712 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.36□□□□□ -0.91
MSI1P13712 HEM12YDR047W 1089 nt9.36□□□□□ -0.91
MSI1P13712 SPC25YER018C 666 nt9.36□□□□□ -0.91
MSI1P13712 STB1YNL309W 1263 nt9.35□□□□□ -0.91
MSI1P13712 MIC10YCL057C-A 294 nt9.35□□□□□ -0.91
MSI1P13712 ANP1YEL036C 1503 nt9.33□□□□□ -0.92
MSI1P13712 TAD3YLR316C 969 nt9.33□□□□□ -0.92
MSI1P13712 SPT8YLR055C 1809 nt9.33□□□□□ -0.92
MSI1P13712 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.31□□□□□ -0.92
MSI1P13712 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.3□□□□□ -0.92
MSI1P13712 CCT4YDL143W 1587 nt9.29□□□□□ -0.92
MSI1P13712 GPI16YHR188C 1833 nt9.28□□□□□ -0.92
MSI1P13712 FEN2YCR028C 1539 nt9.28□□□□□ -0.92
MSI1P13712 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.27□□□□□ -0.93
MSI1P13712 VPS60YDR486C 690 nt9.26□□□□□ -0.93
MSI1P13712 RAX1YOR301W 1308 nt9.23□□□□□ -0.93
MSI1P13712 YIR016WYIR016W 798 nt9.21□□□□□ -0.94
MSI1P13712 ALG3YBL082C 1377 nt9.21□□□□□ -0.94
MSI1P13712 SWE1YJL187C 2460 nt9.2□□□□□ -0.94
MSI1P13712 BDH1YAL060W 1149 nt9.2□□□□□ -0.94
MSI1P13712 UME6YDR207C 2511 nt9.2□□□□□ -0.94
MSI1P13712 BOR1YNL275W 1731 nt9.19□□□□□ -0.94
MSI1P13712 SWC5YBR231C 912 nt9.19□□□□□ -0.94
MSI1P13712 YFR018CYFR018C 1092 nt9.18□□□□□ -0.94
MSI1P13712 MIC12YBR262C 321 nt9.17□□□□□ -0.94
MSI1P13712 BNA2YJR078W 1362 nt9.16□□□□□ -0.94
MSI1P13712 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.15□□□□□ -0.94
MSI1P13712 YLR415CYLR415C 339 nt9.14□□□□□ -0.95
MSI1P13712 YSP3YOR003W 1437 nt9.14□□□□□ -0.95
MSI1P13712 RRT5YFR032C 870 nt9.13□□□□□ -0.95
MSI1P13712 CCA1YER168C 1641 nt9.09□□□□□ -0.95
MSI1P13712 HHO1YPL127C 777 nt9.07□□□□□ -0.96
MSI1P13712 PAU16YKL224C 372 nt9.06□□□□□ -0.96
MSI1P13712 PEX25YPL112C 1185 nt9.05□□□□□ -0.96
MSI1P13712 YNL115CYNL115C 1935 nt9.04□□□□□ -0.96
MSI1P13712 YFL066CYFL066C 1179 nt9.04□□□□□ -0.96
MSI1P13712 YGR201CYGR201C 678 nt9.03□□□□□ -0.96
MSI1P13712 HSP60YLR259C 1719 nt9.02□□□□□ -0.97
MSI1P13712 AGP1YCL025C 1902 nt9.01□□□□□ -0.97
MSI1P13712 XDJ1YLR090W 1380 nt9.01□□□□□ -0.97
MSI1P13712 PRE6YOL038W 765 nt9.01□□□□□ -0.97
MSI1P13712 SHM2YLR058C 1410 nt8.98□□□□□ -0.97
MSI1P13712 GDH3YAL062W 1374 nt8.98□□□□□ -0.97
MSI1P13712 TIM17YJL143W 477 nt8.97□□□□□ -0.97
MSI1P13712 VPS75YNL246W 795 nt8.95□□□□□ -0.98
MSI1P13712 GLK1YCL040W 1503 nt8.95□□□□□ -0.98
MSI1P13712 AVT6YER119C 1347 nt8.91□□□□□ -0.98
MSI1P13712 NIT1YIL164C 600 nt8.91□□□□□ -0.98
MSI1P13712 DUT1YBR252W 444 nt8.91□□□□□ -0.98
MSI1P13712 FUR4YBR021W 1902 nt8.9□□□□□ -0.98
MSI1P13712 GOR1YNL274C 1053 nt8.9□□□□□ -0.98
MSI1P13712 NAT4YMR069W 858 nt8.89□□□□□ -0.99
MSI1P13712 ALG12YNR030W 1656 nt8.87□□□□□ -0.99
MSI1P13712 DUS1YML080W 1272 nt8.86□□□□□ -0.99
MSI1P13712 SGT2YOR007C 1041 nt8.85□□□□□ -0.99
MSI1P13712 YCL074WYCL074W 927 nt8.84□□□□□ -0.99
MSI1P13712 DAT1YML113W 747 nt8.84□□□□□ -0.99
MSI1P13712 STR3YGL184C 1398 nt8.84□□□□□ -0.99
MSI1P13712 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.81□□□□□ -1
MSI1P13712 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.81□□□□□ -1
MSI1P13712 MCH5YOR306C 1566 nt8.81□□□□□ -1
MSI1P13712 SBA1YKL117W 651 nt8.8□□□□□ -1
MSI1P13712 PRP4YPR178W 1398 nt8.79□□□□□ -1
MSI1P13712 MIR1YJR077C 936 nt8.79□□□□□ -1
MSI1P13712 MSF1YPR047W 1410 nt8.79□□□□□ -1
MSI1P13712 YCR102CYCR102C 1107 nt8.78□□□□□ -1
MSI1P13712 THI74YDR438W 1113 nt8.78□□□□□ -1
MSI1P13712 PAU7YAR020C 168 nt8.77□□□□□ -1.01
MSI1P13712 AAC1YMR056C 930 nt8.75□□□□□ -1.01
MSI1P13712 NBP35YGL091C 987 nt8.74□□□□□ -1.01
MSI1P13712 AQY2YLL052C 450 nt8.74□□□□□ -1.01
MSI1P13712 DPS1YLL018C 1674 nt8.73□□□□□ -1.01
MSI1P13712 YDR010CYDR010C 333 nt8.72□□□□□ -1.01
MSI1P13712 SHB17YKR043C 816 nt8.72□□□□□ -1.01
MSI1P13712 RPM1RPM1 483 nt8.72□□□□□ -1.01
MSI1P13712 YKR005CYKR005C 1578 nt8.72□□□□□ -1.01
MSI1P13712 BMT6YLR063W 1098 nt8.7□□□□□ -1.02
MSI1P13712 UBA4YHR111W 1323 nt8.69□□□□□ -1.02
MSI1P13712 YGR259CYGR259C 441 nt8.67□□□□□ -1.02
MSI1P13712 RET2YFR051C 1641 nt8.65□□□□□ -1.02
MSI1P13712 RTN2YDL204W 1182 nt8.64□□□□□ -1.03
MSI1P13712 TIR3YIL011W 810 nt8.63□□□□□ -1.03
MSI1P13712 ARP6YLR085C 1317 nt8.62□□□□□ -1.03
MSI1P13712 SFA1YDL168W 1161 nt8.61□□□□□ -1.03
MSI1P13712 YGL034CYGL034C 366 nt8.61□□□□□ -1.03
MSI1P13712 YSR3YKR053C 1215 nt8.61□□□□□ -1.03
MSI1P13712 SHH4YLR164W 507 nt8.61□□□□□ -1.03
MSI1P13712 PHO89YBR296C 1725 nt8.6□□□□□ -1.03
MSI1P13712 NAR1YNL240C 1476 nt8.59□□□□□ -1.03
MSI1P13712 LSC2YGR244C 1284 nt8.59□□□□□ -1.03
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