Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt8P11679 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Krt8P11679 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt8P11679 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt8P11679 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt8P11679 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt8P11679 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Krt8P11679 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Krt8P11679 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt8P11679 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt8P11679 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt8P11679 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt8P11679 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt8P11679 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt8P11679 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Krt8P11679 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt8P11679 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Krt8P11679 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Krt8P11679 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Krt8P11679 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt8P11679 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt8P11679 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt8P11679 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt8P11679 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt8P11679 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt8P11679 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt8P11679 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Krt8P11679 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Krt8P11679 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt8P11679 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt8P11679 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt8P11679 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt8P11679 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt8P11679 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt8P11679 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt8P11679 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt8P11679 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt8P11679 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt8P11679 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt8P11679 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt8P11679 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt8P11679 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt8P11679 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt8P11679 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt8P11679 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt8P11679 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt8P11679 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt8P11679 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt8P11679 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt8P11679 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt8P11679 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt8P11679 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt8P11679 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt8P11679 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt8P11679 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt8P11679 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt8P11679 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt8P11679 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Krt8P11679 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Krt8P11679 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt8P11679 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt8P11679 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt8P11679 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt8P11679 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt8P11679 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt8P11679 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt8P11679 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt8P11679 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt8P11679 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt8P11679 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt8P11679 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt8P11679 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt8P11679 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt8P11679 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt8P11679 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt8P11679 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt8P11679 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt8P11679 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt8P11679 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt8P11679 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt8P11679 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt8P11679 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt8P11679 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Krt8P11679 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt8P11679 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt8P11679 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt8P11679 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt8P11679 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt8P11679 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt8P11679 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt8P11679 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt8P11679 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt8P11679 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt8P11679 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt8P11679 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt8P11679 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt8P11679 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Krt8P11679 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt8P11679 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt8P11679 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms