Protein–RNA interactions for Protein: P0DP26

Calm1, Calmodulin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm1P0DP26 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Calm1P0DP26 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Calm1P0DP26 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Calm1P0DP26 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Calm1P0DP26 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Calm1P0DP26 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,46■■■□□ 2,47
Calm1P0DP26 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Calm1P0DP26 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Calm1P0DP26 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,45■■■□□ 2,47
Calm1P0DP26 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Calm1P0DP26 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Calm1P0DP26 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Calm1P0DP26 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Calm1P0DP26 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Calm1P0DP26 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30,39■■■□□ 2,45
Calm1P0DP26 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Calm1P0DP26 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Calm1P0DP26 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Calm1P0DP26 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Calm1P0DP26 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Calm1P0DP26 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Calm1P0DP26 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Calm1P0DP26 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30,26■■■□□ 2,44
Calm1P0DP26 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Calm1P0DP26 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Calm1P0DP26 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Calm1P0DP26 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Calm1P0DP26 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Calm1P0DP26 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Calm1P0DP26 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Calm1P0DP26 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Calm1P0DP26 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Calm1P0DP26 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Calm1P0DP26 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Calm1P0DP26 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Calm1P0DP26 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Calm1P0DP26 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Calm1P0DP26 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Calm1P0DP26 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Calm1P0DP26 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Calm1P0DP26 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Calm1P0DP26 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Calm1P0DP26 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Calm1P0DP26 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Calm1P0DP26 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Calm1P0DP26 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Calm1P0DP26 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Calm1P0DP26 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Calm1P0DP26 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Calm1P0DP26 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Calm1P0DP26 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Calm1P0DP26 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Calm1P0DP26 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Calm1P0DP26 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Calm1P0DP26 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Calm1P0DP26 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Calm1P0DP26 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Calm1P0DP26 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Calm1P0DP26 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Calm1P0DP26 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Calm1P0DP26 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Calm1P0DP26 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Calm1P0DP26 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Calm1P0DP26 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Calm1P0DP26 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Calm1P0DP26 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Calm1P0DP26 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Calm1P0DP26 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Calm1P0DP26 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,37
Calm1P0DP26 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Calm1P0DP26 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Calm1P0DP26 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Calm1P0DP26 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Calm1P0DP26 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,78■■■□□ 2,36
Calm1P0DP26 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Calm1P0DP26 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Calm1P0DP26 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Calm1P0DP26 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Calm1P0DP26 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Calm1P0DP26 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Calm1P0DP26 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Calm1P0DP26 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Calm1P0DP26 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Calm1P0DP26 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Calm1P0DP26 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Calm1P0DP26 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Calm1P0DP26 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Calm1P0DP26 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Calm1P0DP26 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Calm1P0DP26 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Calm1P0DP26 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Calm1P0DP26 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Calm1P0DP26 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Calm1P0DP26 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Calm1P0DP26 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Calm1P0DP26 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Calm1P0DP26 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Calm1P0DP26 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Calm1P0DP26 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Calm1P0DP26 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40,1 ms