Protein–RNA interactions for Protein: P0DOV2

Ifi204, Interferon-activable protein 204, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi204P0DOV2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi204P0DOV2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ifi204P0DOV2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ifi204P0DOV2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifi204P0DOV2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifi204P0DOV2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifi204P0DOV2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi204P0DOV2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi204P0DOV2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifi204P0DOV2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifi204P0DOV2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifi204P0DOV2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifi204P0DOV2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifi204P0DOV2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifi204P0DOV2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifi204P0DOV2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifi204P0DOV2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifi204P0DOV2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifi204P0DOV2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifi204P0DOV2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifi204P0DOV2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifi204P0DOV2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifi204P0DOV2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi204P0DOV2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi204P0DOV2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifi204P0DOV2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifi204P0DOV2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifi204P0DOV2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifi204P0DOV2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifi204P0DOV2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi204P0DOV2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi204P0DOV2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifi204P0DOV2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifi204P0DOV2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifi204P0DOV2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifi204P0DOV2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifi204P0DOV2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifi204P0DOV2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi204P0DOV2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi204P0DOV2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi204P0DOV2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifi204P0DOV2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifi204P0DOV2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifi204P0DOV2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifi204P0DOV2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifi204P0DOV2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifi204P0DOV2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifi204P0DOV2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifi204P0DOV2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifi204P0DOV2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifi204P0DOV2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifi204P0DOV2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ifi204P0DOV2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifi204P0DOV2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi204P0DOV2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi204P0DOV2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifi204P0DOV2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifi204P0DOV2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifi204P0DOV2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifi204P0DOV2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifi204P0DOV2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifi204P0DOV2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifi204P0DOV2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifi204P0DOV2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifi204P0DOV2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifi204P0DOV2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifi204P0DOV2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifi204P0DOV2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifi204P0DOV2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifi204P0DOV2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifi204P0DOV2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifi204P0DOV2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifi204P0DOV2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifi204P0DOV2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifi204P0DOV2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifi204P0DOV2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifi204P0DOV2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifi204P0DOV2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifi204P0DOV2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifi204P0DOV2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifi204P0DOV2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifi204P0DOV2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifi204P0DOV2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifi204P0DOV2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifi204P0DOV2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifi204P0DOV2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifi204P0DOV2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifi204P0DOV2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifi204P0DOV2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifi204P0DOV2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifi204P0DOV2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ifi204P0DOV2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifi204P0DOV2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifi204P0DOV2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifi204P0DOV2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifi204P0DOV2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifi204P0DOV2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifi204P0DOV2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifi204P0DOV2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifi204P0DOV2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms