Protein–RNA interactions for Protein: P0CX22

YRF1-8, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 8, yeastyeast

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Length 1,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-8P0CX22 AQY1YPR192W 918 nt16.51■□□□□ 0.23
YRF1-8P0CX22 TRM5YHR070W 1500 nt16.5■□□□□ 0.23
YRF1-8P0CX22 GAL1YBR020W 1587 nt16.5■□□□□ 0.23
YRF1-8P0CX22 SWC5YBR231C 912 nt16.49■□□□□ 0.23
YRF1-8P0CX22 RBG1YAL036C 1110 nt16.47■□□□□ 0.23
YRF1-8P0CX22 CCT4YDL143W 1587 nt16.47■□□□□ 0.23
YRF1-8P0CX22 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt16.46■□□□□ 0.23
YRF1-8P0CX22 YGL034CYGL034C 366 nt16.46■□□□□ 0.22
YRF1-8P0CX22 RPM1RPM1 483 nt16.45■□□□□ 0.22
YRF1-8P0CX22 ALG3YBL082C 1377 nt16.43■□□□□ 0.22
YRF1-8P0CX22 UBA4YHR111W 1323 nt16.4■□□□□ 0.22
YRF1-8P0CX22 ATF2YGR177C 1608 nt16.39■□□□□ 0.21
YRF1-8P0CX22 SPC25YER018C 666 nt16.38■□□□□ 0.21
YRF1-8P0CX22 STB1YNL309W 1263 nt16.38■□□□□ 0.21
YRF1-8P0CX22 PAU7YAR020C 168 nt16.37■□□□□ 0.21
YRF1-8P0CX22 XYL2YLR070C 1071 nt16.36■□□□□ 0.21
YRF1-8P0CX22 SCC4YER147C 1875 nt16.35■□□□□ 0.21
YRF1-8P0CX22 SPT8YLR055C 1809 nt16.35■□□□□ 0.21
YRF1-8P0CX22 SHB17YKR043C 816 nt16.35■□□□□ 0.21
YRF1-8P0CX22 VPS60YDR486C 690 nt16.34■□□□□ 0.21
YRF1-8P0CX22 SDH1YKL148C 1923 nt16.32■□□□□ 0.2
YRF1-8P0CX22 SAM1YLR180W 1149 nt16.32■□□□□ 0.2
YRF1-8P0CX22 GPI16YHR188C 1833 nt16.32■□□□□ 0.2
YRF1-8P0CX22 DDR2YOL052C-A 186 nt16.24■□□□□ 0.19
YRF1-8P0CX22 YNR029CYNR029C 1290 nt16.23■□□□□ 0.19
YRF1-8P0CX22 YMR090WYMR090W 684 nt16.22■□□□□ 0.19
YRF1-8P0CX22 SIM1YIL123W 1431 nt16.2■□□□□ 0.18
YRF1-8P0CX22 RRT12YCR045C 1476 nt16.19■□□□□ 0.18
YRF1-8P0CX22 YDR010CYDR010C 333 nt16.19■□□□□ 0.18
YRF1-8P0CX22 YSR3YKR053C 1215 nt16.15■□□□□ 0.18
YRF1-8P0CX22 TIM17YJL143W 477 nt16.14■□□□□ 0.17
YRF1-8P0CX22 YFL067WYFL067W 528 nt16.13■□□□□ 0.17
YRF1-8P0CX22 YNL195CYNL195C 786 nt16.12■□□□□ 0.17
YRF1-8P0CX22 ADH7YCR105W 1086 nt16.1■□□□□ 0.17
YRF1-8P0CX22 AIM45YPR004C 1035 nt16.1■□□□□ 0.17
YRF1-8P0CX22 SGT2YOR007C 1041 nt16.08■□□□□ 0.16
YRF1-8P0CX22 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt16.06■□□□□ 0.16
YRF1-8P0CX22 YLR349WYLR349W 507 nt16.05■□□□□ 0.16
YRF1-8P0CX22 ANP1YEL036C 1503 nt16.05■□□□□ 0.16
YRF1-8P0CX22 YBR220CYBR220C 1683 nt16.04■□□□□ 0.16
YRF1-8P0CX22 CRR1YLR213C 1269 nt16.03■□□□□ 0.16
YRF1-8P0CX22 FEN2YCR028C 1539 nt16.02■□□□□ 0.16
YRF1-8P0CX22 PHO89YBR296C 1725 nt16.01■□□□□ 0.15
YRF1-8P0CX22 ERF2YLR246W 1080 nt16■□□□□ 0.15
YRF1-8P0CX22 RET2YFR051C 1641 nt15.99■□□□□ 0.15
YRF1-8P0CX22 CAB5YDR196C 726 nt15.97■□□□□ 0.15
YRF1-8P0CX22 MIC10YCL057C-A 294 nt15.97■□□□□ 0.15
YRF1-8P0CX22 YLR111WYLR111W 333 nt15.96■□□□□ 0.15
YRF1-8P0CX22 YMR226CYMR226C 804 nt15.96■□□□□ 0.15
YRF1-8P0CX22 SHM2YLR058C 1410 nt15.95■□□□□ 0.14
YRF1-8P0CX22 YLR279WYLR279W 390 nt15.94■□□□□ 0.14
YRF1-8P0CX22 PAU15YIR041W 375 nt15.93■□□□□ 0.14
YRF1-8P0CX22 STE4YOR212W 1272 nt15.93■□□□□ 0.14
YRF1-8P0CX22 SDH5YOL071W 489 nt15.9■□□□□ 0.14
YRF1-8P0CX22 YHL050CYHL050C 2094 nt15.88■□□□□ 0.13
YRF1-8P0CX22 NIT1YIL164C 600 nt15.86■□□□□ 0.13
YRF1-8P0CX22 YCR087WYCR087W 516 nt15.85■□□□□ 0.13
YRF1-8P0CX22 YIR016WYIR016W 798 nt15.85■□□□□ 0.13
YRF1-8P0CX22 COQ2YNR041C 1119 nt15.85■□□□□ 0.13
YRF1-8P0CX22 SNG1YGR197C 1644 nt15.84■□□□□ 0.13
YRF1-8P0CX22 XDJ1YLR090W 1380 nt15.79■□□□□ 0.12
YRF1-8P0CX22 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt15.72■□□□□ 0.11
YRF1-8P0CX22 SSA4YER103W 1929 nt15.68■□□□□ 0.1
YRF1-8P0CX22 MRP20YDR405W 792 nt15.65■□□□□ 0.1
YRF1-8P0CX22 HEM12YDR047W 1089 nt15.64■□□□□ 0.1
YRF1-8P0CX22 FUN14YAL008W 597 nt15.6■□□□□ 0.09
YRF1-8P0CX22 RPS14BYJL191W 417 nt15.6■□□□□ 0.09
YRF1-8P0CX22 SFA1YDL168W 1161 nt15.59■□□□□ 0.09
YRF1-8P0CX22 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt15.57■□□□□ 0.08
YRF1-8P0CX22 GPN2YOR262W 1044 nt15.54■□□□□ 0.08
YRF1-8P0CX22 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt15.54■□□□□ 0.08
YRF1-8P0CX22 GDH3YAL062W 1374 nt15.51■□□□□ 0.07
YRF1-8P0CX22 LYS4YDR234W 2082 nt15.48■□□□□ 0.07
YRF1-8P0CX22 RAD23YEL037C 1197 nt15.47■□□□□ 0.07
YRF1-8P0CX22 RPL4BYDR012W 1089 nt15.46■□□□□ 0.07
YRF1-8P0CX22 RPL4AYBR031W 1089 nt15.46■□□□□ 0.07
YRF1-8P0CX22 YGR012WYGR012W 1182 nt15.44■□□□□ 0.06
YRF1-8P0CX22 YJL195CYJL195C 702 nt15.39■□□□□ 0.05
YRF1-8P0CX22 ADH1YOL086C 1047 nt15.39■□□□□ 0.05
YRF1-8P0CX22 PUP1YOR157C 786 nt15.38■□□□□ 0.05
YRF1-8P0CX22 MIC12YBR262C 321 nt15.38■□□□□ 0.05
YRF1-8P0CX22 YGR201CYGR201C 678 nt15.37■□□□□ 0.05
YRF1-8P0CX22 ESS1YJR017C 513 nt15.36■□□□□ 0.05
YRF1-8P0CX22 AVT6YER119C 1347 nt15.35■□□□□ 0.05
YRF1-8P0CX22 SEN2YLR105C 1134 nt15.34■□□□□ 0.05
YRF1-8P0CX22 CPD1YGR247W 720 nt15.31■□□□□ 0.04
YRF1-8P0CX22 BNA2YJR078W 1362 nt15.31■□□□□ 0.04
YRF1-8P0CX22 MSB4YOL112W 1479 nt15.27■□□□□ 0.03
YRF1-8P0CX22 SHH4YLR164W 507 nt15.26■□□□□ 0.03
YRF1-8P0CX22 TSC10YBR265W 963 nt15.26■□□□□ 0.03
YRF1-8P0CX22 NCP1YHR042W 2076 nt15.23■□□□□ 0.03
YRF1-8P0CX22 HHO1YPL127C 777 nt15.21■□□□□ 0.02
YRF1-8P0CX22 PEX2YJL210W 816 nt15.19■□□□□ 0.02
YRF1-8P0CX22 CLB6YGR109C 1143 nt15.18■□□□□ 0.02
YRF1-8P0CX22 NRT1YOR071C 1797 nt15.16■□□□□ 0.02
YRF1-8P0CX22 UTH1YKR042W 1098 nt15.16■□□□□ 0.02
YRF1-8P0CX22 AAC1YMR056C 930 nt15.16■□□□□ 0.02
YRF1-8P0CX22 YEL008WYEL008W 381 nt15.15■□□□□ 0.02
YRF1-8P0CX22 RIB3YDR487C 627 nt15.13■□□□□ 0.01
YRF1-8P0CX22 TOM6YOR045W 186 nt15.13■□□□□ 0.01
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