Protein–RNA interactions for Protein: P09669

COX6C, Cytochrome c oxidase subunit 6C, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6CP09669 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COX6CP09669 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COX6CP09669 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COX6CP09669 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COX6CP09669 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COX6CP09669 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COX6CP09669 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COX6CP09669 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COX6CP09669 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COX6CP09669 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COX6CP09669 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COX6CP09669 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COX6CP09669 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COX6CP09669 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COX6CP09669 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COX6CP09669 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COX6CP09669 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COX6CP09669 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COX6CP09669 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COX6CP09669 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COX6CP09669 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COX6CP09669 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COX6CP09669 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COX6CP09669 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COX6CP09669 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COX6CP09669 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COX6CP09669 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COX6CP09669 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COX6CP09669 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COX6CP09669 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX6CP09669 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX6CP09669 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX6CP09669 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX6CP09669 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX6CP09669 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX6CP09669 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COX6CP09669 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX6CP09669 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COX6CP09669 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX6CP09669 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COX6CP09669 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX6CP09669 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX6CP09669 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX6CP09669 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX6CP09669 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX6CP09669 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX6CP09669 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX6CP09669 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX6CP09669 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
COX6CP09669 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX6CP09669 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX6CP09669 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX6CP09669 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX6CP09669 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COX6CP09669 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COX6CP09669 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX6CP09669 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX6CP09669 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COX6CP09669 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COX6CP09669 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
COX6CP09669 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COX6CP09669 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COX6CP09669 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COX6CP09669 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COX6CP09669 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COX6CP09669 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COX6CP09669 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COX6CP09669 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COX6CP09669 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6CP09669 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6CP09669 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6CP09669 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6CP09669 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6CP09669 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6CP09669 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6CP09669 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6CP09669 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6CP09669 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6CP09669 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6CP09669 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6CP09669 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COX6CP09669 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COX6CP09669 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6CP09669 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6CP09669 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6CP09669 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6CP09669 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6CP09669 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6CP09669 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6CP09669 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6CP09669 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6CP09669 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6CP09669 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6CP09669 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX6CP09669 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX6CP09669 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX6CP09669 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX6CP09669 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX6CP09669 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX6CP09669 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms